259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_13920 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_13920  ADP-ribose pyrophosphatase  100 
 
 
220 aa  439  9.999999999999999e-123  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.625001  normal  0.785558 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5155  NUDIX hydrolase  64.19 
 
 
222 aa  275  4e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.418641 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0685  NUDIX hydrolase  40 
 
 
218 aa  140  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51490  hypothetical protein  44.06 
 
 
212 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000141034  hitchhiker  0.000162281 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0453  NUDIX hydrolase  41.75 
 
 
215 aa  134  8e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1799  NUDIX hydrolase  41.45 
 
 
205 aa  133  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.000483875  normal  0.809218 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0773  NUDIX hydrolase  42.35 
 
 
205 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.195628  hitchhiker  0.00363366 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1205  NUDIX family hydrolase  31.84 
 
 
204 aa  122  5e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00320321  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1900  mutT/nudix family protein  34.02 
 
 
205 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2047  mutT/nudix family protein  34.02 
 
 
205 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1853  MutT/NUDIX family hydrolase  34.02 
 
 
205 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.252059  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5350  NUDIX hydrolase  34.34 
 
 
205 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.46762  normal  0.101192 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2079  mutT/nudix family protein  33.51 
 
 
205 aa  119  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1218  NUDIX hydrolase  41.05 
 
 
194 aa  119  3e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.843116 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1863  MutT/NUDIX family hydrolase  32.99 
 
 
205 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2116  mutT/nudix family protein  32.99 
 
 
205 aa  118  7e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.610477  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2148  mutT/nudix family protein  32.99 
 
 
205 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.992633  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3272  mutT/nudix family protein  32.99 
 
 
205 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1874  NUDIX hydrolase  32.18 
 
 
206 aa  115  6e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000557306  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2037  mutT/nudix family protein  32.47 
 
 
205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1897  NUDIX hydrolase  32.47 
 
 
205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.018697  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1536  NUDIX hydrolase  34.24 
 
 
205 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.058172  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1483  NUDIX hydrolase  37.24 
 
 
210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.163061 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3076  NUDIX hydrolase  36.79 
 
 
216 aa  108  9.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1385  NUDIX hydrolase  35.5 
 
 
209 aa  107  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0503  ADP-ribose pyrophosphatase  36.87 
 
 
206 aa  105  4e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1980  NUDIX hydrolase  36.1 
 
 
209 aa  103  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.280065 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0946  ADP-ribose pyrophosphatase  32.31 
 
 
207 aa  97.8  1e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000804497  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8438  NUDIX hydrolase  41.59 
 
 
157 aa  69.3  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.370098 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0575  NUDIX hydrolase  41.12 
 
 
161 aa  62.4  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  33.58 
 
 
156 aa  62  0.000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5571  NUDIX hydrolase  37.24 
 
 
156 aa  59.7  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0243609  normal  0.418641 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0149  NUDIX hydrolase  38.14 
 
 
171 aa  58.9  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.874224  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3483  NUDIX hydrolase  35.14 
 
 
142 aa  58.5  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1854  mutT/nudix family protein  29.85 
 
 
153 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1825  MutT/Nudix family protein  29.85 
 
 
153 aa  58.2  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000200422  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1997  mutT/nudix family protein  29.85 
 
 
153 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000428877  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0784  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 
155 aa  57.8  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2030  mutT/nudix family protein  29.85 
 
 
153 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.83484e-43 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1809  MutT/Nudix family protein  29.85 
 
 
153 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00380434  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1303  NUDIX hydrolase  38.2 
 
 
140 aa  57  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3330  mutT/nudix family protein  29.85 
 
 
153 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000371651  unclonable  1.49498e-25 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0618  NUDIX hydrolase  32.79 
 
 
166 aa  57  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4163  NUDIX hydrolase  30.89 
 
 
133 aa  57  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2349  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0480  NUDIX hydrolase  33.55 
 
 
184 aa  57.4  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.227834  hitchhiker  0.00765199 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1999  mutT/nudix family protein  29.85 
 
 
153 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00120864  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2640  mutt/nudix family protein  28.03 
 
