280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3063 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3063  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 158 aa  328  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.187494  normal  0.375393 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2799  NUDIX hydrolase  90.51 
 
 		 159 aa  300  4.0000000000000003e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal  0.0516272 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3242  hypothetical protein  65.15 
 
 		 132 aa  181  3e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2282  NUDIX hydrolase  58 
 
 		 163 aa  179  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.725543  normal  0.213019 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2186  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 165 aa  157  6e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1602  NUDIX hydrolase  51.66 
 
 		 151 aa  150  5.9999999999999996e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.973125  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1511  MutT/nudix family protein  49.67 
 
 		 151 aa  144  3e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1563  MutT/nudix family protein  49.67 
 
 		 151 aa  144  3e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.752749  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5306  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 156 aa  143  9e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838276  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2633  NUDIX hydrolase  47.95 
 
 		 162 aa  140  6e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.748492  normal  0.918126 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1383  NUDIX hydrolase  44.38 
 
 		 193 aa  137  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.744983 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4874  NUDIX hydrolase  44.14 
 
 		 162 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5001  NUDIX hydrolase  47.33 
 
 		 156 aa  134  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2258  putative NUDIX hydrolase  48.89 
 
 		 173 aa  133  8e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3259  NUDIX hydrolase  45.89 
 
 		 168 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.303659  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3051  NUDIX hydrolase  44.83 
 
 		 154 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3674  NUDIX hydrolase  43.95 
 
 		 175 aa  130  6e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.78124 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4049  NUDIX hydrolase  45.21 
 
 		 169 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4195  NUDIX hydrolase  45.19 
 
 		 162 aa  128  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.566986 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3476  NUDIX hydrolase  44.72 
 
 		 175 aa  127  6e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3784  NUDIX hydrolase  44.03 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.360863 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4342  NUDIX hydrolase  41.13 
 
 		 156 aa  118  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.87034 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0779  NUDIX hydrolase  41.96 
 
 		 156 aa  115  3e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0032986  normal  0.0903569 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2221  NUDIX hydrolase  43.15 
 
 		 146 aa  114  6e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.25917 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2217  NUDIX hydrolase  42.54 
 
 		 158 aa  108  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.524488  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  31.87 
 
 		 160 aa  77.8  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3444  NUDIX hydrolase  31.06 
 
 		 179 aa  67  0.00000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.578568 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3464  NUDIX hydrolase  34.67 
 
 		 188 aa  65.1  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.918471  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2655  NUDIX hydrolase  33.78 
 
 		 161 aa  63.2  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  34.09 
 
 		 155 aa  61.6  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1730  NUDIX hydrolase  33.59 
 
 		 137 aa  60.5  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0618  NUDIX hydrolase  31.51 
 
 		 166 aa  59.3  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1428  NUDIX hydrolase  31.61 
 
 		 170 aa  58.9  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.516023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1807  mutator MutT-like  29.46 
 
 		 148 aa  57.4  0.00000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.829238  normal  0.287731 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  32.48 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0453  NUDIX hydrolase  33.63 
 
 		 215 aa  52.4  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2394  NUDIX hydrolase  33.63 
 
 		 191 aa  52.8  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.772855 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0480  NUDIX hydrolase  33.6 
 
 		 184 aa  52.8  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.227834  hitchhiker  0.00765199 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3974  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 		 169 aa  52  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1496  NUDIX hydrolase  30.71 
 
 		 174 aa  52.4  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.174494 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0515  ADP-ribose pyrophosphatase  30.4 
 
 		 168 aa  52  0.000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4359  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 		 163 aa  51.6  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1486  NUDIX hydrolase  30.59 
 
 		 131 aa  50.4  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00282357  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1033  NUDIX hydrolase  30.16 
 
 		 542 aa  50.4  0.000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0906744 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8547  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 156 aa  50.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00677981  hitchhiker  0.000239658 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1593  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 		 166 aa  50.4  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6007  NUDIX hydrolase  36.04 
 
 		 165 aa  49.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4313  NUDIX hydrolase  37.31 
 
 		 153 aa  49.7  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1167  NUDIX hydrolase  30.56 
 
