114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5298 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014211  Ndas_5298  NUDIX hydrolase  100 
 
 
170 aa  339  8e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0097  hypothetical protein  61.33 
 
 
299 aa  198  3.9999999999999996e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1033  NUDIX hydrolase  49.67 
 
 
161 aa  124  5e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.997989 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0533  NUDIX hydrolase  45.93 
 
 
174 aa  124  7e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0543  NUDIX hydrolase  45.93 
 
 
174 aa  124  9e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.643343  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0555  NUDIX hydrolase  45.93 
 
 
174 aa  124  9e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.51062  normal  0.852901 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25510  ADP-ribose pyrophosphatase  48.7 
 
 
165 aa  120  9.999999999999999e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0162353  normal  0.120334 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4393  NUDIX hydrolase  45.86 
 
 
160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10418  mutator protein mutT3  45.91 
 
 
217 aa  114  8.999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0449167  normal  0.708231 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0099  NUDIX hydrolase  39.87 
 
 
291 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.474769  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0188  hypothetical protein  40.46 
 
 
287 aa  112  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.626289  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24850  ADP-ribose pyrophosphatase  46.41 
 
 
305 aa  108  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.203973  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4360  NUDIX hydrolase  41.94 
 
 
153 aa  108  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.11563  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0837  NUDIX hydrolase  39.77 
 
 
176 aa  107  6e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.172365  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1010  NUDIX hydrolase  44.72 
 
 
181 aa  106  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1229  septum formation protein Maf  41.77 
 
 
475 aa  104  5e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000255715 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1609  Nucleotide-binding protein  40.13 
 
 
484 aa  104  6e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3752  NUDIX hydrolase  42.77 
 
 
156 aa  102  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3604  NUDIX hydrolase  35.62 
 
 
292 aa  99.4  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.763493  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1136  NUDIX hydrolase  43.24 
 
 
335 aa  97.8  6e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.472078  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0199  NUDIX hydrolase  45.75 
 
 
180 aa  97.8  7e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0706  NUDIX hydrolase  46.67 
 
 
179 aa  96.7  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0747129 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2308  NUDIX hydrolase  39.04 
 
 
167 aa  89  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000433057  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2056  NUDIX hydrolase  41.06 
 
 
165 aa  88.6  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000128394 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2026  NUDIX hydrolase  40.41 
 
 
152 aa  61.6  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0458229  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3062  A/G-specific adenine glycosylase  27.2 
 
 
352 aa  52  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3789  mutator MutT protein  30.43 
 
 
131 aa  51.6  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3059  A/G-specific adenine glycosylase  27.2 
 
 
352 aa  51.2  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1184  NUDIX hydrolase  35.78 
 
 
140 aa  50.8  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1664  NUDIX hydrolase  35.78 
 
 
140 aa  50.8  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.731684  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1638  NUDIX hydrolase  36.11 
 
 
140 aa  50.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0477053 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1547  NUDIX hydrolase  34.43 
 
 
334 aa  50.1  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  28.68 
 
 
156 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0239  hypothetical protein  34.23 
 
 
197 aa  49.3  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  28.68 
 
 
156 aa  49.3  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1930  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 
151 aa  48.9  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.104334  normal  0.229344 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4812  NUDIX hydrolase  31.45 
 
 
140 aa  48.1  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.5658 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0858  hypothetical protein  33 
 
 
317 aa  47.4  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2179  hypothetical protein  33.33 
 
 
314 aa  47.4  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.299804  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2516  NUDIX hydrolase  23.53 
 
 
130 aa  47  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2568  NUDIX hydrolase  23.53 
 
 
130 aa  47  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17541  A/G-specific DNA glycosylase  27.5 
 
 
399 aa  47  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2090  NUDIX hydrolase  35.35 
 
 
141 aa  45.8  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.147471  normal  0.280778 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1152  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
296 aa  45.8  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000396101 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1957  7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase  24.8 
 
 
137 aa  45.4  0.0004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.892636  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0240  mutator mutT protein  24.8 
 
