183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0154 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0154  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 238 aa  491  9.999999999999999e-139  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0910  ADP-ribose pyrophosphatase  49.79 
 
 		 245 aa  212  3.9999999999999995e-54  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0799533  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3138  NUDIX hydrolase  32.56 
 
 		 284 aa  123  3e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4133  NUDIX hydrolase  29.52 
 
 		 226 aa  105  5e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.877658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0465  MutT/nudix family protein  29.28 
 
 		 250 aa  104  1e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000231456  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0073  NUDIX hydrolase  31.17 
 
 		 225 aa  104  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6653  NUDIX hydrolase  28.63 
 
 		 320 aa  103  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0306  NUDIX hydrolase  31.75 
 
 		 229 aa  99.4  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0416  NUDIX hydrolase  28.45 
 
 		 248 aa  99  6e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.255791  normal  0.0628486 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0745  NUDIX hydrolase  32.04 
 
 		 219 aa  98.2  9e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1347  NUDIX hydrolase  30.33 
 
 		 269 aa  97.8  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244652 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0269  NUDIX hydrolase  30 
 
 		 233 aa  95.9  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2843  NUDIX hydrolase  29.41 
 
 		 267 aa  95.5  6e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0269  NUDIX hydrolase  30 
 
 		 233 aa  95.5  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3218  NUDIX hydrolase  30.17 
 
 		 251 aa  94.4  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5745  NUDIX hydrolase  27.51 
 
 		 231 aa  93.6  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01970  ADP-ribose pyrophosphatase  28.7 
 
 		 232 aa  94.4  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0387  NUDIX hydrolase  27.83 
 
 		 252 aa  93.6  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.231232 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2238  NUDIX hydrolase  28.26 
 
 		 251 aa  93.6  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2298  NUDIX hydrolase  31.65 
 
 		 236 aa  93.2  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000778987 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0145  NUDIX hydrolase  28.7 
 
 		 252 aa  93.6  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.658574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6368  NUDIX hydrolase  27.27 
 
 		 229 aa  93.2  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4290  NUDIX hydrolase  27.78 
 
 		 240 aa  92.4  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00680151  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1043  NUDIX hydrolase  27.5 
 
 		 229 aa  92.4  6e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.541609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2561  NUDIX hydrolase  30.83 
 
 		 236 aa  91.7  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.233284  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5657  NUDIX hydrolase  28.04 
 
 		 248 aa  91.3  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0305  NUDIX hydrolase  30.3 
 
 		 239 aa  91.3  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3138  NUDIX hydrolase  30.81 
 
 		 273 aa  90.1  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0461727  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2119  NUDIX hydrolase  29.85 
 
 		 229 aa  89.4  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.461945 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0291  NUDIX hydrolase  28.03 
 
 		 244 aa  87.8  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.78148 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0756  NUDIX hydrolase  30.48 
 
 		 230 aa  87  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229185  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0351  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 		 255 aa  84.7  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.248655  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7395  NUDIX hydrolase  26.52 
 
 		 260 aa  84.7  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.23438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1099  NUDIX hydrolase  29.72 
 
 		 249 aa  84.7  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0602  NUDIX hydrolase  30.33 
 
 		 228 aa  84.3  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0320  NUDIX hydrolase  28.85 
 
 		 202 aa  84  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0695  NUDIX hydrolase  28.99 
 
 		 248 aa  84  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7559  NUDIX hydrolase  27.54 
 
 		 237 aa  84  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03740  ADP-ribose pyrophosphatase  28.88 
 
 		 228 aa  84  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0297346  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2566  NUDIX hydrolase  28.31 
 
 		 251 aa  83.6  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000361944 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3126  NUDIX hydrolase  23.9 
 
 		 303 aa  82.8  0.000000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.573169  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3556  NUDIX hydrolase  28.14 
 
 		 249 aa  82.4  0.000000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0681296  normal  0.23927 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3292  NUDIX hydrolase  30.69 
 
 		 229 aa  82  0.000000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.238683 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0783  NUDIX hydrolase  26.99 
 
 		 238 aa  81.6  0.000000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2862  NUDIX hydrolase  33.58 
 
 		 186 aa  81.3  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.200319  hitchhiker  0.00911064 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2728  NUDIX hydrolase  28.88 
 
 		 236 aa  81.3  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.147262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0379  NUDIX hydrolase  28.71 
 
 		 221 aa  80.9  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0836  NUDIX hydrolase  28.78 
 
 		 263 aa  80.9  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.550059  normal  0.10397 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2421  NUDIX hydrolase  28.24 
 
 		 233 aa  80.5  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4370  NUDIX hydrolase  28.77 
 
 		 246 aa  80.5  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0189  NUDIX hydrolase  27.23 
 