 		 164 aa  49.7  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3733  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  32.41 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0829824  normal  0.0242018 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2888  NUDIX hydrolase  32.41 
 
 		 151 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2698  A/G-specific adenine glycosylase  30.51 
 
 		 396 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.265639 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1874  NUDIX hydrolase  28.95 
 
 		 206 aa  48.1  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000557306  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0784  NUDIX hydrolase  23.44 
 
 		 155 aa  48.5  0.00004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1029  NUDIX hydrolase  41.07 
 
 		 127 aa  48.5  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4253  NUDIX hydrolase  32.67 
 
 		 160 aa  48.5  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103812  normal  0.749922 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1181  ADP-ribose pyrophosphatase  32.65 
 
 		 181 aa  48.5  0.00004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.152697  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0946  ADP-ribose pyrophosphatase  29.73 
 
 		 207 aa  48.5  0.00004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000804497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1335  NUDIX hydrolase  32.99 
 
 		 171 aa  48.1  0.00005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  37.93 
 
 		 135 aa  48.1  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0027  hypothetical protein  35.29 
 
 		 312 aa  47.4  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.132128 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0523  NUDIX hydrolase  33.64 
 
 		 187 aa  47.8  0.00007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.329737  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3942  putative NUDIX-like hydrolase  30.77 
 
 		 167 aa  47.4  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180458  normal  0.438057 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0258  MutT/Nudix family protein  31.3 
 
 		 137 aa  47.4  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3076  NUDIX hydrolase  29.51 
 
 		 216 aa  47.4  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4453  mutator mutT protein  31.82 
 
 		 144 aa  47  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0347377  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0613  NUDIX hydrolase  31.96 
 
 		 171 aa  47.4  0.00009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2429  NUDIX hydrolase  28.85 
 
 		 182 aa  47.4  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0417103 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  44.62 
 
 		 314 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3713  NUDIX hydrolase  31.48 
 
 		 151 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.34435 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13970  NUDIX hydrolase  30.22 
 
 		 146 aa  47  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0294014  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4376  hypothetical protein  44.62 
 
 		 314 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0380  NUDIX hydrolase  29.57 
 
 		 199 aa  47  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000301987  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0503  ADP-ribose pyrophosphatase  39.68 
 
 		 206 aa  47  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2940  mutT-like protein  37.31 
 
 		 155 aa  47  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.703961  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  46.55 
 
 		 313 aa  46.6  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  36.56 
 
 		 141 aa  47  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3659  NUDIX hydrolase  31.48 
 
 		 151 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4163  NUDIX hydrolase  26.96 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2349  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2664  NUDIX hydrolase family protein  25.68 
 
 		 161 aa  46.6  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.472799  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3137  mutT/nudix family protein  27.01 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0554874  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  30.83 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3045  MutT/NUDIX family phosphohydrolase  26.28 
 
 		 153 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3492  NUDIX hydrolase  31.62 
 
 		 157 aa  46.2  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0473  protein of unknown function DUF1152  40 
 
 		 530 aa  46.2  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0635  NUDIX/MutT family protein  29.57 
 
 		 170 aa  46.2  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.318355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1510  NUDIX hydrolase  32.08 
 
 		 157 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3049  NUDIX hydrolase  29.81 
 
 		 182 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0858  hypothetical protein  35.29 
 
 		 317 aa  45.8  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5170  NUDIX hydrolase  33.06 
 
 		 124 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.140908  normal  0.555587 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  40.98 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3372  mutT/nudix family protein  26.28 
 
 		 153 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2153  NUDIX hydrolase  30.91 
 
 		 176 aa  45.8  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.399297 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3701  NUDIX hydrolase  35.82 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.899383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1340  NUDIX hydrolase  31.63 
 
 		 171 aa  45.8  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.902443 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51490  hypothetical protein  37.04 
 
 		 212 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000141034  hitchhiker  0.000162281 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0997  NUDIX hydrolase  31 
 
 		 153 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.665088  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  43.86 
 
 		 137 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0407  mutator MutT protein  37.1 
 
 		 129 aa  45.1  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  35.37 
 
 		 314 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>