 
137 aa  45.4  0.0004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.611039  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0906  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
159 aa  45.1  0.0005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000252658  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0410  mutator mutT protein  40 
 
 
130 aa  45.1  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 
158 aa  44.7  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1556  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 
206 aa  44.3  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0197  NUDIX hydrolase  32.58 
 
 
137 aa  44.3  0.0008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.19554 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8698  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  32.03 
 
 
159 aa  44.3  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0306  hypothetical protein  32.41 
 
 
321 aa  43.5  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5262  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 
240 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5351  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 
239 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5641  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 
239 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5518  NUDIX hydrolase  34.31 
 
 
183 aa  43.9  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1582  NUDIX hydrolase  33.03 
 
 
142 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.4234  normal  0.299083 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4365  NUDIX hydrolase  33.71 
 
 
141 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3510  mutator MutT protein  46.34 
 
 
130 aa  42.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.39786  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  30.08 
 
 
137 aa  42.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0414  mutator MutT protein  38.46 
 
 
132 aa  43.1  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1563  NUDIX hydrolase  34.21 
 
 
142 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4001  NUDIX hydrolase  33.71 
 
 
141 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.543097  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3925  mutator MutT protein  37.68 
 
 
130 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4066  mutator MutT protein  37.68 
 
 
130 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3078  NUDIX hydrolase  30 
 
 
134 aa  42.7  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0358  NUDIX hydrolase  44.62 
 
 
162 aa  43.1  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8672  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  31.25 
 
 
158 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2053  MutT/nudix family protein  26.27 
 
 
132 aa  42.4  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.381111  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3611  mutator MutT protein  38.46 
 
 
132 aa  42.4  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3407  NUDIX hydrolase  34.02 
 
 
140 aa  42.7  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.107532 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0413  mutator MutT protein  38.46 
 
 
132 aa  42.4  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00478582 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3948  mutator MutT protein  37.68 
 
 
130 aa  42.4  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3914  NUDIX hydrolase  34.02 
 
 
140 aa  42.4  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.434564 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2094  mutT/nudix family protein  30.36 
 
 
153 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000267721  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5598  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
165 aa  42.4  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3039  Protein of unknown function DUF2029  29.38 
 
 
570 aa  42.4  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2074  mutT/nudix family protein  41.07 
 
 
229 aa  42  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000276659  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1825  MutT/Nudix family protein  41.07 
 
 
153 aa  42  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000200422  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  30.83 
 
 
132 aa  42  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0292  mutator mutT protein  29.66 
 
 
128 aa  42  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3395  mutator mutT protein  35.59 
 
 
131 aa  42  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1031  putative mutator mutT protein  28.71 
 
 
131 aa  42.4  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0898  mutator MutT protein, putative  28.71 
 
 
131 aa  42.4  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0730911  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2921  NUDIX hydrolase  32.04 
 
 
193 aa  42  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0185259  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0058  NUDIX hydrolase  31.37 
 
 
183 aa  42  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.993982  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2698  A/G-specific adenine glycosylase  29.91 
 
 
396 aa  42  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.265639 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  30.83 
 
 
132 aa  42  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3121  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  28.93 
 
 
156 aa  42  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.508496 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2030  mutT/nudix family protein  41.07 
 
 
153 aa  42  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.83484e-43 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1237  NUDIX hydrolase  31.68 
 
 
137 aa  42  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1854  mutT/nudix family protein  41.07 
 
 
153 aa  42  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1809  MutT/Nudix family protein  41.07 
 
 
153 aa  41.6  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00380434  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1997  mutT/nudix family protein  41.07 
 
 
153 aa  42  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000428877  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1999  mutT/nudix family protein  41.07 
 
 
153 aa  41.6  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00120864  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3330  mutT/nudix family protein  41.07 
 
 
153 aa  41.6  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000371651  unclonable  1.49498e-25 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0614  NUDIX hydrolase  37.93 
 
 
135 aa  41.6  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0852421  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3873  mutator MutT protein  36.23 
 
 
130 aa  41.2  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000107436 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2204  NUDIX hydrolase  31.48 
 
 
141 aa  41.6  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>