 		 223 aa  80.5  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3620  NUDIX hydrolase  26.85 
 
 		 234 aa  79  0.00000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0652578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8962  hydrolase, NUDIX family  30.54 
 
 		 244 aa  78.6  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4824  NUDIX hydrolase  26.61 
 
 		 662 aa  78.6  0.00000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0491634 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0240  ADP-ribose pyrophosphatase  31.16 
 
 		 275 aa  78.2  0.0000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0563851  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2506  acetohydroxy acid isomeroreductase  27.59 
 
 		 245 aa  78.2  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0206114  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15670  hypothetical protein  27.47 
 
 		 244 aa  78.2  0.0000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.238037  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2060  NUDIX hydrolase  26.32 
 
 		 242 aa  77.8  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4031  NUDIX hydrolase  27.14 
 
 		 286 aa  77.4  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2777  NUDIX hydrolase  28.82 
 
 		 251 aa  75.9  0.0000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.102505 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1117  NUDIX hydrolase  26.53 
 
 		 229 aa  75.5  0.0000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6951  NUDIX hydrolase  25.74 
 
 		 231 aa  75.5  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.720155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1510  NUDIX hydrolase  27.83 
 
 		 225 aa  74.3  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00116155  normal  0.680564 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4337  NUDIX hydrolase  27.46 
 
 		 259 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.953941  normal  0.291795 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0165  NUDIX hydrolase  26.79 
 
 		 219 aa  74.7  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27477  normal  0.587947 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3069  NUDIX hydrolase  25.94 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.41651  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3129  NUDIX hydrolase  25.94 
 
 		 232 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.815886 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3086  NUDIX hydrolase  25.94 
 
 		 232 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.195483 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11609  hypothetical protein  25.82 
 
 		 236 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.706015  normal  0.421109 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3969  NUDIX hydrolase  27.05 
 
 		 255 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00994363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10820  ADP-ribose pyrophosphatase  29.3 
 
 		 240 aa  73.6  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.508627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2797  NUDIX hydrolase  26.17 
 
 		 234 aa  73.2  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.507012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0350  NUDIX hydrolase  28.42 
 
 		 233 aa  72  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0784  NUDIX hydrolase  26.11 
 
 		 245 aa  71.6  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.793093  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3167  NUDIX hydrolase  26.79 
 
 		 243 aa  70.9  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00016749  hitchhiker  0.000047705 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1240  NUDIX hydrolase  24.14 
 
 		 233 aa  68.6  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.538948  normal  0.136467 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5731  NUDIX hydrolase  27.57 
 
 		 229 aa  68.2  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0861  NUDIX hydrolase  26.76 
 
 		 231 aa  67.4  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.314952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3993  NUDIX hydrolase  25.85 
 
 		 234 aa  66.6  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0629305  normal  0.556995 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2968  NUDIX hydrolase  27.41 
 
 		 253 aa  65.5  0.0000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.802476  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0345  NUDIX hydrolase  29 
 
 		 252 aa  65.1  0.0000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0244735  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0576  hypothetical protein  24.64 
 
 		 243 aa  65.1  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03600  probable 8-oxo-dGTPase, MutT-like protein, NUDIX hydrolase family protein  27.97 
 
 		 137 aa  64.7  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5757  NUDIX hydrolase  29.8 
 
 		 244 aa  64.7  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000165623  hitchhiker  0.000000000000529868 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6281  NUDIX hydrolase  26.18 
 
 		 244 aa  63.9  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000760196  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3721  NUDIX hydrolase  31.34 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000111164  decreased coverage  0.00513627 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5114  NUDIX hydrolase  25.5 
 
 		 237 aa  62.8  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.32433 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3715  NUDIX hydrolase  26.36 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.619074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5160  NUDIX hydrolase  27.52 
 
 		 243 aa  62.4  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4449  NUDIX hydrolase  26.97 
 
 		 255 aa  62.4  0.000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.413572 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2399  NUDIX hydrolase  23.15 
 
 		 234 aa  62  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0395  NUDIX hydrolase  27.01 
 
 		 243 aa  62  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0994316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3729  NUDIX hydrolase  27.59 
 
 		 242 aa  61.2  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64930  hypothetical protein  27.43 
 
 		 231 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5642  hypothetical protein  26.99 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05360  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  30.84 
 
 		 345 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.623868  normal  0.0249588 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4986  hypothetical protein  28 
 
 		 350 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.353887  normal  0.14096 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4936  hypothetical protein  28.8 
 
 		 368 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.27766  normal  0.436993 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5104  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  29.91 
 
 		 345 aa  60.1  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180722  normal  0.842074 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1184  putative nicotinic acid mononucleotide (NMN) biosynthesis protein  33.33 
 
 		 324 aa  60.1  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>