146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2899 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2899  hypothetical protein  100 
 
 
335 aa  657    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.553205  normal  0.0261035 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0736  hypothetical protein  55.09 
 
 
351 aa  324  1e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0795  hypothetical protein  53.15 
 
 
322 aa  320  1.9999999999999998e-86  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00728641 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4335  hypothetical protein  53.03 
 
 
325 aa  305  8.000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.229695 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1233  hypothetical protein  54.1 
 
 
326 aa  299  4e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0703  hypothetical protein  54.71 
 
 
322 aa  296  4e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.703298  normal  0.693956 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1112  hypothetical protein  52.27 
 
 
335 aa  294  1e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0529668  normal  0.319534 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1251  hypothetical protein  52.73 
 
 
331 aa  293  3e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.275443  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3495  hypothetical protein  50.77 
 
 
328 aa  292  6e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.239397 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1540  hypothetical protein  50.3 
 
 
344 aa  283  4.0000000000000003e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.906535 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4758  hypothetical protein  47.94 
 
 
319 aa  278  7e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195647  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0294  hypothetical protein  48.02 
 
 
323 aa  276  4e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.199627 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6032  hypothetical protein  49.69 
 
 
309 aa  272  5.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.607713 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1184  putative nicotinic acid mononucleotide (NMN) biosynthesis protein  49.39 
 
 
324 aa  270  2.9999999999999997e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2423  hypothetical protein  46.11 
 
 
325 aa  266  5e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0685019 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7187  hypothetical protein  48.15 
 
 
298 aa  264  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0239386 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2818  hypothetical protein  47.18 
 
 
316 aa  263  4e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1960  hypothetical protein  48.27 
 
 
331 aa  262  6e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.575104  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0167  hypothetical protein  51.52 
 
 
319 aa  261  8.999999999999999e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0123154  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4592  hypothetical protein  50.61 
 
 
317 aa  256  3e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0563961 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2558  hypothetical protein  48.44 
 
 
296 aa  253  4.0000000000000004e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.946779  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2214  hypothetical protein  46.42 
 
 
317 aa  253  4.0000000000000004e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263003  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4472  hypothetical protein  48.62 
 
 
366 aa  252  6e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.859238  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4936  hypothetical protein  48.62 
 
 
368 aa  252  6e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.27766  normal  0.436993 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4986  hypothetical protein  47.31 
 
 
350 aa  252  8.000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.353887  normal  0.14096 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0428  hypothetical protein  43.84 
 
 
316 aa  236  3e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23180  hypothetical protein  46.38 
 
 
320 aa  226  3e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1540  hypothetical protein  45.4 
 
 
298 aa  222  8e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.492228  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0601  hypothetical protein  39.35 
 
 
363 aa  219  5e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.777299 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1430  hypothetical protein  44.48 
 
 
300 aa  216  5e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2601  hypothetical protein  44.79 
 
 
335 aa  212  7.999999999999999e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0633  hypothetical protein  37.27 
 
 
364 aa  210  2e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1963  hypothetical protein  36.41 
 
 
380 aa  196  4.0000000000000005e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3138  NUDIX hydrolase  30 
 
 
284 aa  86.7  5e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2119  NUDIX hydrolase  45.78 
 
 
229 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.461945 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3126  NUDIX hydrolase  29.13 
 
 
303 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.573169  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2506  acetohydroxy acid isomeroreductase  35.16 
 
 
245 aa  77.4  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0206114  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4449  NUDIX hydrolase  48.81 
 
 
255 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.413572 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6368  NUDIX hydrolase  43.37 
 
 
229 aa  73.9  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4290  NUDIX hydrolase  44.05 
 
 
240 aa  73.2  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00680151  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6951  NUDIX hydrolase  38.2 
 
 
231 aa  72.8  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.720155  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5160  NUDIX hydrolase  48.19 
 
 
243 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1043  NUDIX hydrolase  44.58 
 
 
229 aa  72.4  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.541609  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2843  NUDIX hydrolase  45.88 
 
 
267 aa  71.6  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3969  NUDIX hydrolase  36.57 
 
 
255 aa  69.7  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00994363  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4337  NUDIX hydrolase  43.82 
 
 
259 aa  69.3  0.00000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.953941  normal  0.291795 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0145  NUDIX hydrolase  43.48 
 
 
252 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.658574  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6653  NUDIX hydrolase  46.34 
 
