148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1184 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_1184  putative nicotinic acid mononucleotide (NMN) biosynthesis protein  100 
 
 
324 aa  655    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2423  hypothetical protein  65.71 
 
 
325 aa  391  1e-108  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0685019 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2818  hypothetical protein  65.2 
 
 
316 aa  388  1e-107  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4758  hypothetical protein  63.46 
 
 
319 aa  388  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195647  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6032  hypothetical protein  65.92 
 
 
309 aa  388  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.607713 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0294  hypothetical protein  62.42 
 
 
323 aa  388  1e-107  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.199627 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3495  hypothetical protein  65.05 
 
 
328 aa  383  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.239397 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2214  hypothetical protein  65.66 
 
 
317 aa  378  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263003  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7187  hypothetical protein  66.78 
 
 
298 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0239386 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1540  hypothetical protein  60.88 
 
 
344 aa  365  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.906535 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0428  hypothetical protein  62.42 
 
 
316 aa  361  1e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2558  hypothetical protein  66.78 
 
 
296 aa  356  1.9999999999999998e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.946779  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1430  hypothetical protein  57.86 
 
 
300 aa  311  1e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4986  hypothetical protein  52.73 
 
 
350 aa  299  5e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.353887  normal  0.14096 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4472  hypothetical protein  51.6 
 
 
366 aa  294  1e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.859238  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4936  hypothetical protein  51.6 
 
 
368 aa  293  2e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.27766  normal  0.436993 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0167  hypothetical protein  52.26 
 
 
319 aa  292  7e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0123154  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1540  hypothetical protein  55.56 
 
 
298 aa  291  1e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.492228  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1960  hypothetical protein  49.22 
 
 
331 aa  285  5e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.575104  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0736  hypothetical protein  47.77 
 
 
351 aa  283  2.0000000000000002e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4592  hypothetical protein  54.28 
 
 
317 aa  278  9e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0563961 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4335  hypothetical protein  49.53 
 
 
325 aa  277  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.229695 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0633  hypothetical protein  42.29 
 
 
364 aa  273  3e-72  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2899  hypothetical protein  49.39 
 
 
335 aa  270  2e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.553205  normal  0.0261035 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1112  hypothetical protein  49.68 
 
 
335 aa  267  1e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0529668  normal  0.319534 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1233  hypothetical protein  50.32 
 
 
326 aa  267  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0601  hypothetical protein  41.83 
 
 
363 aa  266  4e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.777299 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1251  hypothetical protein  48.29 
 
 
331 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.275443  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23180  hypothetical protein  48.33 
 
 
320 aa  251  1e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0703  hypothetical protein  47.78 
 
 
322 aa  250  3e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.703298  normal  0.693956 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1963  hypothetical protein  41.47 
 
 
380 aa  249  5e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0795  hypothetical protein  48.5 
 
 
322 aa  249  6e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00728641 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2601  hypothetical protein  48.12 
 
 
335 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3138  NUDIX hydrolase  29.81 
 
 
284 aa  92.8  7e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3126  NUDIX hydrolase  28.24 
 
 
303 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.573169  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0145  NUDIX hydrolase  46.59 
 
 
252 aa  82.4  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.658574  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4290  NUDIX hydrolase  41.49 
 
 
240 aa  79.3  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00680151  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0387  NUDIX hydrolase  44.32 
 
 
252 aa  79  0.00000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.231232 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5745  NUDIX hydrolase  45.78 
 
 
231 aa  78.2  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0240  ADP-ribose pyrophosphatase  33.51 
 
 
275 aa  77.4  0.0000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0563851  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2843  NUDIX hydrolase  42.57 
 
 
267 aa  75.5  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6368  NUDIX hydrolase  40 
 
 
229 aa  74.3  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0379  NUDIX hydrolase  44.32 
 
 
221 aa  73.2  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4337  NUDIX hydrolase  43.3 
 
 
259 aa  72.4  0.000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.953941  normal  0.291795 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3969  NUDIX hydrolase  43.3 
 
 
255 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00994363  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0305  NUDIX hydrolase  40.91 
 
 
239 aa  72  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2506  acetohydroxy acid isomeroreductase  38.78 
 
 
245 aa  71.6  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0206114  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7395  NUDIX hydrolase  44.58 
 
 
260 aa  70.9  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.23438  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2119  NUDIX hydrolase  39.76 
 
