More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_1664 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_1664  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 140 aa  283  5e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.731684  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1184  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 140 aa  283  5e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1638  NUDIX hydrolase  98.57 
 
 		 140 aa  281  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0477053 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4812  NUDIX hydrolase  93.57 
 
 		 140 aa  263  5.999999999999999e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.5658 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1563  NUDIX hydrolase  88.57 
 
 		 142 aa  252  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1582  NUDIX hydrolase  87.86 
 
 		 142 aa  250  4.0000000000000004e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.4234  normal  0.299083 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1577  NUDIX hydrolase  80.65 
 
 		 137 aa  205  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.479976  normal  0.0612307 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4001  NUDIX hydrolase  61.29 
 
 		 141 aa  158  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.543097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4365  NUDIX hydrolase  61.29 
 
 		 141 aa  158  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2090  NUDIX hydrolase  57.14 
 
 		 141 aa  155  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.147471  normal  0.280778 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3522  NUDIX hydrolase  59.52 
 
 		 141 aa  155  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.478841 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3914  NUDIX hydrolase  60.16 
 
 		 140 aa  154  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.434564 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3407  NUDIX hydrolase  60.16 
 
 		 140 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.107532 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1837  MutT/NUDIX family hydrolase  50 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158104  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5852  NUDIX hydrolase  45.69 
 
 		 122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5518  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 183 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1264  putative MutT/Nudix family protein  53.45 
 
 		 132 aa  110  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0696899 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6546  NUDIX hydrolase  53.91 
 
 		 185 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.293619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1285  NUDIX hydrolase  53.91 
 
 		 185 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.270966  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6153  NUDIX hydrolase  53.04 
 
 		 185 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.292779 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4233  NUDIX hydrolase  50.43 
 
 		 135 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257262  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2696  mutT/nudix family protein  45.61 
 
 		 128 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0531307  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4759  NUDIX hydrolase  45.04 
 
 		 203 aa  102  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.420324 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2082  NUDIX hydrolase  43.22 
 
 		 146 aa  101  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.494024 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2944  NUDIX hydrolase  46.96 
 
 		 140 aa  101  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.948773 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2430  NUDIX hydrolase  46.49 
 
 		 132 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.709971  normal  0.0238883 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6007  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 		 165 aa  96.7  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5170  NUDIX hydrolase  45.13 
 
 		 124 aa  95.1  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.140908  normal  0.555587 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5533  NUDIX hydrolase  45.71 
 
 		 147 aa  92.4  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00579175 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0401  hydrolase NUDIX family domain-containing protein  50.91 
 
 		 758 aa  89.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.932196  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2939  NUDIX hydrolase  44 
 
 		 130 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4397  NUDIX hydrolase  41.96 
 
 		 126 aa  87.4  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0874525  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3967  MutT/nudix family protein  41.3 
 
 		 146 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.447658  normal  0.0696331 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3290  NUDIX hydrolase  40.71 
 
 		 120 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2492  NUDIX hydrolase  40.91 
 
 		 132 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3268  MutT/nudix family protein  39.09 
 
 		 132 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0094  hypothetical protein  42.86 
 
 		 132 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1428  NUDIX hydrolase  34.85 
 
 		 170 aa  61.2  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.516023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  32.8 
 
 		 136 aa  58.5  0.00000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  31.62 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0672  MutT/nudix family protein  28 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.959271  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0666  MutT/nudix family protein  28 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.613905  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2614  NUDIX hydrolase  34.58 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.349258  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5292  NUDIX hydrolase  37.96 
 
 		 163 aa  53.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0621231 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1291  NUDIX hydrolase  37.96 
 
 		 161 aa  52.8  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.327149 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6097  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 		 167 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347749  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1980  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 		 167 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2004  NUDIX hydrolase  37.96 
 
 		 162 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1563  MutT/nudix family protein  34.62 
 
 		 151 aa  50.8  0.000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.752749  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5298  NUDIX hydrolase  35.78 
 
