153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4335 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4335  hypothetical protein  100 
 
 		 325 aa  645    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.229695 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1112  hypothetical protein  87.62 
 
 		 335 aa  568  1e-161  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0529668  normal  0.319534 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1233  hypothetical protein  87 
 
 		 326 aa  557  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1251  hypothetical protein  87.69 
 
 		 331 aa  550  1e-155  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.275443  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0736  hypothetical protein  60.56 
 
 		 351 aa  374  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0703  hypothetical protein  60.56 
 
 		 322 aa  363  1e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.703298  normal  0.693956 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2899  hypothetical protein  53.03 
 
 		 335 aa  305  8.000000000000001e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.553205  normal  0.0261035 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0795  hypothetical protein  53.46 
 
 		 322 aa  304  1.0000000000000001e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00728641 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4472  hypothetical protein  56.55 
 
 		 366 aa  301  1e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.859238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4936  hypothetical protein  56.55 
 
 		 368 aa  300  2e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.27766  normal  0.436993 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4986  hypothetical protein  55.91 
 
 		 350 aa  298  1e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.353887  normal  0.14096 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1960  hypothetical protein  54.77 
 
 		 331 aa  297  2e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.575104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0167  hypothetical protein  56.01 
 
 		 319 aa  296  3e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0123154  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1540  hypothetical protein  52.7 
 
 		 344 aa  289  5.0000000000000004e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.906535 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4758  hypothetical protein  52.55 
 
 		 319 aa  285  8e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195647  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3495  hypothetical protein  53.02 
 
 		 328 aa  283  2.0000000000000002e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.239397 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2423  hypothetical protein  52.02 
 
 		 325 aa  281  9e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0685019 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2818  hypothetical protein  54.31 
 
 		 316 aa  277  1e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1184  putative nicotinic acid mononucleotide (NMN) biosynthesis protein  49.53 
 
 		 324 aa  277  2e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4592  hypothetical protein  53.02 
 
 		 317 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0563961 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0294  hypothetical protein  49.52 
 
 		 323 aa  271  1e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.199627 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2558  hypothetical protein  53.42 
 
 		 296 aa  264  1e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.946779  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2214  hypothetical protein  49.04 
 
 		 317 aa  261  2e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263003  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2601  hypothetical protein  50.62 
 
 		 335 aa  259  3e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0428  hypothetical protein  48.87 
 
 		 316 aa  251  1e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6032  hypothetical protein  48.44 
 
 		 309 aa  249  4e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.607713 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1430  hypothetical protein  48.71 
 
 		 300 aa  246  3e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7187  hypothetical protein  48.87 
 
 		 298 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0239386 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1540  hypothetical protein  50.32 
 
 		 298 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.492228  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0633  hypothetical protein  39.07 
 
 		 364 aa  225  9e-58  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0601  hypothetical protein  39.94 
 
 		 363 aa  223  3e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.777299 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1963  hypothetical protein  40.48 
 
 		 380 aa  217  2.9999999999999998e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23180  hypothetical protein  43.71 
 
 		 320 aa  211  1e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3126  NUDIX hydrolase  29.55 
 
 		 303 aa  95.9  8e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.573169  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3138  NUDIX hydrolase  31.2 
 
 		 284 aa  88.2  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0145  NUDIX hydrolase  48.89 
 
 		 252 aa  83.2  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.658574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5745  NUDIX hydrolase  46.51 
 
 		 231 aa  80.5  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4290  NUDIX hydrolase  49.41 
 
 		 240 aa  80.5  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00680151  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0387  NUDIX hydrolase  46.67 
 
 		 252 aa  80.1  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.231232 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2843  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 267 aa  80.1  0.00000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0379  NUDIX hydrolase  46.51 
 
 		 221 aa  79.7  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0189  NUDIX hydrolase  47.52 
 
 		 223 aa  79.3  0.00000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1043  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 229 aa  79.3  0.00000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.541609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4133  NUDIX hydrolase  47.13 
 
 		 226 aa  79.3  0.00000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.877658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6653  NUDIX hydrolase  46.23 
 
 		 320 aa  77.8  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6368  NUDIX hydrolase  41.49 
 
 		 229 aa  77.4  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3969  NUDIX hydrolase  46.6 
 
 		 255 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00994363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0576  hypothetical protein  46.32 
 
 		 243 aa  76.6  0.0000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4337  NUDIX hydrolase  47.87 
 
 		 259 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.953941  normal  0.291795 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2119  NUDIX hydrolase  40.43 
 