 
229 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.461945 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6653  NUDIX hydrolase  43.9 
 
 
320 aa  69.7  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4449  NUDIX hydrolase  46.43 
 
 
255 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.413572 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5160  NUDIX hydrolase  45.78 
 
 
243 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0345  NUDIX hydrolase  49.28 
 
 
252 aa  68.2  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0244735  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1043  NUDIX hydrolase  39.56 
 
 
229 aa  67  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.541609  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2238  NUDIX hydrolase  37.9 
 
 
251 aa  66.6  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0395  NUDIX hydrolase  42.7 
 
 
243 aa  66.2  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0994316  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0576  hypothetical protein  38.95 
 
 
243 aa  65.9  0.0000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3729  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 
242 aa  65.9  0.0000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0165  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 
219 aa  65.9  0.0000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27477  normal  0.587947 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0320  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 
202 aa  65.9  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0745  NUDIX hydrolase  36.05 
 
 
219 aa  65.5  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0306  NUDIX hydrolase  40.96 
 
 
229 aa  65.5  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6281  NUDIX hydrolase  42.71 
 
 
244 aa  65.9  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000760196  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0836  NUDIX hydrolase  36.47 
 
 
263 aa  65.1  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.550059  normal  0.10397 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4133  NUDIX hydrolase  37.93 
 
 
226 aa  64.7  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.877658  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3218  NUDIX hydrolase  32.54 
 
 
251 aa  64.3  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15670  hypothetical protein  41.86 
 
 
244 aa  64.7  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.238037  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0756  NUDIX hydrolase  33.68 
 
 
230 aa  63.9  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229185  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0783  NUDIX hydrolase  37.21 
 
 
238 aa  63.9  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0416  NUDIX hydrolase  39.29 
 
 
248 aa  63.9  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.255791  normal  0.0628486 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0269  NUDIX hydrolase  39.29 
 
 
233 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0269  NUDIX hydrolase  39.29 
 
 
233 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3292  NUDIX hydrolase  36.78 
 
 
229 aa  63.2  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.238683 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2421  NUDIX hydrolase  36.25 
 
 
233 aa  62.8  0.000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1347  NUDIX hydrolase  40.91 
 
 
269 aa  62.4  0.000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000244652 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0189  NUDIX hydrolase  39.76 
 
 
223 aa  62.4  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1099  NUDIX hydrolase  37.35 
 
 
249 aa  62  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0291  NUDIX hydrolase  38.2 
 
 
244 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.78148 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1510  NUDIX hydrolase  41.86 
 
 
225 aa  61.2  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00116155  normal  0.680564 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1117  NUDIX hydrolase  32.04 
 
 
229 aa  61.6  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6951  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
231 aa  61.6  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.720155  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2777  NUDIX hydrolase  36.14 
 
 
251 aa  60.8  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.102505 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2561  NUDIX hydrolase  37.35 
 
 
236 aa  60.5  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.233284  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0784  NUDIX hydrolase  36.05 
 
 
245 aa  60.5  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.793093  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0073  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 
225 aa  60.1  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3167  NUDIX hydrolase  37.65 
 
 
243 aa  60.1  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00016749  hitchhiker  0.000047705 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0154  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
238 aa  60.1  0.00000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1101  NUDIX hydrolase  44.05 
 
 
229 aa  59.3  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1240  NUDIX hydrolase  34.48 
 
 
233 aa  58.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.538948  normal  0.136467 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0850  NUDIX hydrolase  41.46 
 
 
217 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.491635  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2298  NUDIX hydrolase  36.14 
 
 
236 aa  57.8  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000778987 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2566  NUDIX hydrolase  41.3 
 
 
251 aa  58.2  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000361944 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10820  ADP-ribose pyrophosphatase  36.78 
 
 
240 aa  57.8  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.508627  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5113  hypothetical protein  35.42 
 
 
252 aa  57.4  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.424596 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01970  ADP-ribose pyrophosphatase  35.63 
 
 
232 aa  57.4  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7553  hypothetical protein  37.35 
 
 
219 aa  56.6  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.805753  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4031  NUDIX hydrolase  37.37 
 
 
286 aa  56.6  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0602  NUDIX hydrolase  32.94 
 
 
228 aa  56.6  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0695  NUDIX hydrolase  39.51 
 
 
248 aa  56.2  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03740  ADP-ribose pyrophosphatase  29.53 
 
 
228 aa  56.2  0.0000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0297346  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>