172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2633 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2633  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 162 aa  328  2e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.748492  normal  0.918126 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3259  NUDIX hydrolase  81.99 
 
 		 168 aa  260  6e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.303659  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4874  NUDIX hydrolase  71.52 
 
 		 162 aa  230  5e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1383  NUDIX hydrolase  71.88 
 
 		 193 aa  226  8e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.744983 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4195  NUDIX hydrolase  71.07 
 
 		 162 aa  222  1e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.566986 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4049  NUDIX hydrolase  70.44 
 
 		 169 aa  219  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2258  putative NUDIX hydrolase  69.38 
 
 		 173 aa  217  3.9999999999999997e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5001  NUDIX hydrolase  54.55 
 
 		 156 aa  151  4e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2186  NUDIX hydrolase  55.4 
 
 		 165 aa  150  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1602  NUDIX hydrolase  50.68 
 
 		 151 aa  149  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.973125  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1563  MutT/nudix family protein  52.03 
 
 		 151 aa  149  2e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.752749  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1511  MutT/nudix family protein  52.03 
 
 		 151 aa  149  2e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3051  NUDIX hydrolase  53.42 
 
 		 154 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5306  NUDIX hydrolase  53.15 
 
 		 156 aa  143  8.000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838276  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3063  NUDIX hydrolase  47.95 
 
 		 158 aa  140  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.187494  normal  0.375393 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3784  NUDIX hydrolase  51.08 
 
 		 158 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.360863 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2799  NUDIX hydrolase  48.28 
 
 		 159 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal  0.0516272 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3476  NUDIX hydrolase  51.8 
 
 		 175 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2282  NUDIX hydrolase  46.9 
 
 		 163 aa  138  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.725543  normal  0.213019 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3674  NUDIX hydrolase  49.64 
 
 		 175 aa  135  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.78124 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2221  NUDIX hydrolase  51.88 
 
 		 146 aa  130  6e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.25917 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0779  NUDIX hydrolase  45.62 
 
 		 156 aa  122  2e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0032986  normal  0.0903569 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2217  NUDIX hydrolase  47.73 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.524488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4342  NUDIX hydrolase  46.75 
 
 		 156 aa  122  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.87034 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3242  hypothetical protein  50.81 
 
 		 132 aa  121  4e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3444  NUDIX hydrolase  39.39 
 
 		 179 aa  89.7  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.578568 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  36.89 
 
 		 160 aa  83.6  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1428  NUDIX hydrolase  35.26 
 
 		 170 aa  63.9  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.516023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3464  NUDIX hydrolase  38.35 
 
 		 188 aa  61.6  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.918471  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0618  NUDIX hydrolase  31.78 
 
 		 166 aa  54.7  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1181  ADP-ribose pyrophosphatase  36.96 
 
 		 181 aa  53.9  0.0000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.152697  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1730  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 		 137 aa  53.9  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  33.06 
 
 		 155 aa  53.5  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2655  NUDIX hydrolase  30.28 
 
 		 161 aa  51.6  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1496  NUDIX hydrolase  33.08 
 
 		 174 aa  50.8  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.174494 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3967  MutT/nudix family protein  32.17 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.447658  normal  0.0696331 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 156 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3543  NUDIX hydrolase  33.59 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.291144  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1167  NUDIX hydrolase  30.84 
 
 		 164 aa  49.7  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2394  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 		 191 aa  49.7  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.772855 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1218  NUDIX hydrolase  30.4 
 
 		 194 aa  48.5  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.843116 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0752  NUDIX hydrolase  36.05 
 
 		 400 aa  48.5  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1837  MutT/NUDIX family hydrolase  33.64 
 
 		 158 aa  48.1  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158104  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51490  hypothetical protein  42.59 
 
 		 212 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000141034  hitchhiker  0.000162281 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3754  NUDIX hydrolase  33.68 
 
 		 132 aa  48.1  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0482  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 		 150 aa  47.8  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0149  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 171 aa  47.8  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.874224  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2266  mutator MutT protein  36.26 
 
