184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0301 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_0301  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 324 aa  638    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.917756  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33510  NTP pyrophosphohydrolase  62.73 
 
 		 343 aa  369  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0185046  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2816  NUDIX hydrolase  57.68 
 
 		 326 aa  330  2e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0490383 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2236  NUDIX hydrolase  48.44 
 
 		 356 aa  300  2e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.592107  normal  0.569129 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25640  ADP-ribose pyrophosphatase  45.11 
 
 		 314 aa  245  9e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194053  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3427  NUDIX hydrolase  48.81 
 
 		 341 aa  244  1.9999999999999999e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2727  NUDIX hydrolase  43.85 
 
 		 322 aa  226  5.0000000000000005e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00813927 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3015  NUDIX hydrolase  42.72 
 
 		 351 aa  224  1e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.771324  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03520  ADP-ribose pyrophosphatase  41.46 
 
 		 308 aa  213  4.9999999999999996e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.630054 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17440  ADP-ribose pyrophosphatase  41.23 
 
 		 336 aa  196  6e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303863  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0081  hydrolase, NUDIX family  34.31 
 
 		 398 aa  187  2e-46  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.00000000209436 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4264  NUDIX hydrolase  45.16 
 
 		 286 aa  177  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8260  NUDIX hydrolase  40.82 
 
 		 303 aa  175  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1592  NTP pyrophosphohydrolase for oxidative damage repair  33.65 
 
 		 395 aa  170  4e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.985327  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0876  NUDIX hydrolase  36.62 
 
 		 333 aa  147  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.679959  hitchhiker  0.00511053 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0260  NUDIX hydrolase  38.17 
 
 		 303 aa  146  5e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8612  hypothetical protein  36.84 
 
 		 292 aa  143  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3212  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 		 302 aa  143  4e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.26915  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2138  NUDIX hydrolase  37.17 
 
 		 310 aa  139  7.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13000  hydrolase mutT1  35.79 
 
 		 317 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4501  NUDIX hydrolase  38.01 
 
 		 322 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09090  NTP pyrophosphohydrolase  33.55 
 
 		 305 aa  132  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4224  NUDIX hydrolase  33.21 
 
 		 299 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.5733 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1481  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 		 301 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0468902  normal  0.959554 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0324  putative MutT family protein  37.5 
 
 		 325 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1904  NUDIX hydrolase  33.58 
 
 		 311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1924  NUDIX hydrolase  33.58 
 
 		 311 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.804936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1970  NUDIX hydrolase  33.58 
 
 		 311 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4051  NUDIX hydrolase  35.9 
 
 		 315 aa  126  5e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1152  NUDIX hydrolase  41.59 
 
 		 296 aa  125  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000396101 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4995  putative phosphohistidine phosphatase SixA  35.66 
 
 		 301 aa  124  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1261  NUDIX hydrolase  39.53 
 
 		 289 aa  124  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0352792  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6003  NUDIX hydrolase  37.82 
 
 		 314 aa  121  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.45495  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5221  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 		 333 aa  119  7e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.239365  normal  0.144046 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2845  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  32.49 
 
 		 315 aa  118  9.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0755  NUDIX hydrolase  41.13 
 
 		 139 aa  76.6  0.0000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.916011  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3219  NUDIX hydrolase  33.85 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0612  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 164 aa  62.4  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000326067  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0852  Polynucleotide adenylyltransferase region  30.99 
 
 		 577 aa  61.2  0.00000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3428  NUDIX hydrolase  33.53 
 
 		 163 aa  59.7  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0791  NUDIX family hydrolase  30.16 
 
 		 142 aa  58.9  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000502884  hitchhiker  6.80479e-24 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3707  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 		 150 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.000000974348 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2202  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  28.17 
 
 		 583 aa  57.8  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1466  NUDIX hydrolase  34.45 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.10731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0392  NUDIX family hydrolase  31.06 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000292752 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1191  NUDIX hydrolase  36.03 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1007  NUDIX hydrolase  43.82 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.175488  hitchhiker  0.000423095 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1993  NUDIX hydrolase  31.62 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5719  NUDIX hydrolase  35.1 
 