 		 170 aa  50.8  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1511  MutT/nudix family protein  34.62 
 
 		 151 aa  50.8  0.000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2976  NUDIX hydrolase  39.74 
 
 		 106 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.505456  normal  0.467098 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1182  NUDIX hydrolase  34.43 
 
 		 147 aa  50.8  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3208  NUDIX hydrolase  39.33 
 
 		 168 aa  50.4  0.000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0011  NUDIX hydrolase  38.38 
 
 		 144 aa  50.4  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.695589  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  32.03 
 
 		 160 aa  49.7  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1602  NUDIX hydrolase  33.07 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.973125  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0898  mutator MutT protein, putative  32.2 
 
 		 131 aa  49.7  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0730911  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2616  NUDIX hydrolase  40.91 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1031  putative mutator mutT protein  32.2 
 
 		 131 aa  49.7  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  27.68 
 
 		 141 aa  48.9  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1103  nudix hydrolase  30.3 
 
 		 524 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.426954 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2784  NUDIX hydrolase  34.13 
 
 		 141 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.801073  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06372  hypothetical protein  30.33 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2689  NUDIX hydrolase  34.13 
 
 		 141 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2570  NUDIX hydrolase  36.45 
 
 		 146 aa  47.4  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.240186  normal  0.520915 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3126  NUDIX hydrolase  28.92 
 
 		 303 aa  47.4  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.573169  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2258  putative NUDIX hydrolase  33.94 
 
 		 173 aa  47.4  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1556  NUDIX hydrolase  32.73 
 
 		 206 aa  47.4  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1721  NUDIX hydrolase  30.36 
 
 		 148 aa  47  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2850  NUDIX family hydrolase  30.36 
 
 		 148 aa  47  0.00008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.482932 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1613  NUDIX family hydrolase  30.36 
 
 		 148 aa  47  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3707  NUDIX hydrolase  29.66 
 
 		 150 aa  47  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.000000974348 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1656  NUDIX hydrolase  29.36 
 
 		 152 aa  47  0.00009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.632067  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  29.41 
 
 		 136 aa  46.2  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2667  hypothetical protein  29.29 
 
 		 105 aa  46.2  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0224817  normal  0.186167 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2285  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 		 178 aa  46.6  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3138  NUDIX hydrolase  27.27 
 
 		 284 aa  46.6  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4195  NUDIX hydrolase  30 
 
 		 162 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.566986 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4049  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 		 169 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1651  NUDIX hydrolase  38.24 
 
 		 163 aa  45.4  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0269  NUDIX hydrolase  43.33 
 
 		 233 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2529  NUDIX hydrolase  31.01 
 
 		 143 aa  46.2  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412332  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1448  ADP-ribose pyrophosphatase  29.45 
 
 		 430 aa  45.4  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0269  NUDIX hydrolase  44.07 
 
 		 233 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0659  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  28.57 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3705  mutT/nudix family protein  27.19 
 
 		 137 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3219  NUDIX hydrolase  34.65 
 
 		 149 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2044  NUDIX hydrolase  36.94 
 
 		 147 aa  45.4  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490099 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2415  NUDIX hydrolase  32.46 
 
 		 173 aa  45.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07956  AP4A hydrolase  28.32 
 
 		 208 aa  45.4  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1218  NUDIX hydrolase  33.03 
 
 		 194 aa  45.1  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.843116 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2186  NUDIX hydrolase  32.56 
 
 		 165 aa  45.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3311  NUDIX hydrolase  43.86 
 
 		 147 aa  44.7  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2053  MutT/nudix family protein  32.03 
 
 		 132 aa  45.1  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.381111  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5351  NUDIX hydrolase  41.79 
 
 		 239 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8672  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  29.33 
 
 		 158 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3078  NUDIX hydrolase  28.79 
 
 		 134 aa  44.7  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5262  NUDIX hydrolase  41.79 
 
 		 240 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>