More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0727 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_0727  NUDIX/MutT family protein  100 
 
 
150 aa  309  7.999999999999999e-84  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.371838  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0996  NUDIX hydrolase  68.94 
 
 
133 aa  190  6e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1227  NUDIX hydrolase  69.4 
 
 
185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.756044  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1303  NUDIX hydrolase  62.31 
 
 
140 aa  162  2.0000000000000002e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1522  NUDIX hydrolase  55.15 
 
 
137 aa  160  4.0000000000000004e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.241436  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03600  probable 8-oxo-dGTPase, MutT-like protein, NUDIX hydrolase family protein  33.33 
 
 
137 aa  72.4  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3170  NUDIX hydrolase  31.36 
 
 
179 aa  71.6  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0258  MutT/Nudix family protein  34.19 
 
 
137 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0154  mutT/nudix family protein  38.02 
 
 
147 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0207  NUDIX hydrolase  32.28 
 
 
147 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000107343 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1416  NUDIX hydrolase  35.94 
 
 
163 aa  67  0.00000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1340  NUDIX hydrolase  31.03 
 
 
171 aa  66.2  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.902443 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0613  NUDIX hydrolase  31.48 
 
 
171 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1335  NUDIX hydrolase  30 
 
 
171 aa  65.1  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0700  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
132 aa  64.3  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2076  NUDIX hydrolase  32.74 
 
 
141 aa  63.9  0.0000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0214  NUDIX hydrolase  30.16 
 
 
137 aa  63.9  0.0000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.73961  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7395  NUDIX hydrolase  42.47 
 
 
260 aa  62.8  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.23438  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6368  NUDIX hydrolase  29.1 
 
 
229 aa  62.4  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03438  MutT-nudix family protein  35.65 
 
 
149 aa  62  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3746  NUDIX hydrolase  37.63 
 
 
142 aa  62  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3147  NUDIX hydrolase  39.18 
 
 
144 aa  62  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.232456  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1183  NUDIX hydrolase  34.82 
 
 
130 aa  61.2  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3639  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 
142 aa  60.8  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1251  NUDIX hydrolase  33.93 
 
 
140 aa  60.5  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00542238  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1757  NUDIX hydrolase  37.89 
 
 
144 aa  60.5  0.000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207601  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  32.2 
 
 
137 aa  60.1  0.000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1479  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 
135 aa  59.7  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142432  hitchhiker  0.00620383 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0833  NUDIX hydrolase  36.61 
 
 
155 aa  60.1  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2643  NUDIX hydrolase  35.43 
 
 
149 aa  58.9  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1163  NUDIX hydrolase  35.4 
 
 
140 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  31.5 
 
 
236 aa  58.5  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2705  mutT/nudix family protein  33.63 
 
 
147 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2459  MutT/Nudix family protein  34.19 
 
 
147 aa  57.8  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000023854  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2651  NUDIX hydrolase  33.9 
 
 
150 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000859831 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1565  NUDIX hydrolase  33.9 
 
 
150 aa  58.2  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000493599  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1123  NUDIX hydrolase  33.93 
 
 
140 aa  57.8  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.824308  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0750  NUDIX hydrolase  31.9 
 
 
212 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1979  MutT/nudix family protein  26.32 
 
 
237 aa  57.8  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2457  NUDIX hydrolase  34.48 
 
 
147 aa  57.8  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0350138  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0145  NUDIX hydrolase  30.91 
 
 
252 aa  57.4  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.658574  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2605  mutT/nudix family protein  32.74 
 
 
147 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000292929 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2698  mutT/nudix family protein  34.19 
 
 
147 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000763334 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0380  NUDIX hydrolase  30.69 
 
 
199 aa  57.4  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000301987  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2749  mutT/nudix family protein  34.19 
 
 
147 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000217381  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1206  NUDIX hydrolase  39.17 
 
 
154 aa  57.4  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.483034 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1829  NUDIX hydrolase  37.93 
 
 
150 aa  57  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000906254  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2195  NUDIX hydrolase  29.66 
 