 		 154 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.943651 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1059  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 195 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0237  NUDIX hydrolase  30.95 
 
 		 229 aa  55.5  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.619114 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1111  NUDIX hydrolase  34.11 
 
 		 161 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.508433  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3106  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 153 aa  54.3  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  34.09 
 
 		 146 aa  54.7  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5357  NUDIX hydrolase  34.44 
 
 		 154 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.737057 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2164  NUDIX hydrolase  34.23 
 
 		 143 aa  53.9  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.019865 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1987  NUDIX hydrolase  36.91 
 
 		 155 aa  53.1  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2074  mutT/nudix family protein  44.83 
 
 		 229 aa  52  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000276659  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0496  NUDIX hydrolase  30.37 
 
 		 142 aa  52  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1651  NUDIX hydrolase  30.4 
 
 		 194 aa  52  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  35.59 
 
 		 140 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1991  deoxyribose-phosphate aldolase  42.47 
 
 		 424 aa  51.6  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.306707  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1854  mutT/nudix family protein  44.83 
 
 		 153 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1825  MutT/Nudix family protein  44.83 
 
 		 153 aa  52  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000200422  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2094  mutT/nudix family protein  44.83 
 
 		 153 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000267721  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1809  MutT/Nudix family protein  44.83 
 
 		 153 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00380434  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1997  mutT/nudix family protein  44.83 
 
 		 153 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000428877  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3330  mutT/nudix family protein  44.83 
 
 		 153 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000371651  unclonable  1.49498e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2030  mutT/nudix family protein  44.83 
 
 		 153 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.83484e-43 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1999  mutT/nudix family protein  44.83 
 
 		 153 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00120864  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2635  hypothetical protein  34.59 
 
 		 313 aa  50.4  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  30.23 
 
 		 141 aa  50.8  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2202  NUDIX hydrolase  34.56 
 
 		 143 aa  50.8  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1860  NUDIX hydrolase  44.83 
 
 		 153 aa  50.8  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00730748  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1197  NUDIX hydrolase  41.46 
 
 		 216 aa  50.4  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1155  hypothetical protein  29.51 
 
 		 231 aa  50.1  0.00005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6207  putative NUDIX hydrolase  34.68 
 
 		 322 aa  49.7  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2605  NUDIX hydrolase  28.03 
 
 		 216 aa  49.3  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.700419  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5398  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 		 151 aa  49.3  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4158  NUDIX hydrolase  30.72 
 
 		 166 aa  48.9  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3541  NUDIX hydrolase  45.31 
 
 		 138 aa  48.9  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.527483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1988  NUDIX hydrolase  48.44 
 
 		 164 aa  48.9  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0344946  normal  0.279217 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1608  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 		 137 aa  48.9  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3404  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 174 aa  49.3  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321528  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26900  ADP-ribose pyrophosphatase  30.22 
 
 		 160 aa  48.5  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 140 aa  48.1  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3182  NUDIX hydrolase  34 
 
 		 163 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.565463  normal  0.196576 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1639  NUDIX hydrolase  26.12 
 
 		 136 aa  48.1  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000053664  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3925  NUDIX hydrolase  30.2 
 
 		 182 aa  48.1  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7253  NUDIX hydrolase  32.12 
 
 		 160 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 139 aa  48.1  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0744  NUDIX hydrolase  38.05 
 
 		 186 aa  47.4  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5859  NUDIX hydrolase  31.69 
 
 		 153 aa  47.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.315919  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4857  NUDIX hydrolase  28.24 
 
 		 158 aa  47  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3585  NUDIX hydrolase  33.58 
 
 		 162 aa  46.6  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00428581  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0645  NUDIX hydrolase  35.04 
 
 		 155 aa  46.6  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2125  NUDIX hydrolase  36.56 
 
 		 143 aa  47  0.0005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0927  NUDIX hydrolase  36.05 
 
 		 129 aa  46.6  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.227585 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1810  NUDIX family hydrolase  35.59 
 
 		 160 aa  46.6  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610714  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4224  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 302 aa  46.6  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>