153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1233 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1233  hypothetical protein  100 
 
 		 326 aa  648    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1112  hypothetical protein  93.27 
 
 		 335 aa  607  1e-173  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0529668  normal  0.319534 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4335  hypothetical protein  87 
 
 		 325 aa  557  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.229695 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1251  hypothetical protein  87.01 
 
 		 331 aa  553  1e-156  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.275443  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0736  hypothetical protein  60.94 
 
 		 351 aa  372  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0703  hypothetical protein  59.94 
 
 		 322 aa  360  2e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.703298  normal  0.693956 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0795  hypothetical protein  53.82 
 
 		 322 aa  315  8e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00728641 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2899  hypothetical protein  54.1 
 
 		 335 aa  299  4e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.553205  normal  0.0261035 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1960  hypothetical protein  54.13 
 
 		 331 aa  296  3e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.575104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1540  hypothetical protein  53.7 
 
 		 344 aa  293  2e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.906535 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4472  hypothetical protein  55.77 
 
 		 366 aa  290  3e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.859238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4986  hypothetical protein  56.09 
 
 		 350 aa  290  3e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.353887  normal  0.14096 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0167  hypothetical protein  53.25 
 
 		 319 aa  290  3e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0123154  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4936  hypothetical protein  55.77 
 
 		 368 aa  289  4e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.27766  normal  0.436993 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3495  hypothetical protein  53.04 
 
 		 328 aa  283  4.0000000000000003e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.239397 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4758  hypothetical protein  52.73 
 
 		 319 aa  280  3e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195647  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2818  hypothetical protein  54.19 
 
 		 316 aa  278  9e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2423  hypothetical protein  52.04 
 
 		 325 aa  274  1.0000000000000001e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0685019 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4592  hypothetical protein  53.21 
 
 		 317 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0563961 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1184  putative nicotinic acid mononucleotide (NMN) biosynthesis protein  50.32 
 
 		 324 aa  267  2e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0294  hypothetical protein  49.52 
 
 		 323 aa  261  8e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.199627 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6032  hypothetical protein  48.6 
 
 		 309 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.607713 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2214  hypothetical protein  47.9 
 
 		 317 aa  259  5.0000000000000005e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263003  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2558  hypothetical protein  52.46 
 
 		 296 aa  257  2e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.946779  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7187  hypothetical protein  49.84 
 
 		 298 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0239386 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0428  hypothetical protein  49.5 
 
 		 316 aa  252  7e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2601  hypothetical protein  51.71 
 
 		 335 aa  250  3e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1430  hypothetical protein  47.87 
 
 		 300 aa  239  2.9999999999999997e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1540  hypothetical protein  48.39 
 
 		 298 aa  227  2e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.492228  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0633  hypothetical protein  39.53 
 
 		 364 aa  220  3e-56  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23180  hypothetical protein  42.02 
 
 		 320 aa  214  9.999999999999999e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1963  hypothetical protein  39.52 
 
 		 380 aa  214  1.9999999999999998e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0601  hypothetical protein  39.59 
 
 		 363 aa  213  2.9999999999999995e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.777299 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3126  NUDIX hydrolase  31.27 
 
 		 303 aa  96.7  6e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.573169  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3138  NUDIX hydrolase  30.07 
 
 		 284 aa  93.2  5e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0145  NUDIX hydrolase  52.27 
 
 		 252 aa  84.3  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.658574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2843  NUDIX hydrolase  49.44 
 
 		 267 aa  82  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0387  NUDIX hydrolase  48 
 
 		 252 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.231232 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4133  NUDIX hydrolase  46.15 
 
 		 226 aa  80.1  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.877658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0379  NUDIX hydrolase  46.51 
 
 		 221 aa  79.7  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5745  NUDIX hydrolase  45.98 
 
 		 231 aa  79.3  0.00000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0189  NUDIX hydrolase  47.52 
 
 		 223 aa  79.3  0.00000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6653  NUDIX hydrolase  46.23 
 
 		 320 aa  77.8  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4290  NUDIX hydrolase  45.74 
 
 		 240 aa  77.8  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00680151  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6368  NUDIX hydrolase  42.53 
 
 		 229 aa  77.4  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0756  NUDIX hydrolase  37 
 
 		 230 aa  77.4  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229185  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0395  NUDIX hydrolase  47.87 
 
 		 243 aa  76.6  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0994316  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1347  NUDIX hydrolase  45.71 
 
 		 269 aa  76.6  0.0000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244652 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5160  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 243 aa  76.3  0.0000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0305  NUDIX hydrolase  45.36 
 
