242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4370 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4370  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 246 aa  495  1e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2060  NUDIX hydrolase  85.12 
 
 		 242 aa  422  1e-117  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4824  NUDIX hydrolase  66.38 
 
 		 662 aa  326  2.0000000000000001e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0491634 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1099  NUDIX hydrolase  66.94 
 
 		 249 aa  321  6e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4133  NUDIX hydrolase  62.8 
 
 		 226 aa  242  3e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.877658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0306  NUDIX hydrolase  57.97 
 
 		 229 aa  232  4.0000000000000004e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4031  NUDIX hydrolase  53.71 
 
 		 286 aa  229  3e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7559  NUDIX hydrolase  54.26 
 
 		 237 aa  228  7e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0189  NUDIX hydrolase  53.54 
 
 		 223 aa  219  3e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0379  NUDIX hydrolase  54.02 
 
 		 221 aa  219  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7395  NUDIX hydrolase  56.33 
 
 		 260 aa  219  3.9999999999999997e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.23438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6653  NUDIX hydrolase  48.89 
 
 		 320 aa  219  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0165  NUDIX hydrolase  54.02 
 
 		 219 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27477  normal  0.587947 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3138  NUDIX hydrolase  53.31 
 
 		 273 aa  215  5.9999999999999996e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0461727  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5657  NUDIX hydrolase  54.19 
 
 		 248 aa  213  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1347  NUDIX hydrolase  53.91 
 
 		 269 aa  211  1e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244652 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01970  ADP-ribose pyrophosphatase  49.1 
 
 		 232 aa  201  7e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8962  hydrolase, NUDIX family  55.76 
 
 		 244 aa  194  8.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0861  NUDIX hydrolase  51.3 
 
 		 231 aa  185  5e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.314952  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0836  NUDIX hydrolase  44.08 
 
 		 263 aa  165  5e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.550059  normal  0.10397 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2566  NUDIX hydrolase  45.53 
 
 		 251 aa  165  5e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000361944 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0695  NUDIX hydrolase  43.4 
 
 		 248 aa  159  5e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4290  NUDIX hydrolase  41.63 
 
 		 240 aa  145  5e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00680151  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0145  NUDIX hydrolase  42.13 
 
 		 252 aa  144  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.658574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0387  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 		 252 aa  142  6e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.231232 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6368  NUDIX hydrolase  40.09 
 
 		 229 aa  137  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2119  NUDIX hydrolase  40.09 
 
 		 229 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.461945 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1043  NUDIX hydrolase  39.9 
 
 		 229 aa  134  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.541609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5113  hypothetical protein  42.33 
 
 		 252 aa  133  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.424596 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1510  NUDIX hydrolase  42.58 
 
 		 225 aa  130  2.0000000000000002e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00116155  normal  0.680564 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0745  NUDIX hydrolase  40.19 
 
 		 219 aa  129  5.0000000000000004e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2862  NUDIX hydrolase  51.88 
 
 		 186 aa  128  9.000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.200319  hitchhiker  0.00911064 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0345  NUDIX hydrolase  40.38 
 
 		 252 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0244735  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0305  NUDIX hydrolase  39.42 
 
 		 239 aa  125  8.000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5745  NUDIX hydrolase  39.35 
 
 		 231 aa  125  8.000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4021  NUDIX hydrolase  39.81 
 
 		 242 aa  124  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.952942 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0351  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 255 aa  122  4e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.248655  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5757  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 244 aa  122  4e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000165623  hitchhiker  0.000000000000529868 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6281  NUDIX hydrolase  37.96 
 
 		 244 aa  120  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000760196  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03740  ADP-ribose pyrophosphatase  42.4 
 
 		 228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0297346  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3292  NUDIX hydrolase  35.02 
 
 		 229 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.238683 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5160  NUDIX hydrolase  40.44 
 
 		 243 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3138  NUDIX hydrolase  32.34 
 
 		 284 aa  118  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3126  NUDIX hydrolase  29.41 
 
 		 303 aa  116  3.9999999999999997e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.573169  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1240  NUDIX hydrolase  34.43 
 
 		 233 aa  115  5e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.538948  normal  0.136467 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2328  NUDIX hydrolase  35.32 
 
 		 237 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0602  NUDIX hydrolase  34.6 
 
 		 228 aa  115  8.999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6951  NUDIX hydrolase  33.02 
 
 		 231 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.720155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3556  NUDIX hydrolase  39.07 
 
 		 249 aa  113  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0681296  normal  0.23927 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2506  acetohydroxy acid isomeroreductase  36.54 
 
