148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1415 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_1415  NUDIX hydrolase  100 
 
 
151 aa  315  2e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1059  NUDIX hydrolase  57.48 
 
 
156 aa  146  1.0000000000000001e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.891979  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2635  hypothetical protein  52.27 
 
 
313 aa  139  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2766  NUDIX hydrolase  50 
 
 
144 aa  134  6.0000000000000005e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  41.35 
 
 
139 aa  62.8  0.000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0905  NUDIX hydrolase  36.29 
 
 
139 aa  60.5  0.000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.729176  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  44.9 
 
 
146 aa  60.1  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1417  NUDIX hydrolase  31.97 
 
 
139 aa  59.7  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2125  NUDIX hydrolase  34.03 
 
 
143 aa  59.7  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  41.35 
 
 
140 aa  58.9  0.00000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2333  NUDIX hydrolase  32.81 
 
 
143 aa  55.8  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2202  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 
583 aa  54.3  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1382  NUDIX hydrolase  30.56 
 
 
144 aa  53.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2758  NUDIX hydrolase  29.17 
 
 
142 aa  52.8  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1993  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 
142 aa  52.4  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0791  NUDIX family hydrolase  30.6 
 
 
142 aa  51.6  0.000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000502884  hitchhiker  6.80479e-24 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0878  NUDIX hydrolase  28.17 
 
 
140 aa  51.2  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3496  NUDIX hydrolase  47.17 
 
 
152 aa  50.8  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1639  NUDIX hydrolase  32.63 
 
 
136 aa  50.1  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000053664  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3070  NUDIX hydrolase  29.86 
 
 
141 aa  50.1  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.973852  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1402  NUDIX hydrolase  27.42 
 
 
148 aa  49.3  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8612  hypothetical protein  45.9 
 
 
292 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0673  NUDIX hydrolase  30.47 
 
 
141 aa  47.8  0.00005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.51908 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0069  NUDIX hydrolase  27.2 
 
 
147 aa  47.4  0.00007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.806669  hitchhiker  0.0000000185063 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0167  ADP-ribose diphosphatase NudE  34.09 
 
 
193 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09090  NTP pyrophosphohydrolase  29.32 
 
 
305 aa  46.6  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197751  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4188  ADP-ribose diphosphatase NudE  34.09 
 
 
183 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2202  NUDIX hydrolase  52.63 
 
 
143 aa  46.6  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4431  NUDIX hydrolase  29.17 
 
 
164 aa  47  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0171  ADP-ribose diphosphatase NudE  34.09 
 
 
183 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0570071 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0138  ADP-ribose diphosphatase NudE  30.86 
 
 
187 aa  46.2  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2356  NUDIX hydrolase  32.76 
 
 
134 aa  45.4  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3272  dinucleoside polyphosphate hydrolase  28.57 
 
 
176 aa  45.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000105899  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2380  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 
169 aa  45.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0156  ADP-ribose diphosphatase NudE  31.82 
 
 
184 aa  45.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00016487  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3399  dinucleoside polyphosphate hydrolase  28.57 
 
 
178 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000267349  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3427  NUDIX hydrolase  33.88 
 
 
341 aa  45.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5719  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 
154 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.943651 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2150  NUDIX family hydrolase  38.33 
 
 
184 aa  45.1  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.290696  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0392  NUDIX family hydrolase  28.03 
 
 
149 aa  45.1  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000292752 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4995  putative phosphohistidine phosphatase SixA  46 
 
 
301 aa  45.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1921  NUDIX hydrolase  29.23 
 
 
201 aa  44.7  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.137486 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5357  NUDIX hydrolase  36.51 
 
 
154 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.737057 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0037  NUDIX hydrolase  40.32 
 
 
229 aa  44.3  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0449  dinucleoside polyphosphate hydrolase  34 
 
 
187 aa  44.3  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0852291  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1862  MutT/NUDIX family hydrolase  38.98 
 
 
184 aa  44.3  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.168292  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2044  NUDIX hydrolase  41.27 
 
 
160 aa  44.3  0.0006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3198  dinucleoside polyphosphate hydrolase  28.57 
 
 
175 aa  44.3  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00084868  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0852  Polynucleotide adenylyltransferase region  28.23 
 
 
577 aa  44.3  0.0006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0969  NUDIX hydrolase  28.33 
 
 
158 aa  44.3  0.0007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.767014  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00613  ADP-ribose diphosphatase NudE  33.71 
 
