More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1483 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_1483  NUDIX hydrolase  100 
 
 
210 aa  436  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.163061 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2037  mutT/nudix family protein  40 
 
 
205 aa  168  6e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2148  mutT/nudix family protein  38.54 
 
 
205 aa  167  7e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.992633  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2116  mutT/nudix family protein  38.54 
 
 
205 aa  167  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.610477  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1853  MutT/NUDIX family hydrolase  39.02 
 
 
205 aa  167  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.252059  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1863  MutT/NUDIX family hydrolase  38.54 
 
 
205 aa  166  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3272  mutT/nudix family protein  39.51 
 
 
205 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1900  mutT/nudix family protein  38.54 
 
 
205 aa  165  5e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2079  mutT/nudix family protein  38.54 
 
 
205 aa  165  5e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2047  mutT/nudix family protein  38.54 
 
 
205 aa  165  5e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5350  NUDIX hydrolase  46.91 
 
 
205 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.46762  normal  0.101192 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1897  NUDIX hydrolase  38.54 
 
 
205 aa  162  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.018697  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1536  NUDIX hydrolase  39.42 
 
 
205 aa  160  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.058172  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0773  NUDIX hydrolase  43.41 
 
 
205 aa  155  4e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.195628  hitchhiker  0.00363366 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1218  NUDIX hydrolase  41.33 
 
 
194 aa  152  2.9999999999999998e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.843116 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1799  NUDIX hydrolase  38.05 
 
 
205 aa  151  8e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.000483875  normal  0.809218 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0453  NUDIX hydrolase  41.38 
 
 
215 aa  150  1e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1874  NUDIX hydrolase  36.95 
 
 
206 aa  149  3e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000557306  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51490  hypothetical protein  35.83 
 
 
212 aa  132  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000141034  hitchhiker  0.000162281 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0503  ADP-ribose pyrophosphatase  40.98 
 
 
206 aa  131  9e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1385  NUDIX hydrolase  35.58 
 
 
209 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3076  NUDIX hydrolase  38.94 
 
 
216 aa  128  7.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1205  NUDIX family hydrolase  30.69 
 
 
204 aa  124  8.000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00320321  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0946  ADP-ribose pyrophosphatase  35.45 
 
 
207 aa  122  5e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000804497  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0685  NUDIX hydrolase  35.35 
 
 
218 aa  121  6e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1980  NUDIX hydrolase  34.15 
 
 
209 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.280065 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13920  ADP-ribose pyrophosphatase  37.24 
 
 
220 aa  110  1.0000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.625001  normal  0.785558 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5155  NUDIX hydrolase  34.31 
 
 
222 aa  103  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.418641 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1838  NUDIX hydrolase  32.4 
 
 
230 aa  79.3  0.00000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  38.58 
 
 
156 aa  75.9  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  38.58 
 
 
156 aa  74.3  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  37.74 
 
 
155 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  37.74 
 
 
155 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  37.74 
 
 
155 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2076  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 
141 aa  64.3  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4857  NUDIX hydrolase  33.93 
 
 
158 aa  63.2  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0575  NUDIX hydrolase  34.58 
 
 
157 aa  62.4  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.773925  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1532  NUDIX hydrolase  29.08 
 
 
154 aa  62.4  0.000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  36.79 
 
 
155 aa  62  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5595  NUDIX hydrolase  36.79 
 
 
155 aa  62  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  35.85 
 
 
155 aa  62  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  30.61 
 
 
158 aa  62  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0833  NUDIX hydrolase  33.91 
 
 
155 aa  61.2  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3377  MutT/Nudix family protein  31.75 
 
 
147 aa  60.1  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3954  mutator MutT protein  50 
 
 
124 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.380567  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1584  mutT/nudix family protein  30.95 
 
 
147 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0325451 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3311  NUDIX hydrolase  32.54 
 
 
147 aa  60.1  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3974  NUDIX hydrolase  34.58 
 
 
169 aa  59.7  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3733  mutT/nudix family protein  32.28 
 
 
147 aa  58.5  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.412613  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1350  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 
146 aa  58.5  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2957  MutT/nudix family protein  27.68 
 