 		 245 aa  113  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0206114  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1979  MutT/nudix family protein  35.78 
 
 		 237 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3993  NUDIX hydrolase  35.21 
 
 		 234 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0629305  normal  0.556995 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3721  NUDIX hydrolase  39.38 
 
 		 230 aa  110  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000111164  decreased coverage  0.00513627 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2399  NUDIX hydrolase  32.39 
 
 		 234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2421  NUDIX hydrolase  33.8 
 
 		 233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0783  NUDIX hydrolase  31.28 
 
 		 238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5731  NUDIX hydrolase  39.71 
 
 		 229 aa  110  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4337  NUDIX hydrolase  36.82 
 
 		 259 aa  107  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.953941  normal  0.291795 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10820  ADP-ribose pyrophosphatase  35.59 
 
 		 240 aa  107  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.508627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0073  NUDIX hydrolase  31.6 
 
 		 225 aa  106  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2797  NUDIX hydrolase  34.83 
 
 		 234 aa  104  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.507012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2843  NUDIX hydrolase  35.68 
 
 		 267 aa  104  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2777  NUDIX hydrolase  39.04 
 
 		 251 aa  103  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.102505 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3969  NUDIX hydrolase  35.91 
 
 		 255 aa  104  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00994363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1117  NUDIX hydrolase  33.16 
 
 		 229 aa  102  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0576  hypothetical protein  36.84 
 
 		 243 aa  102  5e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3069  NUDIX hydrolase  34.36 
 
 		 223 aa  102  5e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.41651  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3129  NUDIX hydrolase  34.36 
 
 		 232 aa  102  5e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.815886 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3086  NUDIX hydrolase  34.36 
 
 		 232 aa  102  5e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.195483 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0756  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 230 aa  102  7e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229185  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2298  NUDIX hydrolase  35.44 
 
 		 236 aa  102  7e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000778987 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2728  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 		 236 aa  101  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.147262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2561  NUDIX hydrolase  35.86 
 
 		 236 aa  101  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.233284  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3715  NUDIX hydrolase  34.23 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.619074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0291  NUDIX hydrolase  33.04 
 
 		 244 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.78148 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15670  hypothetical protein  38.64 
 
 		 244 aa  99.4  5e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.238037  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03600  probable 8-oxo-dGTPase, MutT-like protein, NUDIX hydrolase family protein  42.11 
 
 		 137 aa  99  6e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4449  NUDIX hydrolase  35.5 
 
 		 255 aa  98.6  7e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.413572 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0416  NUDIX hydrolase  34.36 
 
 		 248 aa  98.6  8e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.255791  normal  0.0628486 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0269  NUDIX hydrolase  31.94 
 
 		 233 aa  98.6  8e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0269  NUDIX hydrolase  31.94 
 
 		 233 aa  98.6  8e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0395  NUDIX hydrolase  36.23 
 
 		 243 aa  98.6  9e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0994316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5114  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 		 237 aa  98.2  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.32433 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2238  NUDIX hydrolase  34.72 
 
 		 251 aa  97.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3620  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 234 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0652578  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3218  NUDIX hydrolase  33.64 
 
 		 251 aa  94  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11609  hypothetical protein  33.84 
 
 		 236 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.706015  normal  0.421109 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3845  NUDIX hydrolase  35.16 
 
 		 224 aa  92.4  6e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00494559  normal  0.589145 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3167  NUDIX hydrolase  34.56 
 
 		 243 aa  91.3  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00016749  hitchhiker  0.000047705 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0385  NUDIX hydrolase  35.21 
 
 		 238 aa  91.3  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0240  ADP-ribose pyrophosphatase  35.29 
 
 		 275 aa  90.1  3e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0563851  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0784  NUDIX hydrolase  27.96 
 
 		 245 aa  89.7  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.793093  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0350  NUDIX hydrolase  31.75 
 
 		 233 aa  89  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2009  NUDIX hydrolase  30.91 
 
 		 234 aa  89  7e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.509117  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3729  NUDIX hydrolase  31.9 
 
 		 242 aa  87.8  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0320  NUDIX hydrolase  29.84 
 
 		 202 aa  87  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7553  hypothetical protein  35.35 
 
 		 219 aa  86.7  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.805753  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0910  ADP-ribose pyrophosphatase  28.9 
 
 		 245 aa  87  3e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0799533  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0465  MutT/nudix family protein  30.52 
 
 		 250 aa  87  3e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000231456  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5598  NUDIX hydrolase  40.94 
 
 		 165 aa  86.3  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>