146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1540 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1540  hypothetical protein  100 
 
 		 344 aa  697    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.906535 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0294  hypothetical protein  63.06 
 
 		 323 aa  375  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.199627 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4758  hypothetical protein  61.54 
 
 		 319 aa  365  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195647  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1184  putative nicotinic acid mononucleotide (NMN) biosynthesis protein  60.88 
 
 		 324 aa  365  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2423  hypothetical protein  62.11 
 
 		 325 aa  364  1e-99  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0685019 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2214  hypothetical protein  63.55 
 
 		 317 aa  358  6e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263003  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3495  hypothetical protein  61.32 
 
 		 328 aa  357  9.999999999999999e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.239397 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6032  hypothetical protein  64.88 
 
 		 309 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.607713 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7187  hypothetical protein  65.22 
 
 		 298 aa  351  1e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0239386 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2818  hypothetical protein  62.54 
 
 		 316 aa  350  2e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2558  hypothetical protein  62.75 
 
 		 296 aa  347  2e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.946779  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0428  hypothetical protein  61.04 
 
 		 316 aa  345  7e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1430  hypothetical protein  58.14 
 
 		 300 aa  320  1.9999999999999998e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1540  hypothetical protein  59.09 
 
 		 298 aa  318  6e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.492228  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4986  hypothetical protein  55.91 
 
 		 350 aa  315  5e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.353887  normal  0.14096 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4936  hypothetical protein  56.09 
 
 		 368 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.27766  normal  0.436993 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4472  hypothetical protein  56.09 
 
 		 366 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.859238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1960  hypothetical protein  55.92 
 
 		 331 aa  306  3e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.575104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0167  hypothetical protein  55.15 
 
 		 319 aa  295  1e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0123154  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1233  hypothetical protein  53.7 
 
 		 326 aa  293  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0633  hypothetical protein  45.56 
 
 		 364 aa  292  6e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0601  hypothetical protein  45.69 
 
 		 363 aa  292  7e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.777299 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1112  hypothetical protein  53.04 
 
 		 335 aa  291  1e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0529668  normal  0.319534 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4592  hypothetical protein  53.23 
 
 		 317 aa  289  4e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0563961 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4335  hypothetical protein  52.7 
 
 		 325 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.229695 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1251  hypothetical protein  51.86 
 
 		 331 aa  288  1e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.275443  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0736  hypothetical protein  50 
 
 		 351 aa  283  4.0000000000000003e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2899  hypothetical protein  50.3 
 
 		 335 aa  283  4.0000000000000003e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.553205  normal  0.0261035 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0703  hypothetical protein  53.59 
 
 		 322 aa  281  1e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.703298  normal  0.693956 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1963  hypothetical protein  46.02 
 
 		 380 aa  269  4e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0795  hypothetical protein  50 
 
 		 322 aa  267  2e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00728641 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23180  hypothetical protein  48.66 
 
 		 320 aa  252  6e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2601  hypothetical protein  48.56 
 
 		 335 aa  250  3e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3138  NUDIX hydrolase  29.34 
 
 		 284 aa  99.8  7e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3126  NUDIX hydrolase  28.8 
 
 		 303 aa  93.6  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.573169  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0145  NUDIX hydrolase  48.84 
 
 		 252 aa  82.8  0.000000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.658574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4290  NUDIX hydrolase  43.01 
 
 		 240 aa  80.5  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00680151  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6368  NUDIX hydrolase  42.53 
 
 		 229 aa  80.1  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0387  NUDIX hydrolase  46.51 
 
 		 252 aa  79.7  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.231232 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5745  NUDIX hydrolase  43.68 
 
 		 231 aa  79.7  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2119  NUDIX hydrolase  41.38 
 
 		 229 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.461945 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4449  NUDIX hydrolase  45.65 
 
 		 255 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.413572 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2843  NUDIX hydrolase  43.18 
 
 		 267 aa  73.9  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3969  NUDIX hydrolase  41.9 
 
 		 255 aa  73.2  0.000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00994363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4337  NUDIX hydrolase  41.9 
 
 		 259 aa  73.2  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.953941  normal  0.291795 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7395  NUDIX hydrolase  42.16 
 
 		 260 aa  72  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.23438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5160  NUDIX hydrolase  44.94 
 
 		 243 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0379  NUDIX hydrolase  39.78 
 
 		 221 aa  70.9  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0395  NUDIX hydrolase  43.56 
 
