190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3476 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3476  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 175 aa  354  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3784  NUDIX hydrolase  95.57 
 
 		 158 aa  306  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.360863 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3674  NUDIX hydrolase  83.43 
 
 		 175 aa  293  6e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.78124 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5001  NUDIX hydrolase  67.39 
 
 		 156 aa  189  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3051  NUDIX hydrolase  62.99 
 
 		 154 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5306  NUDIX hydrolase  60.53 
 
 		 156 aa  176  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838276  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2186  NUDIX hydrolase  58.02 
 
 		 165 aa  147  7e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2633  NUDIX hydrolase  51.8 
 
 		 162 aa  139  9.999999999999999e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.748492  normal  0.918126 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4195  NUDIX hydrolase  48.34 
 
 		 162 aa  137  6e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.566986 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1383  NUDIX hydrolase  53.62 
 
 		 193 aa  136  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.744983 
 
 
-
 
NC_004310  BR1563  MutT/nudix family protein  50.35 
 
 		 151 aa  135  3.0000000000000003e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.752749  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1511  MutT/nudix family protein  50.35 
 
 		 151 aa  135  3.0000000000000003e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1602  NUDIX hydrolase  51.06 
 
 		 151 aa  134  5e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.973125  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4874  NUDIX hydrolase  46.36 
 
 		 162 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2258  putative NUDIX hydrolase  53.49 
 
 		 173 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3259  NUDIX hydrolase  49.01 
 
 		 168 aa  133  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.303659  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4049  NUDIX hydrolase  48.2 
 
 		 169 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3063  NUDIX hydrolase  44.72 
 
 		 158 aa  127  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.187494  normal  0.375393 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2799  NUDIX hydrolase  42.68 
 
 		 159 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal  0.0516272 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2282  NUDIX hydrolase  46 
 
 		 163 aa  125  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.725543  normal  0.213019 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2221  NUDIX hydrolase  52.9 
 
 		 146 aa  122  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.25917 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3242  hypothetical protein  48.15 
 
 		 132 aa  122  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2217  NUDIX hydrolase  42.54 
 
 		 158 aa  110  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.524488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0779  NUDIX hydrolase  43.88 
 
 		 156 aa  103  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0032986  normal  0.0903569 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4342  NUDIX hydrolase  45.38 
 
 		 156 aa  97.8  6e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.87034 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  38.06 
 
 		 160 aa  90.5  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3444  NUDIX hydrolase  41.79 
 
 		 179 aa  87.8  7e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.578568 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2655  NUDIX hydrolase  36.05 
 
 		 161 aa  70.1  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1496  NUDIX hydrolase  36.62 
 
 		 174 aa  62  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.174494 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  30.3 
 
 		 155 aa  59.3  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3464  NUDIX hydrolase  36.5 
 
 		 188 aa  57.8  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.918471  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0618  NUDIX hydrolase  34.11 
 
 		 166 aa  57  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8438  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.370098 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2394  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.772855 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0480  NUDIX hydrolase  30.87 
 
 		 184 aa  55.1  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.227834  hitchhiker  0.00765199 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3290  NUDIX hydrolase  31.5 
 
 		 120 aa  52  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1428  NUDIX hydrolase  33.81 
 
 		 170 aa  51.6  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.516023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51490  hypothetical protein  33.64 
 
 		 212 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000141034  hitchhiker  0.000162281 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2651  NUDIX hydrolase  38.37 
 
 		 150 aa  50.8  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000859831 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1565  NUDIX hydrolase  38.37 
 
 		 150 aa  50.4  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000493599  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1807  mutator MutT-like  41.28 
 
 		 148 aa  50.8  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.829238  normal  0.287731 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7955  hypothetical protein  33.61 
 
 		 172 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0149  NUDIX hydrolase  30.89 
 
 		 171 aa  49.7  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.874224  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  29.77 
 
 		 156 aa  49.3  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2547  NUDIX hydrolase  32.32 
 
 		 143 aa  48.9  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0419  mutator MutT protein  38.33 
 
 		 129 aa  49.3  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293063 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0450  MutT/NUDIX family protein  30.67 
 
 		 164 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290469  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0511  mutT/nudix family protein  30.67 
 
 		 164 aa  48.5  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0633443  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0542  mutT/nudix family protein  30.22 
 
 		 153 aa  48.5  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16009e-47 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0542  mutT/nudix family protein  30.67 
 
