26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0094 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0094  hypothetical protein  100 
 
 		 132 aa  277  4e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1264  putative MutT/Nudix family protein  58.21 
 
 		 132 aa  87  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0696899 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4812  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 		 140 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.5658 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1664  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 		 140 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.731684  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1184  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 		 140 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1638  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 		 140 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0477053 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1582  NUDIX hydrolase  41.43 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.4234  normal  0.299083 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3522  NUDIX hydrolase  43.84 
 
 		 141 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.478841 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4001  NUDIX hydrolase  43.84 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.543097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1563  NUDIX hydrolase  41.43 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4365  NUDIX hydrolase  43.84 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1577  NUDIX hydrolase  39.29 
 
 		 137 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.479976  normal  0.0612307 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3914  NUDIX hydrolase  47.54 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.434564 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1837  MutT/NUDIX family hydrolase  49.15 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158104  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3407  NUDIX hydrolase  47.54 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.107532 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2090  NUDIX hydrolase  39.73 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.147471  normal  0.280778 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5533  NUDIX hydrolase  55.1 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00579175 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2944  NUDIX hydrolase  49.02 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.948773 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4233  NUDIX hydrolase  37.78 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257262  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6007  NUDIX hydrolase  39.34 
 
 		 165 aa  50.8  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2082  NUDIX hydrolase  41.07 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.494024 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5852  NUDIX hydrolase  46.81 
 
 		 122 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5170  NUDIX hydrolase  38.6 
 
 		 124 aa  45.4  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.140908  normal  0.555587 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4759  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 		 203 aa  44.3  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.420324 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2430  NUDIX hydrolase  42.55 
 
 		 132 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.709971  normal  0.0238883 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2696  mutT/nudix family protein  36 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0531307  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>