250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3212 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3212  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 302 aa  605  9.999999999999999e-173  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.26915  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2138  NUDIX hydrolase  60 
 
 		 310 aa  338  7e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4224  NUDIX hydrolase  58.36 
 
 		 299 aa  330  2e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.5733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1924  NUDIX hydrolase  56.52 
 
 		 311 aa  320  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.804936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1970  NUDIX hydrolase  56.52 
 
 		 311 aa  320  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1904  NUDIX hydrolase  56.19 
 
 		 311 aa  320  3e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2845  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  53.95 
 
 		 315 aa  300  1e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13000  hydrolase mutT1  53.02 
 
 		 317 aa  295  7e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09090  NTP pyrophosphohydrolase  46.84 
 
 		 305 aa  244  9.999999999999999e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1481  NUDIX hydrolase  44.86 
 
 		 301 aa  238  9e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0468902  normal  0.959554 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6003  NUDIX hydrolase  48.56 
 
 		 314 aa  225  7e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.45495  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4051  NUDIX hydrolase  47.12 
 
 		 315 aa  219  3e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4501  NUDIX hydrolase  43.84 
 
 		 322 aa  199  7e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8612  hypothetical protein  42.56 
 
 		 292 aa  196  5.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0260  NUDIX hydrolase  42.36 
 
 		 303 aa  185  9e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8260  NUDIX hydrolase  39.86 
 
 		 303 aa  181  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0324  putative MutT family protein  37.84 
 
 		 325 aa  172  5e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4995  putative phosphohistidine phosphatase SixA  38.26 
 
 		 301 aa  172  5.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1152  NUDIX hydrolase  42.06 
 
 		 296 aa  159  8e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000396101 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1261  NUDIX hydrolase  41.94 
 
 		 289 aa  150  4e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0352792  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03520  ADP-ribose pyrophosphatase  37.74 
 
 		 308 aa  149  7e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.630054 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25640  ADP-ribose pyrophosphatase  37.74 
 
 		 314 aa  147  3e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194053  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4264  NUDIX hydrolase  39.04 
 
 		 286 aa  146  3e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0301  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 		 324 aa  143  4e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.917756  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5221  NUDIX hydrolase  35 
 
 		 333 aa  140  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.239365  normal  0.144046 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17440  ADP-ribose pyrophosphatase  36.12 
 
 		 336 aa  137  2e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303863  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2236  NUDIX hydrolase  34.6 
 
 		 356 aa  134  1.9999999999999998e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.592107  normal  0.569129 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2816  NUDIX hydrolase  34.04 
 
 		 326 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0490383 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2727  NUDIX hydrolase  33.98 
 
 		 322 aa  127  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00813927 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3015  NUDIX hydrolase  33.98 
 
 		 351 aa  126  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.771324  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33510  NTP pyrophosphohydrolase  33.58 
 
 		 343 aa  126  5e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0185046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0876  NUDIX hydrolase  38.58 
 
 		 333 aa  124  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.679959  hitchhiker  0.00511053 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1592  NTP pyrophosphohydrolase for oxidative damage repair  33.59 
 
 		 395 aa  120  3e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.985327  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3427  NUDIX hydrolase  35.96 
 
 		 341 aa  119  4.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0081  hydrolase, NUDIX family  30.45 
 
 		 398 aa  111  2.0000000000000002e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.00000000209436 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3219  NUDIX hydrolase  35.51 
 
 		 149 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3707  NUDIX hydrolase  35.51 
 
 		 150 aa  70.1  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.000000974348 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0755  NUDIX hydrolase  36.79 
 
 		 139 aa  67.8  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.916011  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26900  ADP-ribose pyrophosphatase  39 
 
 		 160 aa  64.3  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5398  NUDIX hydrolase  37.74 
 
 		 151 aa  64.7  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4841  NUDIX hydrolase  36.45 
 
 		 272 aa  63.5  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39610  ADP-ribose pyrophosphatase  35.82 
 
 		 169 aa  62.8  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1191  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 		 211 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4208  NUDIX hydrolase  37.62 
 
 		 174 aa  60.8  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3106  NUDIX hydrolase  36.64 
 
 		 153 aa  60.5  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1237  NUDIX hydrolase  35.04 
 
 		 137 aa  60.8  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23350  ADP-ribose pyrophosphatase  33.8 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6207  putative NUDIX hydrolase  35.54 
 