 
159 aa  58.2  0.00000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0877  MutT-like protein  27.86 
 
 
144 aa  57.8  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8698  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  29.79 
 
 
159 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1029  mutT/nudix family protein, truncation  30 
 
 
83 aa  57  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.320813  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4359  NUDIX hydrolase  34.58 
 
 
163 aa  57.4  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2640  mutt/nudix family protein  28.44 
 
 
156 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000776833 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3636  mutT/nudix family protein  30.16 
 
 
147 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2640  MutT/nudix family protein  26.79 
 
 
159 aa  55.8  0.0000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0434568  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3121  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  30.56 
 
 
156 aa  55.5  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.508496 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0700  NUDIX hydrolase  35.51 
 
 
132 aa  55.8  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3327  MutT/Nudix family protein  30.16 
 
 
147 aa  54.7  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3416  mutT/nudix family protein  30.16 
 
 
147 aa  54.7  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3685  mutT/nudix family protein  30.16 
 
 
147 aa  54.7  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293788  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3170  NUDIX hydrolase  31.96 
 
 
179 aa  54.3  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8672  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  27.78 
 
 
158 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2696  mutT/nudix family protein  45 
 
 
128 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0531307  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  29.41 
 
 
156 aa  53.1  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0589  NUDIX hydrolase  28.46 
 
 
141 aa  52.4  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000226266  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1477  ADP-ribose pyrophosphatase  30.33 
 
 
158 aa  52.4  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2758  putative mut-like protein  26.77 
 
 
163 aa  52.4  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0066  NUDIX family hydrolase  30.33 
 
 
158 aa  52.4  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.156967  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4313  NUDIX hydrolase  30 
 
 
153 aa  52.4  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1565  ADP-ribose pyrophosphatase  30.33 
 
 
158 aa  52.4  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4650  NUDIX hydrolase  34.17 
 
 
163 aa  52.4  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4208  NUDIX hydrolase  32.14 
 
 
174 aa  52  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2973  putative mutT-like protein  37.5 
 
 
158 aa  51.6  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2015  mutT/nudix family protein  36.62 
 
 
150 aa  51.2  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0857519  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2852  NUDIX hydrolase  34.92 
 
 
157 aa  51.2  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000177474  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0380  NUDIX hydrolase  24.82 
 
 
199 aa  50.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000301987  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7095  NUDIX hydrolase  28 
 
 
155 aa  50.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.337747  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8967  NUDIX hydrolase  28.32 
 
 
155 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035368  normal  0.614637 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0988  NUDIX hydrolase  36.62 
 
 
150 aa  51.2  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000252657  hitchhiker  0.00430366 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2195  NUDIX hydrolase  38.36 
 
 
139 aa  51.2  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0407249  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2030  mutT/nudix family protein  26.42 
 
 
153 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.83484e-43 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2074  mutT/nudix family protein  28 
 
 
229 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000276659  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1854  mutT/nudix family protein  26.42 
 
 
153 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1825  MutT/Nudix family protein  26.42 
 
 
153 aa  50.1  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000200422  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5487  NUDIX hydrolase  29.46 
 
 
270 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.746959  normal  0.673254 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1997  mutT/nudix family protein  26.42 
 
 
153 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000428877  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3998  NUDIX hydrolase  34.85 
 
 
154 aa  50.4  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0404394  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0105  NUDIX hydrolase  40.28 
 
 
154 aa  50.1  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5398  NUDIX hydrolase  29.46 
 
 
270 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2094  mutT/nudix family protein  27.1 
 
 
153 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000267721  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3268  MutT/nudix family protein  35.96 
 
 
132 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7080  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 
174 aa  50.1  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3330  mutT/nudix family protein  27.1 
 
 
153 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000371651  unclonable  1.49498e-25 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3707  NUDIX hydrolase  31.53 
 
 
150 aa  49.7  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.000000974348 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5774  NUDIX hydrolase  29.46 
 
 
270 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.528861 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1757  NUDIX hydrolase  29.63 
 
 
144 aa  50.1  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207601  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1163  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 
140 aa  49.7  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>