 
320 aa  68.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2566  NUDIX hydrolase  44.09 
 
 
251 aa  68.9  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000361944 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0379  NUDIX hydrolase  41.86 
 
 
221 aa  68.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0783  NUDIX hydrolase  31.07 
 
 
238 aa  67.8  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3729  NUDIX hydrolase  39.53 
 
 
242 aa  67  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0745  NUDIX hydrolase  38.37 
 
 
219 aa  66.6  0.0000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0387  NUDIX hydrolase  42.39 
 
 
252 aa  66.2  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.231232 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0576  hypothetical protein  40.43 
 
 
243 aa  65.5  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0784  NUDIX hydrolase  32.04 
 
 
245 aa  65.5  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.793093  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0395  NUDIX hydrolase  43.82 
 
 
243 aa  65.1  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0994316  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4133  NUDIX hydrolase  37.38 
 
 
226 aa  65.9  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.877658  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3292  NUDIX hydrolase  32.94 
 
 
229 aa  64.7  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.238683 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7395  NUDIX hydrolase  38 
 
 
260 aa  64.7  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.23438  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5745  NUDIX hydrolase  38.55 
 
 
231 aa  64.7  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01970  ADP-ribose pyrophosphatase  39.08 
 
 
232 aa  64.3  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0320  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 
202 aa  63.5  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0345  NUDIX hydrolase  43.42 
 
 
252 aa  63.5  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0244735  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0305  NUDIX hydrolase  39.78 
 
 
239 aa  63.2  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1240  NUDIX hydrolase  35.96 
 
 
233 aa  62.8  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.538948  normal  0.136467 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0602  NUDIX hydrolase  32.18 
 
 
228 aa  62.4  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10820  ADP-ribose pyrophosphatase  38.82 
 
 
240 aa  62  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.508627  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3620  NUDIX hydrolase  38.2 
 
 
234 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0652578  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0189  NUDIX hydrolase  40.96 
 
 
223 aa  61.2  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1117  NUDIX hydrolase  29.13 
 
 
229 aa  61.2  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0861  NUDIX hydrolase  41.05 
 
 
231 aa  60.5  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.314952  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5731  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 
229 aa  60.5  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5113  hypothetical protein  38.82 
 
 
252 aa  60.5  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.424596 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0756  NUDIX hydrolase  29.37 
 
 
230 aa  60.1  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229185  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0165  NUDIX hydrolase  38.37 
 
 
219 aa  60.1  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27477  normal  0.587947 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2777  NUDIX hydrolase  34.69 
 
 
251 aa  60.1  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.102505 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0269  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 
233 aa  59.7  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0269  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 
233 aa  59.7  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0588  NUDIX hydrolase  28.16 
 
 
254 aa  59.7  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00602457 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3393  NUDIX hydrolase  29.93 
 
 
248 aa  59.3  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.4746  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8962  hydrolase, NUDIX family  42.11 
 
 
244 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2238  NUDIX hydrolase  36.9 
 
 
251 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0416  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 
248 aa  58.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.255791  normal  0.0628486 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0073  NUDIX hydrolase  32.18 
 
 
225 aa  58.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0291  NUDIX hydrolase  36.9 
 
 
244 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.78148 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0306  NUDIX hydrolase  35.92 
 
 
229 aa  57  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4031  NUDIX hydrolase  40.48 
 
 
286 aa  56.6  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2797  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
234 aa  57  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.507012  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5657  NUDIX hydrolase  39.56 
 
 
248 aa  57  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1347  NUDIX hydrolase  39.09 
 
 
269 aa  57  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000244652 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2421  NUDIX hydrolase  32.5 
 
 
233 aa  56.6  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5424  NUDIX hydrolase  24.34 
 
 
254 aa  56.6  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1099  NUDIX hydrolase  36.89 
 
 
249 aa  56.2  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0695  NUDIX hydrolase  39.51 
 
 
248 aa  55.8  0.0000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3715  NUDIX hydrolase  40.23 
 
 
222 aa  55.8  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.619074  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4671  NUDIX hydrolase  28.09 
 
 
257 aa  55.8  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.695959  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3167  NUDIX hydrolase  37.65 
 
 
243 aa  55.8  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00016749  hitchhiker  0.000047705 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2399  NUDIX hydrolase  28.09 
 
 
234 aa  55.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11609  hypothetical protein  35.96 
 
 
236 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.706015  normal  0.421109 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>