More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3429 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_3429  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 129 aa  256  7e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3754  NUDIX hydrolase  94.53 
 
 		 132 aa  242  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1282  NUDIX hydrolase  52.03 
 
 		 136 aa  122  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.838379  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1988  NUDIX hydrolase  49.18 
 
 		 164 aa  107  4.0000000000000004e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0344946  normal  0.279217 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3541  NUDIX hydrolase  47.06 
 
 		 138 aa  107  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.527483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5143  NUDIX hydrolase  38.02 
 
 		 122 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.753323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3228  NUDIX hydrolase  38.84 
 
 		 122 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.043036  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5139  NUDIX hydrolase  38.84 
 
 		 122 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.874502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4313  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4342  NUDIX hydrolase  34.65 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.87034 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0299  mutator mutT protein  41.67 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0361617  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2984  NUDIX hydrolase  37.35 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000021571  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2074  mutT/nudix family protein  33.03 
 
 		 229 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000276659  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0105  NUDIX hydrolase  33.91 
 
 		 154 aa  53.5  0.0000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0997  NUDIX hydrolase  32.8 
 
 		 153 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.665088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1486  NUDIX hydrolase  32.26 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00282357  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2094  mutT/nudix family protein  32.11 
 
 		 153 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000267721  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1809  MutT/Nudix family protein  32.11 
 
 		 153 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00380434  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1775  NUDIX hydrolase  35.35 
 
 		 129 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.296323  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2065  NUDIX hydrolase  35.35 
 
 		 129 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3330  mutT/nudix family protein  32.11 
 
 		 153 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000371651  unclonable  1.49498e-25 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2157  NUDIX hydrolase  35.35 
 
 		 129 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1825  MutT/Nudix family protein  31.19 
 
 		 153 aa  51.6  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000200422  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2030  mutT/nudix family protein  31.19 
 
 		 153 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.83484e-43 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2053  MutT/nudix family protein  34.41 
 
 		 132 aa  51.2  0.000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.381111  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1854  mutT/nudix family protein  31.19 
 
 		 153 aa  51.6  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1997  mutT/nudix family protein  31.19 
 
 		 153 aa  51.6  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000428877  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1931  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 		 133 aa  51.6  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000285208  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1501  NUDIX hydrolase  40.98 
 
 		 102 aa  51.6  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0954993  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1154  NUDIX hydrolase  41.98 
 
 		 124 aa  51.6  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.271981  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  34.09 
 
 		 143 aa  51.2  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2482  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 138 aa  50.8  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1790  NUDIX hydrolase  37.21 
 
 		 154 aa  50.8  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2447  NUDIX hydrolase  36.92 
 
 		 129 aa  50.8  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000652481  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0508  NUDIX hydrolase  30.47 
 
 		 157 aa  50.8  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0799439  hitchhiker  0.00145151 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4327  NUDIX hydrolase  36.47 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.356422 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  29.66 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0697  MutT related protein  29.92 
 
 		 145 aa  48.9  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.382229  normal  0.361701 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3078  NUDIX hydrolase  38.83 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2042  NUDIX hydrolase  34.34 
 
 		 129 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000547499 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3746  NUDIX hydrolase  39.74 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1383  NUDIX hydrolase  32.31 
 
 		 193 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.744983 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3639  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1218  NUDIX hydrolase  34.09 
 
 		 194 aa  49.3  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.843116 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4163  NUDIX hydrolase  30.63 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2349  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  29.55 
 
 		 156 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4857  NUDIX hydrolase  30.83 
 
 		 158 aa  48.9  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03438  MutT-nudix family protein  34.86 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0742  NUDIX hydrolase  40.79 
 
 		 169 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.478674 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1170  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000110534  normal  0.0271169 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3309  NUDIX hydrolase  31.37 
 
 		 153 aa  48.5  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0467  NUDIX hydrolase  34.55 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  30.69 
 
 		 155 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1805  NUDIX hydrolase  43.33 
 
 		 253 aa  48.9  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4321  NUDIX hydrolase  34.15 
 
 		 291 aa  48.1  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0207  NUDIX hydrolase  38.37 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107343 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4874  NUDIX hydrolase  36.54 
 
 		 162 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0219  NUDIX hydrolase  32.41 
 
 		 158 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.203556  normal  0.450694 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0465  NUDIX hydrolase  35 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0634  NUDIX hydrolase  34.15 
 
 		 143 aa  48.1  0.00004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  41.79 
 
 		 318 aa  47.8  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4940  NUDIX hydrolase  38.6 
 
 		 146 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000317059 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3147  NUDIX hydrolase  31.43 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.232456  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29780  ADP-ribose pyrophosphatase  53.66 
 
 		 163 aa  47.8  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1999  mutT/nudix family protein  31.19 
 
 		 153 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00120864  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13920  ADP-ribose pyrophosphatase  32.74 
 
 		 220 aa  47.8  0.00005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.625001  normal  0.785558 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4066  mutator MutT protein  32.94 
 
 		 130 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3925  mutator MutT protein  32.94 
 
 		 130 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0439  NUDIX hydrolase  33.88 
 
 		 145 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3562  NUDIX hydrolase  34.55 
 
 		 135 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1259  hypothetical protein  38.96 
 
 		 153 aa  47.4  0.00006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0682  NUDIX hydrolase  31.48 
 
 		 156 aa  47.8  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0132833  normal  0.0334373 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  32.32 
 
 		 155 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  32.32 
 
 		 155 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0048  NUDIX hydrolase  36.14 
 
 		 166 aa  47.8  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.393224  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  32.32 
 
 		 155 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2201  NUDIX hydrolase  45.9 
 
 		 132 aa  47.8  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2289  NUDIX hydrolase  45.9 
 
 		 132 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.648467  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  36.08 
 
 		 134 aa  47.4  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0870  mutator mutT protein  38.33 
 
 		 137 aa  47  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0910  NUDIX hydrolase  29.29 
 
 		 141 aa  47  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.479251  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  29.73 
 
 		 156 aa  47  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2516  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 		 130 aa  47  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2568  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 		 130 aa  47  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2633  NUDIX hydrolase  32.65 
 
 		 162 aa  47  0.00009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.748492  normal  0.918126 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2293  mutator MutT protein  31.11 
 
 		 129 aa  47  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.192428  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0414  mutator MutT protein  31.33 
 
 		 132 aa  47  0.00009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0741  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0431808 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0154  mutT/nudix family protein  37.21 
 
 		 147 aa  47  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0388  mutator MutT protein  38.6 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3378  NUDIX hydrolase  32.52 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0356  mutator MutT protein  38.6 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0223709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3948  mutator MutT protein  31.76 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3822  NUDIX hydrolase  33.88 
 
 		 145 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1603  NUDIX/MutT family protein  32.56 
 
 		 164 aa  46.2  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.79603  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1807  mutator MutT-like  32.41 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.829238  normal  0.287731 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1657  NUDIX hydrolase  44.26 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.809555  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2186  NUDIX hydrolase  34.02 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0312  mutator MutT protein  38.6 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.672809  normal  0.370797 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3209  NUDIX hydrolase  28.85 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.663648  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>