 
139 aa  57  0.00000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0407249  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0105  NUDIX hydrolase  33.62 
 
 
154 aa  56.2  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2429  MutT/Nudix family protein  34.21 
 
 
147 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0417987  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5598  NUDIX hydrolase  32.31 
 
 
165 aa  56.6  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3967  MutT/nudix family protein  31.03 
 
 
146 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.447658  normal  0.0696331 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2498  mutT/nudix family protein  34.21 
 
 
147 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000463679  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2683  mutT/nudix family protein  34.21 
 
 
147 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0387  NUDIX hydrolase  30 
 
 
252 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.231232 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0357  ADP-ribose pyrophosphatase  31.78 
 
 
136 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  30.7 
 
 
139 aa  55.1  0.0000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0305  NUDIX hydrolase  31.93 
 
 
239 aa  55.1  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1043  NUDIX hydrolase  29.92 
 
 
229 aa  54.7  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.541609  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2719  mutT/nudix family protein  30.41 
 
 
147 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00471958  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1935  NUDIX hydrolase  36.72 
 
 
142 aa  55.1  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0094  NUDIX hydrolase  33.07 
 
 
170 aa  54.7  0.0000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.126747  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0547  MutT/NUDIX family protein  31.78 
 
 
136 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0371  ADP-ribose pyrophosphatase  31.78 
 
 
136 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4127  NUDIX hydrolase  33.04 
 
 
167 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0317777  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1662  MutT/Nudix family protein  34.94 
 
 
161 aa  54.3  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.824241  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4290  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 
240 aa  54.7  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00680151  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2328  NUDIX hydrolase  24.81 
 
 
237 aa  54.7  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2015  mutT/nudix family protein  36.44 
 
 
150 aa  54.3  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0857519  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1826  phosphohydrolase  31.37 
 
 
161 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1730  NUDIX hydrolase  33 
 
 
137 aa  53.5  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3516  phosphohydrolase  31.37 
 
 
145 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36667  predicted protein  42.65 
 
 
185 aa  53.5  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.179207 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2566  NUDIX hydrolase  34.4 
 
 
251 aa  53.5  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000361944 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0900  NUDIX hydrolase  31.97 
 
 
145 aa  52.8  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1319  NUDIX hydrolase  30 
 
 
143 aa  52.8  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  29.46 
 
 
473 aa  53.1  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  29.55 
 
 
136 aa  53.1  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05360  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  30.5 
 
 
345 aa  52.4  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.623868  normal  0.0249588 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1681  mutT/nudix family protein  34.94 
 
 
144 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000627508  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4133  NUDIX hydrolase  30.51 
 
 
226 aa  52.8  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.877658  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1680  NUDIX hydrolase  30.39 
 
 
161 aa  52.8  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0812  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
166 aa  52.4  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.64339  normal  0.9117 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1617  NUDIX hydrolase  31.3 
 
 
132 aa  52.4  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000267139  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1816  mutT/nudix family protein  34.94 
 
 
144 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000181059  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5104  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  30.28 
 
 
345 aa  52.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180722  normal  0.842074 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1603  NUDIX hydrolase  34.82 
 
 
157 aa  52.4  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0283951  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4031  NUDIX hydrolase  30.33 
 
 
286 aa  52.4  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1556  NUDIX hydrolase  30.23 
 
 
206 aa  52.8  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0883  NUDIX hydrolase  34.19 
 
 
151 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1861  mutT/nudix family protein  34.94 
 
 
161 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01503e-50 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2458  NUDIX hydrolase  40.82 
 
 
138 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8400  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  32.14 
 
 
139 aa  51.6  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.24066 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  49.15 
 
 
143 aa  51.6  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2429  mutT like protein  31.25 
 
 
134 aa  52  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2421  NUDIX hydrolase  26.81 
 
 
233 aa  52  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1851  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  35.24 
 
 
362 aa  51.6  0.000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000289338 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 
136 aa  52  0.000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1456  MutT/nudix family protein  26.87 
 
 
154 aa  52  0.000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000100507  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0154  NUDIX hydrolase  29.93 
 
 
238 aa  51.6  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>