142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1540 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1540  hypothetical protein  100 
 
 		 298 aa  592  1e-168  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.492228  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1540  hypothetical protein  59.09 
 
 		 344 aa  333  3e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.906535 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4758  hypothetical protein  55.59 
 
 		 319 aa  309  4e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195647  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2214  hypothetical protein  55.7 
 
 		 317 aa  308  6.999999999999999e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263003  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1184  putative nicotinic acid mononucleotide (NMN) biosynthesis protein  55.56 
 
 		 324 aa  305  8.000000000000001e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0294  hypothetical protein  54.84 
 
 		 323 aa  305  8.000000000000001e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.199627 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6032  hypothetical protein  56.71 
 
 		 309 aa  301  6.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.607713 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2423  hypothetical protein  54.82 
 
 		 325 aa  301  7.000000000000001e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0685019 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7187  hypothetical protein  56.71 
 
 		 298 aa  300  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0239386 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3495  hypothetical protein  55.56 
 
 		 328 aa  295  4e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.239397 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1430  hypothetical protein  54.46 
 
 		 300 aa  294  2e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2818  hypothetical protein  54.46 
 
 		 316 aa  290  3e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0428  hypothetical protein  51.89 
 
 		 316 aa  282  5.000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2558  hypothetical protein  54.58 
 
 		 296 aa  280  2e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.946779  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4335  hypothetical protein  50.32 
 
 		 325 aa  248  6e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.229695 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0703  hypothetical protein  49.37 
 
 		 322 aa  245  8e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.703298  normal  0.693956 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4986  hypothetical protein  48.1 
 
 		 350 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.353887  normal  0.14096 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1960  hypothetical protein  47.88 
 
 		 331 aa  242  5e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.575104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4936  hypothetical protein  49.17 
 
 		 368 aa  242  6e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.27766  normal  0.436993 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1233  hypothetical protein  48.39 
 
 		 326 aa  241  9e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4472  hypothetical protein  49.17 
 
 		 366 aa  241  1e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.859238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1251  hypothetical protein  49.37 
 
 		 331 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.275443  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1112  hypothetical protein  49.04 
 
 		 335 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0529668  normal  0.319534 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0736  hypothetical protein  45.31 
 
 		 351 aa  237  2e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0167  hypothetical protein  49.01 
 
 		 319 aa  235  7e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0123154  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0633  hypothetical protein  41.33 
 
 		 364 aa  235  8e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23180  hypothetical protein  44.58 
 
 		 320 aa  234  9e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2899  hypothetical protein  45.4 
 
 		 335 aa  234  1.0000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.553205  normal  0.0261035 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0601  hypothetical protein  41.16 
 
 		 363 aa  233  2.0000000000000002e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.777299 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0795  hypothetical protein  49.32 
 
 		 322 aa  233  3e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00728641 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1963  hypothetical protein  41.12 
 
 		 380 aa  231  1e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2601  hypothetical protein  46.33 
 
 		 335 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4592  hypothetical protein  46.23 
 
 		 317 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0563961 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3126  NUDIX hydrolase  29.44 
 
 		 303 aa  96.7  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.573169  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3138  NUDIX hydrolase  31.06 
 
 		 284 aa  95.5  9e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0145  NUDIX hydrolase  52.33 
 
 		 252 aa  87.8  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.658574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0387  NUDIX hydrolase  51.16 
 
 		 252 aa  85.5  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.231232 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4290  NUDIX hydrolase  47.73 
 
 		 240 aa  83.6  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00680151  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2843  NUDIX hydrolase  47.19 
 
 		 267 aa  80.9  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0305  NUDIX hydrolase  48.84 
 
 		 239 aa  80.1  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2119  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 		 229 aa  76.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.461945 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1043  NUDIX hydrolase  46.51 
 
 		 229 aa  73.9  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.541609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0756  NUDIX hydrolase  40.82 
 
 		 230 aa  73.2  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229185  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6368  NUDIX hydrolase  43.68 
 
 		 229 aa  72  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4449  NUDIX hydrolase  48.28 
 
 		 255 aa  69.7  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.413572 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5745  NUDIX hydrolase  41.86 
 
 		 231 aa  67.8  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3729  NUDIX hydrolase  38.38 
 