 
156 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000776833 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2094  mutT/nudix family protein  29.1 
 
 
153 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000267721  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0752  NUDIX hydrolase  30.06 
 
 
400 aa  56.2  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0515  ADP-ribose pyrophosphatase  29.7 
 
 
168 aa  56.2  0.0000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0508  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 
157 aa  55.8  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0799439  hitchhiker  0.00145151 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1946  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 
162 aa  55.5  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.97992  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1103  nudix hydrolase  33.87 
 
 
524 aa  55.5  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.426954 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0547  MutT/NUDIX family protein  35.24 
 
 
136 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1838  NUDIX hydrolase  28.02 
 
 
230 aa  55.5  0.0000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0357  ADP-ribose pyrophosphatase  35.24 
 
 
136 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0371  ADP-ribose pyrophosphatase  35.24 
 
 
136 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2758  putative mut-like protein  32.28 
 
 
163 aa  54.3  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0589  NUDIX hydrolase  32.81 
 
 
141 aa  54.7  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000226266  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4342  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 
156 aa  53.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.87034 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3639  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
142 aa  53.9  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0833  NUDIX hydrolase  35.09 
 
 
155 aa  53.1  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2429  mutT like protein  31.43 
 
 
134 aa  53.1  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  34.23 
 
 
156 aa  53.1  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  34.45 
 
 
155 aa  53.5  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2074  mutT/nudix family protein  28.36 
 
 
229 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000276659  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  34.23 
 
 
156 aa  52.8  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5566  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
153 aa  52.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.600891  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  29.66 
 
 
158 aa  52.4  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5931  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
143 aa  52.4  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1860  NUDIX hydrolase  31.03 
 
 
153 aa  52.4  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00730748  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3147  NUDIX hydrolase  35.45 
 
 
144 aa  52.4  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.232456  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4267  hydrolase, NUDIX family  27.54 
 
 
154 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.555582  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2278  NUDIX hydrolase  30.33 
 
 
134 aa  52  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.369324  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2940  mutT-like protein  29.82 
 
 
155 aa  52  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.703961  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4504  NUDIX hydrolase  31.4 
 
 
134 aa  52  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0549022  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  32.09 
 
 
155 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  32.09 
 
 
155 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  32.09 
 
 
155 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0575  NUDIX hydrolase  32.8 
 
 
157 aa  51.6  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.773925  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0967  hydrolase, NUDIX family  27.54 
 
 
154 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00369926  normal  0.920839 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3746  NUDIX hydrolase  32.46 
 
 
142 aa  51.6  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0715  NUDIX hydrolase  44.19 
 
 
299 aa  51.6  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2108  NUDIX hydrolase  34.48 
 
 
157 aa  50.8  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000452555  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1730  NUDIX hydrolase  29.91 
 
 
137 aa  51.2  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4253  NUDIX hydrolase  31.97 
 
 
160 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103812  normal  0.749922 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2044  MutT/Nudix family protein  28.37 
 
 
149 aa  50.4  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00937843  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4313  NUDIX hydrolase  34.58 
 
 
153 aa  50.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0631  NUDIX hydrolase  32.73 
 
 
144 aa  50.4  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00520  ADP-ribose pyrophosphatase  37.89 
 
 
145 aa  50.4  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.129301 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2371  mutT/nudix family protein  25.95 
 
 
149 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0511564  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2286  mutT/nudix family protein  28.37 
 
 
149 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.02194e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2105  mutT/nudix family protein  28.37 
 
 
140 aa  50.1  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1537  hypothetical protein  44.16 
 
 
162 aa  49.7  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.156028  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0207  NUDIX hydrolase  32.04 
 
 
147 aa  49.7  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000107343 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3081  mutT/nudix family protein  26.95 
 
 
149 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000075135 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1350  NUDIX hydrolase  34.44 
 
 
146 aa  50.1  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1178  NUDIX hydrolase  32.17 
 
 
156 aa  49.7  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0049447  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0922  NUDIX hydrolase  42.99 
 
 
136 aa  50.1  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  31.78 
 
 
155 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>