 
188 aa  44.3  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05490  ADP-ribose diphosphatase NudE  30 
 
 
188 aa  43.9  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00271926  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1111  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
161 aa  43.9  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.508433  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4718  ADP-ribose diphosphatase NudE  31.82 
 
 
181 aa  43.9  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3017  dinucleoside polyphosphate hydrolase  28.57 
 
 
175 aa  43.5  0.0009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000442704  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2816  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 
326 aa  43.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0490383 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3219  NUDIX hydrolase  29.45 
 
 
149 aa  43.5  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223702  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4346  ADP-ribose diphosphatase NudE  31.82 
 
 
181 aa  43.5  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.143313  normal  0.376431 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1608  NUDIX hydrolase  61.54 
 
 
137 aa  43.5  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1754  NUDIX hydrolase  30.53 
 
 
175 aa  43.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3659  hypothetical protein  47.62 
 
 
316 aa  43.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817347  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03971  ADP-ribose diphosphatase NudE  30 
 
 
187 aa  43.5  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.222226  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2302  ADP-ribose diphosphatase NudE  29.89 
 
 
186 aa  42.7  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2275  ADP-ribose diphosphatase NudE  29.89 
 
 
186 aa  42.7  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0232  hypothetical protein  32.71 
 
 
185 aa  42.4  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.714493 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2233  NUDIX hydrolase  34.04 
 
 
199 aa  42.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0117  ADP-ribose diphosphatase NudE  36.99 
 
 
195 aa  42.4  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1991  deoxyribose-phosphate aldolase  45.45 
 
 
424 aa  42.4  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.306707  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0183  ADP-ribose diphosphatase NudE  37.08 
 
 
183 aa  42.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.572666 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2059  ADP-ribose diphosphatase NudE  37.1 
 
 
196 aa  42.4  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0069  NUDIX hydrolase  43.64 
 
 
221 aa  42.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.509046 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0904  dinucleoside polyphosphate hydrolase  27.78 
 
 
177 aa  42.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000367518  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0393  ADP-ribose diphosphatase NudE  27.5 
 
 
188 aa  42.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2605  NUDIX hydrolase  56.25 
 
 
216 aa  42.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.700419  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0237  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
229 aa  42.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.619114 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4976  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
197 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1155  hypothetical protein  47.37 
 
 
231 aa  42.4  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0260  ADP-ribose diphosphatase NudE  30 
 
 
188 aa  42  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0135852 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7080  NUDIX hydrolase  40 
 
 
174 aa  41.6  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003180  MutT/nudix family protein  43.4 
 
 
96 aa  42  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0169  ADP-ribose diphosphatase NudE  32.58 
 
 
183 aa  41.6  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0169  ADP-ribose diphosphatase NudE  32.58 
 
 
183 aa  41.6  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00239764  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0275  ADP-ribose diphosphatase NudE  30 
 
 
188 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3773  NUDIX hydrolase  34.94 
 
 
161 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000523575 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4563  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 
166 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1221  NUDIX hydrolase  39.66 
 
 
221 aa  42  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365989  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1651  NUDIX hydrolase  43.9 
 
 
194 aa  41.6  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0285  ADP-ribose diphosphatase NudE  30 
 
 
188 aa  42  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2455  NUDIX hydrolase  36.92 
 
 
162 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.490004  normal  0.610267 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001880  ADP compounds hydrolase NudE  34.83 
 
 
189 aa  42  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4950  ADP-ribose diphosphatase NudE  30 
 
 
188 aa  42  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.247052  hitchhiker  0.0000179344 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3232  dinucleoside polyphosphate hydrolase  28.43 
 
 
176 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000155637  hitchhiker  0.0000853193 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3217  dinucleoside polyphosphate hydrolase  28.43 
 
 
176 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000360016  hitchhiker  0.00252549 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3168  dinucleoside polyphosphate hydrolase  28.43 
 
 
176 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000367916  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3151  dinucleoside polyphosphate hydrolase  28.43 
 
 
176 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000021359  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3331  dinucleoside polyphosphate hydrolase  28.43 
 
 
176 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000146788  hitchhiker  0.005493 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7955  hypothetical protein  35.11 
 
 
172 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0058  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 
183 aa  41.6  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.993982  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0981  dinucleoside polyphosphate hydrolase  29.41 
 
 
175 aa  41.6  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  3.12815e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4226  NUDIX hydrolase  54.76 
 
 
162 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>