 		 164 aa  48.5  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000238457  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0454  MutT/NUDIX family protein  29.5 
 
 		 153 aa  47.8  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000159368  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1285  NUDIX hydrolase  34.95 
 
 		 185 aa  47.8  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.270966  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6546  NUDIX hydrolase  34.95 
 
 		 185 aa  47.8  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.293619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3444  mutator MutT protein  38.33 
 
 		 129 aa  48.1  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1593  NUDIX hydrolase  29.52 
 
 		 166 aa  47.8  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3543  NUDIX hydrolase  27.2 
 
 		 160 aa  48.1  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.291144  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  35.96 
 
 		 473 aa  47.8  0.00009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5733  NUDIX hydrolase  54.35 
 
 		 218 aa  47.8  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0900  NUDIX hydrolase  30.84 
 
 		 145 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2015  mutT/nudix family protein  34.86 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0857519  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3483  NUDIX hydrolase  27.87 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0596  mutT/nudix family protein  29.29 
 
 		 153 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000504952  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6646  NUDIX hydrolase  32.43 
 
 		 155 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0508  NUDIX hydrolase  26.52 
 
 		 157 aa  46.6  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0799439  hitchhiker  0.00145151 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0946  ADP-ribose pyrophosphatase  30.36 
 
 		 207 aa  46.6  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000804497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6153  NUDIX hydrolase  34.95 
 
 		 185 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.292779 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0457  NUDIX hydrolase  29.2 
 
 		 153 aa  46.6  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0641725  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2074  mutT/nudix family protein  26.85 
 
 		 229 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000276659  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1181  ADP-ribose pyrophosphatase  32.81 
 
 		 181 aa  45.8  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.152697  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2460  NUDIX hydrolase  39.06 
 
 		 165 aa  46.2  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00334111  normal  0.173261 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0578  mutT/nudix family protein  30.5 
 
 		 153 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000245736  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0784  NUDIX hydrolase  29.63 
 
 		 155 aa  45.8  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1932  NUDIX hydrolase  43.86 
 
 		 221 aa  45.8  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00450491 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3063  NUDIX hydrolase  32.33 
 
 		 165 aa  45.4  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.253855  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2512  NUDIX hydrolase  31.07 
 
 		 172 aa  45.4  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.335914  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2287  mutT/nudix family protein  36.79 
 
 		 156 aa  45.4  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2195  NUDIX hydrolase  35.51 
 
 		 156 aa  45.4  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1007  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 144 aa  45.4  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.175488  hitchhiker  0.000423095 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1319  NUDIX hydrolase  28.21 
 
 		 143 aa  45.4  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0988  NUDIX hydrolase  34.65 
 
 		 150 aa  45.1  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000252657  hitchhiker  0.00430366 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0703  putative ADP-ribose pyrophosphatase  51.02 
 
 		 186 aa  45.1  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6378 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0616  mutT/nudix family protein  30.22 
 
 		 169 aa  45.1  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000189637  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1287  NUDIX hydrolase  26.55 
 
 		 154 aa  45.4  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0960276  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0515  ADP-ribose pyrophosphatase  29.63 
 
 		 168 aa  44.7  0.0006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3170  NUDIX hydrolase  32.94 
 
 		 179 aa  44.7  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0997  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 		 153 aa  45.1  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.665088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24710  ADP-ribose pyrophosphatase  40 
 
 		 255 aa  44.7  0.0007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  40.3 
 
 		 156 aa  44.7  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0685  NUDIX hydrolase  31.03 
 
 		 218 aa  44.7  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  28.46 
 
 		 136 aa  44.7  0.0007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3328  NUDIX hydrolase  29.81 
 
 		 160 aa  44.7  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.672481  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0815  NUDIX hydrolase  46.67 
 
 		 230 aa  44.7  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4163  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 		 133 aa  44.3  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2349  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  40.3 
 
 		 156 aa  44.3  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1860  NUDIX hydrolase  27.1 
 
 		 153 aa  44.3  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00730748  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1218  NUDIX hydrolase  34.82 
 
 		 194 aa  44.3  0.0009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.843116 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1184  NUDIX hydrolase  39.29 
 
 		 147 aa  43.9  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000616693  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0110  NUDIX hydrolase  32.38 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  29.82 
 
 		 139 aa  44.3  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0833  NUDIX hydrolase  29.2 
 
 		 155 aa  43.9  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>