 		 243 aa  70.9  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0994316  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2777  NUDIX hydrolase  33.58 
 
 		 251 aa  70.9  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.102505 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15670  hypothetical protein  43.18 
 
 		 244 aa  70.9  0.00000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.238037  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6653  NUDIX hydrolase  42.35 
 
 		 320 aa  70.5  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1043  NUDIX hydrolase  36.75 
 
 		 229 aa  70.5  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.541609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0305  NUDIX hydrolase  39.33 
 
 		 239 aa  70.5  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0320  NUDIX hydrolase  39.08 
 
 		 202 aa  69.3  0.00000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0745  NUDIX hydrolase  38.64 
 
 		 219 aa  69.3  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0756  NUDIX hydrolase  34.83 
 
 		 230 aa  68.9  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229185  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3292  NUDIX hydrolase  34.94 
 
 		 229 aa  68.6  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.238683 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0345  NUDIX hydrolase  45 
 
 		 252 aa  68.2  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0244735  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2506  acetohydroxy acid isomeroreductase  36.96 
 
 		 245 aa  67.8  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0206114  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0165  NUDIX hydrolase  39.78 
 
 		 219 aa  67.4  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27477  normal  0.587947 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0306  NUDIX hydrolase  39.77 
 
 		 229 aa  67.8  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3729  NUDIX hydrolase  39.29 
 
 		 242 aa  67.4  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2238  NUDIX hydrolase  37.19 
 
 		 251 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0576  hypothetical protein  38.71 
 
 		 243 aa  65.9  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0189  NUDIX hydrolase  39.56 
 
 		 223 aa  65.1  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2561  NUDIX hydrolase  37.21 
 
 		 236 aa  63.9  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.233284  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0269  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 233 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0269  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 233 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6281  NUDIX hydrolase  39.77 
 
 		 244 aa  63.9  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000760196  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1347  NUDIX hydrolase  42.55 
 
 		 269 aa  63.5  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244652 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0240  ADP-ribose pyrophosphatase  38.37 
 
 		 275 aa  63.5  0.000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0563851  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7553  hypothetical protein  36.46 
 
 		 219 aa  63.5  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.805753  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0416  NUDIX hydrolase  36.96 
 
 		 248 aa  63.2  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.255791  normal  0.0628486 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0783  NUDIX hydrolase  35.23 
 
 		 238 aa  63.2  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5113  hypothetical protein  38.64 
 
 		 252 aa  63.2  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.424596 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2421  NUDIX hydrolase  35 
 
 		 233 aa  62.4  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3721  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 230 aa  62  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000111164  decreased coverage  0.00513627 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4133  NUDIX hydrolase  37.23 
 
 		 226 aa  62  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.877658  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0836  NUDIX hydrolase  38.16 
 
 		 263 aa  61.6  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.550059  normal  0.10397 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2298  NUDIX hydrolase  36.05 
 
 		 236 aa  61.6  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000778987 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6951  NUDIX hydrolase  33.73 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.720155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3556  NUDIX hydrolase  35.34 
 
 		 249 aa  60.8  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0681296  normal  0.23927 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0291  NUDIX hydrolase  39.77 
 
 		 244 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.78148 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2566  NUDIX hydrolase  40.21 
 
 		 251 aa  61.2  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000361944 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0784  NUDIX hydrolase  35.63 
 
 		 245 aa  60.5  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.793093  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4031  NUDIX hydrolase  36.17 
 
 		 286 aa  60.1  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1099  NUDIX hydrolase  34.34 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1101  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 		 229 aa  59.7  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1240  NUDIX hydrolase  31.34 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.538948  normal  0.136467 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0351  NUDIX hydrolase  33.7 
 
 		 255 aa  58.9  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.248655  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0850  NUDIX hydrolase  40.45 
 
 		 217 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.491635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0073  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 225 aa  58.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0588  NUDIX hydrolase  31.33 
 
 		 254 aa  58.9  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00602457 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4021  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 		 242 aa  57  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.952942 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1117  NUDIX hydrolase  28 
 
 		 229 aa  57  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5731  NUDIX hydrolase  36.26 
 
 		 229 aa  57  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4671  NUDIX hydrolase  29.07 
 
 		 257 aa  57  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.695959  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3218  NUDIX hydrolase  34.48 
 
 		 251 aa  56.6  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0602  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 228 aa  57  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.430612 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>