 		 138 aa  47.8  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.97404 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3914  NUDIX hydrolase  30.58 
 
 		 140 aa  47.4  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.434564 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6646  NUDIX hydrolase  32.17 
 
 		 155 aa  47  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4365  NUDIX hydrolase  30.51 
 
 		 141 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3407  NUDIX hydrolase  30.58 
 
 		 140 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.107532 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4001  NUDIX hydrolase  30.51 
 
 		 141 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.543097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1103  nudix hydrolase  29.13 
 
 		 524 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.426954 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1678  hypothetical protein  36.28 
 
 		 306 aa  45.8  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.552334  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2664  NUDIX hydrolase family protein  27.5 
 
 		 161 aa  45.8  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.472799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3458  NUDIX hydrolase  31.53 
 
 		 153 aa  46.2  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000764325 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3209  NUDIX hydrolase  31.13 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.663648  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3831  NUDIX hydrolase  56.25 
 
 		 361 aa  46.2  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.363079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8547  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 156 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00677981  hitchhiker  0.000239658 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5852  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 		 122 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2460  NUDIX hydrolase  29.32 
 
 		 165 aa  45.8  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00334111  normal  0.173261 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1123  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 		 140 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.824308  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0647  MutT/nudix family protein  32.26 
 
 		 152 aa  45.4  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4221  NUDIX hydrolase  47.37 
 
 		 315 aa  45.4  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.292609  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0029  NUDIX hydrolase  34.95 
 
 		 137 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1950  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 255 aa  45.4  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.666959  hitchhiker  0.00341622 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0504  NUDIX hydrolase  29.27 
 
 		 163 aa  45.4  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.316146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  50 
 
 		 141 aa  45.1  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1638  NUDIX hydrolase  31.62 
 
 		 140 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0477053 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3290  NUDIX hydrolase  32.74 
 
 		 120 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2090  NUDIX hydrolase  30 
 
 		 141 aa  44.7  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.147471  normal  0.280778 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3492  NUDIX hydrolase  35 
 
 		 157 aa  44.7  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2888  NUDIX hydrolase  32.65 
 
 		 151 aa  45.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3830  NUDIX hydrolase  44.29 
 
 		 301 aa  44.7  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  45 
 
 		 134 aa  44.7  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7592  putative mutator protein mutT  38.2 
 
 		 136 aa  44.3  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0886771 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1184  NUDIX hydrolase  31.62 
 
 		 140 aa  44.3  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1664  NUDIX hydrolase  31.62 
 
 		 140 aa  44.3  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.731684  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3658  mutator MutT protein  37.8 
 
 		 135 aa  44.3  0.0007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236932  normal  0.362443 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1102  NUDIX hydrolase  34.48 
 
 		 136 aa  44.3  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.142351  normal  0.0545978 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0815  NUDIX hydrolase  29.81 
 
 		 230 aa  44.3  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  30.53 
 
 		 158 aa  43.9  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0597  NUDIX hydrolase  33.65 
 
 		 133 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0523  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0110  NUDIX hydrolase  37.08 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0480  NUDIX hydrolase  32.59 
 
 		 184 aa  43.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.227834  hitchhiker  0.00765199 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3429  NUDIX hydrolase  31.87 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2445  NUDIX hydrolase  42.67 
 
 		 169 aa  43.5  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.123324  normal  0.552765 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3522  NUDIX hydrolase  30.25 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.478841 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2492  NUDIX hydrolase  34.94 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3659  NUDIX hydrolase  27.55 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0900  NUDIX hydrolase  31.78 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3866  NUDIX hydrolase  43.08 
 
 		 167 aa  43.1  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.190486  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3746  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 		 142 aa  43.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3674  NUDIX hydrolase  46 
 
 		 157 aa  43.1  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.369267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3713  NUDIX hydrolase  27.55 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.34435 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3639  NUDIX hydrolase  33.9 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4220  NUDIX hydrolase  44.93 
 
 		 304 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.288399  normal  0.0172337 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1577  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.479976  normal  0.0612307 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>