 		 322 aa  60.1  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1029  NUDIX hydrolase  36.64 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1197  NUDIX hydrolase  32.52 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  31.54 
 
 		 140 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0844  NUDIX hydrolase  35.78 
 
 		 282 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0803503  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6062  NUDIX hydrolase  35.78 
 
 		 268 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107373 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5080  NUDIX hydrolase  37.74 
 
 		 158 aa  57  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.498453  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0612  NUDIX hydrolase  32.35 
 
 		 164 aa  56.6  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000326067  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7080  NUDIX hydrolase  34.58 
 
 		 174 aa  56.2  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2428  NUDIX hydrolase  29.23 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00549514  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0059  hydrolase, NUDIX family  30.95 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0069  NUDIX hydrolase  33.67 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.806669  hitchhiker  0.0000000185063 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0852  Polynucleotide adenylyltransferase region  30.47 
 
 		 577 aa  55.1  0.000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13943  hypothetical protein  36.46 
 
 		 248 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00635151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1448  ADP-ribose pyrophosphatase  31.78 
 
 		 430 aa  55.1  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2202  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  30.08 
 
 		 583 aa  55.1  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5398  NUDIX hydrolase  34.26 
 
 		 270 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1261  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 		 147 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5487  NUDIX hydrolase  34.26 
 
 		 270 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.746959  normal  0.673254 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5774  NUDIX hydrolase  35.42 
 
 		 270 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.528861 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0037  NUDIX hydrolase  30 
 
 		 229 aa  53.9  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1059  NUDIX hydrolase  30.08 
 
 		 195 aa  53.5  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  35.77 
 
 		 140 aa  53.5  0.000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1350  NUDIX hydrolase  30.43 
 
 		 146 aa  53.5  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4158  NUDIX hydrolase  31.62 
 
 		 166 aa  53.1  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1466  NUDIX hydrolase  29.93 
 
 		 237 aa  52.8  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.10731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3925  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 		 182 aa  52.4  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2074  mutT/nudix family protein  34.82 
 
 		 229 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000276659  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4436  NUDIX hydrolase  30.25 
 
 		 180 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2468  NUDIX hydrolase  33.6 
 
 		 172 aa  51.6  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0192019  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  34.15 
 
 		 146 aa  52  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  34.15 
 
 		 139 aa  52  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37900  ADP-ribose pyrophosphatase  35 
 
 		 205 aa  51.6  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.525356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3853  NUDIX hydrolase  31.36 
 
 		 149 aa  50.8  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.785148  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0700  NUDIX hydrolase  39 
 
 		 132 aa  50.8  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2094  mutT/nudix family protein  33.04 
 
 		 153 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000267721  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1999  mutT/nudix family protein  33.04 
 
 		 153 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00120864  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4678  mutT/nudix family protein  31.63 
 
 		 140 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.1477999999999999e-21 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1675  NUDIX hydrolase  32.67 
 
 		 198 aa  50.4  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.366016 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2543  NUDIX hydrolase  35.59 
 
 		 206 aa  50.4  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.339179 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4130  mutT/nudix family protein  31.36 
 
 		 149 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000966346  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3713  NUDIX hydrolase  34 
 
 		 182 aa  50.1  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.639484  normal  0.0437167 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3363  NUDIX hydrolase  32.06 
 
 		 219 aa  49.7  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1860  NUDIX hydrolase  30.36 
 
 		 153 aa  49.7  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00730748  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1417  NUDIX hydrolase  29.03 
 
 		 139 aa  49.7  0.00006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1809  MutT/Nudix family protein  33.04 
 
 		 153 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00380434  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1108  mutT/nudix family protein  31.36 
 
 		 149 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.979518  normal  0.39926 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  30.43 
 
 		 360 aa  49.3  0.00007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3330  mutT/nudix family protein  33.04 
 
 		 153 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000371651  unclonable  1.49498e-25 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1363  hypothetical protein  35.29 
 
 		 184 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.352829  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4857  NUDIX hydrolase  29.06 
 
 		 158 aa  49.3  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0533  MutT/NUDIX family protein  33.67 
 
 		 140 aa  49.3  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0325  NUDIX hydrolase  30.16 
 
 		 138 aa  49.3  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.414078  normal  0.0748688 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>