 		 229 aa  76.3  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.461945 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0165  NUDIX hydrolase  43.75 
 
 		 219 aa  75.9  0.0000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27477  normal  0.587947 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0756  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 230 aa  75.5  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229185  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0305  NUDIX hydrolase  44.09 
 
 		 239 aa  75.5  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7553  hypothetical protein  40.95 
 
 		 219 aa  75.5  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.805753  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5160  NUDIX hydrolase  30.61 
 
 		 243 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4449  NUDIX hydrolase  50.57 
 
 		 255 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.413572 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0395  NUDIX hydrolase  46.81 
 
 		 243 aa  74.3  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0994316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2506  acetohydroxy acid isomeroreductase  38.14 
 
 		 245 aa  73.6  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0206114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2421  NUDIX hydrolase  37.36 
 
 		 233 aa  73.6  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6951  NUDIX hydrolase  37.11 
 
 		 231 aa  73.6  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.720155  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2777  NUDIX hydrolase  40.43 
 
 		 251 aa  73.6  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.102505 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7395  NUDIX hydrolase  45.98 
 
 		 260 aa  73.2  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.23438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0320  NUDIX hydrolase  43.16 
 
 		 202 aa  72.4  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1347  NUDIX hydrolase  44.23 
 
 		 269 aa  72  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244652 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0836  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 		 263 aa  71.6  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.550059  normal  0.10397 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4031  NUDIX hydrolase  45.56 
 
 		 286 aa  71.6  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15670  hypothetical protein  47.13 
 
 		 244 aa  71.6  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.238037  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0345  NUDIX hydrolase  51.47 
 
 		 252 aa  70.5  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0244735  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0745  NUDIX hydrolase  40.7 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0269  NUDIX hydrolase  42 
 
 		 233 aa  69.3  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0269  NUDIX hydrolase  42 
 
 		 233 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0240  ADP-ribose pyrophosphatase  43.02 
 
 		 275 aa  68.6  0.0000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0563851  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1510  NUDIX hydrolase  45.88 
 
 		 225 aa  68.6  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00116155  normal  0.680564 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3292  NUDIX hydrolase  33.72 
 
 		 229 aa  68.6  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.238683 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5113  hypothetical protein  42.05 
 
 		 252 aa  67.8  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.424596 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3167  NUDIX hydrolase  43.18 
 
 		 243 aa  67.8  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00016749  hitchhiker  0.000047705 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2238  NUDIX hydrolase  44.32 
 
 		 251 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0416  NUDIX hydrolase  42 
 
 		 248 aa  67  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.255791  normal  0.0628486 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0602  NUDIX hydrolase  34.44 
 
 		 228 aa  66.6  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5731  NUDIX hydrolase  44.19 
 
 		 229 aa  65.5  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6281  NUDIX hydrolase  43.68 
 
 		 244 aa  65.5  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000760196  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3218  NUDIX hydrolase  39 
 
 		 251 aa  64.7  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0291  NUDIX hydrolase  42.05 
 
 		 244 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.78148 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3729  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 		 242 aa  64.3  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01970  ADP-ribose pyrophosphatase  38.46 
 
 		 232 aa  63.9  0.000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0783  NUDIX hydrolase  31.19 
 
 		 238 aa  63.9  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1117  NUDIX hydrolase  32.61 
 
 		 229 aa  63.9  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0306  NUDIX hydrolase  40.7 
 
 		 229 aa  63.9  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1099  NUDIX hydrolase  39.53 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1240  NUDIX hydrolase  35.16 
 
 		 233 aa  62.8  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.538948  normal  0.136467 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10820  ADP-ribose pyrophosphatase  40.7 
 
 		 240 aa  62.8  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.508627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0784  NUDIX hydrolase  30.14 
 
 		 245 aa  62.8  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.793093  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0351  NUDIX hydrolase  40.7 
 
 		 255 aa  62  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.248655  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4671  NUDIX hydrolase  32.65 
 
 		 257 aa  62  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.695959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0861  NUDIX hydrolase  41.11 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.314952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2561  NUDIX hydrolase  39.53 
 
 		 236 aa  61.6  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.233284  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2298  NUDIX hydrolase  39.53 
 
 		 236 aa  61.2  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000778987 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1570  NUDIX hydrolase  31.96 
 
 		 251 aa  60.5  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.905122  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0073  NUDIX hydrolase  35.05 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3620  NUDIX hydrolase  40.45 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0652578  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>