29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1029 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_1029  mutT/nudix family protein, truncation  100 
 
 
83 aa  169  1e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.320813  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1205  NUDIX family hydrolase  100 
 
 
204 aa  163  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00320321  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2116  mutT/nudix family protein  49.38 
 
 
205 aa  88.2  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.610477  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1536  NUDIX hydrolase  47.56 
 
 
205 aa  87.4  6e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.058172  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1863  MutT/NUDIX family hydrolase  48.15 
 
 
205 aa  85.5  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2037  mutT/nudix family protein  48.15 
 
 
205 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2148  mutT/nudix family protein  48.15 
 
 
205 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.992633  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1900  mutT/nudix family protein  46.91 
 
 
205 aa  84.7  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2079  mutT/nudix family protein  46.91 
 
 
205 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2047  mutT/nudix family protein  46.91 
 
 
205 aa  84.7  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1853  MutT/NUDIX family hydrolase  46.91 
 
 
205 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.252059  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3272  mutT/nudix family protein  46.91 
 
 
205 aa  84  7e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1897  NUDIX hydrolase  46.91 
 
 
205 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.018697  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1874  NUDIX hydrolase  49.37 
 
 
206 aa  82.4  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000557306  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1385  NUDIX hydrolase  46.84 
 
 
209 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0946  ADP-ribose pyrophosphatase  41.25 
 
 
207 aa  79.3  0.00000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000804497  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0773  NUDIX hydrolase  43.21 
 
 
205 aa  79.3  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.195628  hitchhiker  0.00363366 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1799  NUDIX hydrolase  36.71 
 
 
205 aa  70.1  0.000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.000483875  normal  0.809218 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1218  NUDIX hydrolase  44.93 
 
 
194 aa  67.4  0.00000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.843116 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0503  ADP-ribose pyrophosphatase  39.24 
 
 
206 aa  60.1  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0453  NUDIX hydrolase  36.71 
 
 
215 aa  58.5  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5350  NUDIX hydrolase  33.73 
 
 
205 aa  58.2  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.46762  normal  0.101192 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0685  NUDIX hydrolase  34.21 
 
 
218 aa  58.2  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1483  NUDIX hydrolase  30 
 
 
210 aa  57  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.163061 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1980  NUDIX hydrolase  40.26 
 
 
209 aa  56.6  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.280065 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51490  hypothetical protein  38.03 
 
 
212 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000141034  hitchhiker  0.000162281 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3076  NUDIX hydrolase  34.09 
 
 
216 aa  52  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5155  NUDIX hydrolase  30.26 
 
 
222 aa  48.5  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.418641 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13920  ADP-ribose pyrophosphatase  28.57 
 
 
220 aa  47  0.00009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.625001  normal  0.785558 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>