 		 242 aa  67  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1510  NUDIX hydrolase  43.37 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00116155  normal  0.680564 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0745  NUDIX hydrolase  40.91 
 
 		 219 aa  65.9  0.0000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3969  NUDIX hydrolase  45.98 
 
 		 255 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00994363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5160  NUDIX hydrolase  44.94 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4337  NUDIX hydrolase  45.98 
 
 		 259 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.953941  normal  0.291795 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0783  NUDIX hydrolase  41.57 
 
 		 238 aa  63.2  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0602  NUDIX hydrolase  35.96 
 
 		 228 aa  62.8  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2506  acetohydroxy acid isomeroreductase  37.62 
 
 		 245 aa  62  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0206114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5113  hypothetical protein  37.93 
 
 		 252 aa  62  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.424596 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2421  NUDIX hydrolase  37.37 
 
 		 233 aa  61.6  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3292  NUDIX hydrolase  34.88 
 
 		 229 aa  61.6  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.238683 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0836  NUDIX hydrolase  38.82 
 
 		 263 aa  60.8  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.550059  normal  0.10397 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2238  NUDIX hydrolase  37.1 
 
 		 251 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15670  hypothetical protein  42.7 
 
 		 244 aa  61.2  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.238037  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0269  NUDIX hydrolase  40.23 
 
 		 233 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1101  NUDIX hydrolase  44.57 
 
 		 229 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0269  NUDIX hydrolase  40.23 
 
 		 233 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0291  NUDIX hydrolase  37.19 
 
 		 244 aa  60.1  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.78148 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4133  NUDIX hydrolase  40.7 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.877658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6951  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.720155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0784  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 245 aa  59.3  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.793093  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3721  NUDIX hydrolase  32.77 
 
 		 230 aa  58.5  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000111164  decreased coverage  0.00513627 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0588  NUDIX hydrolase  31.63 
 
 		 254 aa  58.5  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00602457 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0416  NUDIX hydrolase  37.93 
 
 		 248 aa  58.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.255791  normal  0.0628486 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0861  NUDIX hydrolase  38.38 
 
 		 231 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.314952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2633  NUDIX hydrolase  35.96 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29366  normal  0.215987 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2561  NUDIX hydrolase  37.21 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.233284  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4031  NUDIX hydrolase  37.62 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5114  NUDIX hydrolase  37.35 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.32433 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0652  NUDIX hydrolase  36.17 
 
 		 254 aa  57  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.415821 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5424  NUDIX hydrolase  40.3 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0278  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 240 aa  57  0.0000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000200182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0240  ADP-ribose pyrophosphatase  38.37 
 
 		 275 aa  57  0.0000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0563851  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0379  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4671  NUDIX hydrolase  32.04 
 
 		 257 aa  56.6  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.695959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3167  NUDIX hydrolase  40.91 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00016749  hitchhiker  0.000047705 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0320  NUDIX hydrolase  37.93 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0850  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.491635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2399  NUDIX hydrolase  36.47 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10820  ADP-ribose pyrophosphatase  38.54 
 
 		 240 aa  55.1  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.508627  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1347  NUDIX hydrolase  34.55 
 
 		 269 aa  55.1  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244652 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6281  NUDIX hydrolase  37.21 
 
 		 244 aa  55.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000760196  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1117  NUDIX hydrolase  25.14 
 
 		 229 aa  54.7  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3556  NUDIX hydrolase  37.65 
 
 		 249 aa  54.3  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0681296  normal  0.23927 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2298  NUDIX hydrolase  28.99 
 
 		 236 aa  54.3  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000778987 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0832  NUDIX hydrolase  37.65 
 
 		 217 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0850  NUDIX hydrolase  37.65 
 
 		 217 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.985377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5657  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 248 aa  54.3  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0345  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 		 252 aa  54.3  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0244735  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4021  NUDIX hydrolase  35.87 
 
 		 242 aa  53.9  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.952942 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0350  NUDIX hydrolase  32.65 
 
 		 233 aa  53.5  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2566  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 		 251 aa  53.5  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000361944 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1240  NUDIX hydrolase  40.28 
 
 		 233 aa  53.9  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.538948  normal  0.136467 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>