 		 239 aa  76.3  0.0000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2119  NUDIX hydrolase  42.53 
 
 		 229 aa  75.9  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.461945 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0165  NUDIX hydrolase  43.75 
 
 		 219 aa  75.9  0.0000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27477  normal  0.587947 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7395  NUDIX hydrolase  47.13 
 
 		 260 aa  75.9  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.23438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4449  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 255 aa  75.9  0.0000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.413572 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2421  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 233 aa  74.7  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0320  NUDIX hydrolase  44.79 
 
 		 202 aa  74.7  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15670  hypothetical protein  47.42 
 
 		 244 aa  75.1  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.238037  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3969  NUDIX hydrolase  46.6 
 
 		 255 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00994363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4337  NUDIX hydrolase  47.87 
 
 		 259 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.953941  normal  0.291795 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0576  hypothetical protein  45.74 
 
 		 243 aa  73.9  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7553  hypothetical protein  44.68 
 
 		 219 aa  74.3  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.805753  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6951  NUDIX hydrolase  37.11 
 
 		 231 aa  73.6  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.720155  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2777  NUDIX hydrolase  40.43 
 
 		 251 aa  73.2  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.102505 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2506  acetohydroxy acid isomeroreductase  38.14 
 
 		 245 aa  73.2  0.000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0206114  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0836  NUDIX hydrolase  46.75 
 
 		 263 aa  73.2  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.550059  normal  0.10397 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1043  NUDIX hydrolase  33.16 
 
 		 229 aa  72.8  0.000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.541609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0269  NUDIX hydrolase  43.56 
 
 		 233 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0269  NUDIX hydrolase  43.56 
 
 		 233 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2238  NUDIX hydrolase  45.83 
 
 		 251 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4031  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 		 286 aa  71.2  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0784  NUDIX hydrolase  29.41 
 
 		 245 aa  69.7  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.793093  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0345  NUDIX hydrolase  48.61 
 
 		 252 aa  69.3  0.00000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0244735  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0745  NUDIX hydrolase  39.78 
 
 		 219 aa  68.6  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3292  NUDIX hydrolase  32.95 
 
 		 229 aa  68.6  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.238683 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0240  ADP-ribose pyrophosphatase  43.02 
 
 		 275 aa  68.6  0.0000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0563851  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6281  NUDIX hydrolase  44.83 
 
 		 244 aa  68.6  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000760196  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0416  NUDIX hydrolase  43.01 
 
 		 248 aa  67.8  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.255791  normal  0.0628486 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0291  NUDIX hydrolase  43.75 
 
 		 244 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.78148 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1510  NUDIX hydrolase  47.25 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00116155  normal  0.680564 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5113  hypothetical protein  42.7 
 
 		 252 aa  66.2  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.424596 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1099  NUDIX hydrolase  40.91 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5731  NUDIX hydrolase  43.82 
 
 		 229 aa  65.9  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3218  NUDIX hydrolase  40.86 
 
 		 251 aa  65.9  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3167  NUDIX hydrolase  42.05 
 
 		 243 aa  65.5  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00016749  hitchhiker  0.000047705 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0783  NUDIX hydrolase  32.65 
 
 		 238 aa  64.7  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10820  ADP-ribose pyrophosphatase  41.86 
 
 		 240 aa  64.7  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.508627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3729  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 		 242 aa  63.9  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1117  NUDIX hydrolase  32.61 
 
 		 229 aa  63.5  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1240  NUDIX hydrolase  35.16 
 
 		 233 aa  62  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.538948  normal  0.136467 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0861  NUDIX hydrolase  41.11 
 
 		 231 aa  62.4  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.314952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2561  NUDIX hydrolase  39.53 
 
 		 236 aa  61.6  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.233284  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0306  NUDIX hydrolase  39.53 
 
 		 229 aa  61.2  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0602  NUDIX hydrolase  33.67 
 
 		 228 aa  61.6  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0351  NUDIX hydrolase  40.7 
 
 		 255 aa  61.6  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.248655  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2298  NUDIX hydrolase  39.53 
 
 		 236 aa  60.8  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000778987 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0073  NUDIX hydrolase  34.69 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4671  NUDIX hydrolase  31.46 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.695959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2566  NUDIX hydrolase  43.18 
 
 		 251 aa  60.1  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000361944 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3129  NUDIX hydrolase  39.77 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.815886 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2797  NUDIX hydrolase  41.57 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.507012  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>