254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3051 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3051  NUDIX hydrolase  100 
 
 
154 aa  304  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3674  NUDIX hydrolase  66.88 
 
 
175 aa  193  6e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.78124 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3476  NUDIX hydrolase  62.99 
 
 
175 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3784  NUDIX hydrolase  61.69 
 
 
158 aa  181  3e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.360863 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5001  NUDIX hydrolase  61.07 
 
 
156 aa  169  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5306  NUDIX hydrolase  62.24 
 
 
156 aa  167  6e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838276  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1383  NUDIX hydrolase  59.06 
 
 
193 aa  167  6e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.744983 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2258  putative NUDIX hydrolase  57.05 
 
 
173 aa  163  8e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1602  NUDIX hydrolase  55.86 
 
 
151 aa  160  8.000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.973125  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4195  NUDIX hydrolase  54.36 
 
 
162 aa  156  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.566986 
 
 
-
 
NC_004310  BR1563  MutT/nudix family protein  55.17 
 
 
151 aa  154  4e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.752749  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1511  MutT/nudix family protein  55.17 
 
 
151 aa  154  4e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3259  NUDIX hydrolase  54.36 
 
 
168 aa  151  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.303659  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4874  NUDIX hydrolase  51.68 
 
 
162 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2186  NUDIX hydrolase  52.74 
 
 
165 aa  149  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4049  NUDIX hydrolase  53.02 
 
 
169 aa  147  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2633  NUDIX hydrolase  53.42 
 
 
162 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.748492  normal  0.918126 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2799  NUDIX hydrolase  46.21 
 
 
159 aa  136  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal  0.0516272 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3063  NUDIX hydrolase  44.83 
 
 
158 aa  131  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.187494  normal  0.375393 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2282  NUDIX hydrolase  47.97 
 
 
163 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.725543  normal  0.213019 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3242  hypothetical protein  51.13 
 
 
132 aa  123  7e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2217  NUDIX hydrolase  49.25 
 
 
158 aa  121  4e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.524488  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4342  NUDIX hydrolase  47.41 
 
 
156 aa  115  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.87034 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0779  NUDIX hydrolase  46.04 
 
 
156 aa  114  3.9999999999999997e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0032986  normal  0.0903569 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2221  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 
146 aa  103  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.25917 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  36.09 
 
 
160 aa  93.2  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3444  NUDIX hydrolase  35.61 
 
 
179 aa  75.5  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.578568 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2394  NUDIX hydrolase  38.85 
 
 
191 aa  63.2  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.772855 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3464  NUDIX hydrolase  39.23 
 
 
188 aa  60.8  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.918471  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1807  mutator MutT-like  35.09 
 
 
148 aa  59.3  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.829238  normal  0.287731 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2655  NUDIX hydrolase  34.13 
 
 
161 aa  59.7  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
155 aa  58.5  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1496  NUDIX hydrolase  36.22 
 
 
174 aa  55.1  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.174494 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0618  NUDIX hydrolase  35.59 
 
 
166 aa  53.1  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1428  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
170 aa  52  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.516023  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0997  NUDIX hydrolase  40.78 
 
 
153 aa  51.6  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.665088  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5518  NUDIX hydrolase  40 
 
 
183 aa  51.2  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1537  hypothetical protein  53.19 
 
 
162 aa  50.4  0.000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.156028  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3733  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  31.51 
 
 
150 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0829824  normal  0.0242018 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1565  NUDIX hydrolase  37.11 
 
 
150 aa  49.7  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000493599  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8547  NUDIX hydrolase  53.19 
 
 
156 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00677981  hitchhiker  0.000239658 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1593  NUDIX hydrolase  35.14 
 
 
166 aa  49.7  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2643  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 
149 aa  49.7  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1285  NUDIX hydrolase  38.3 
 
 
185 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.270966  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6153  NUDIX hydrolase  38.3 
 
 
185 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.292779 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6546  NUDIX hydrolase  38.3 
 
 
185 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.293619  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  45.31 
 
 
156 aa  48.9  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  44.62 
 
 
156 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1472  NUDIX hydrolase  31.3 
 
 
150 aa  48.5  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181973  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1181  ADP-ribose pyrophosphatase  32.99 
 
 
181 aa  48.9  0.00003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.152697  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5733  NUDIX hydrolase  36.7 
 
 
218 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4812  NUDIX hydrolase  37.61 
 
 
140 aa  47.8  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.5658 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  39.19 
 
 
156 aa  47.4  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2651  NUDIX hydrolase  36.08 
 
 
150 aa  47.8  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000859831 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1911  NUDIX hydrolase  47.62 
 
 
167 aa  47.4  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.276369  normal  0.389177 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6646  NUDIX hydrolase  35.96 
 
 
155 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2415  NUDIX hydrolase  34.55 
 
 
169 aa  47.4  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000842745  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5598  NUDIX hydrolase  36.96 
 
 
165 aa  47.4  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3701  NUDIX hydrolase  31.43 
 
 
144 aa  47.4  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.899383  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1609  Nucleotide-binding protein  31.2 
 
 
484 aa  47  0.00009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2015  mutT/nudix family protein  38.54 
 
 
150 aa  47  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0857519  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3148  NUDIX hydrolase  30.84 
 
 
155 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2971  NUDIX hydrolase  32.1 
 
 
153 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000073091  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1007  NUDIX hydrolase  55.77 
 
 
144 aa  46.6  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.175488  hitchhiker  0.000423095 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2940  mutT-like protein  39.13 
 
 
155 aa  46.2  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.703961  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1097  NUDIX hydrolase  35.37 
 
 
305 aa  46.2  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183195  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3699  NUDIX hydrolase  34.57 
 
 
152 aa  46.2  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.224452  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1287  NUDIX hydrolase  31.68 
 
 
154 aa  46.2  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0960276  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1281  NUDIX hydrolase  48.28 
 
 
156 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3328  NUDIX hydrolase  31.37 
 
 
160 aa  46.2  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.672481  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5260  mutT/nudix family protein  40.68 
 
 
152 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1829  NUDIX hydrolase  39.58 
 
 
150 aa  45.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000906254  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5005  mutT/nudix family protein  40.68 
 
 
152 aa  45.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4834  MutT/Nudix family protein  40.68 
 
 
152 aa  45.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4849  MutT/Nudix family protein  40.68 
 
 
152 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5317  mutT/nudix family protein  40.68 
 
 
152 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5682  mutT/nudix family protein  40.68 
 
 
152 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5241  mutT/nudix family protein  40.68 
 
 
152 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5385  mutT/nudix family protein  40.68 
 
 
152 aa  45.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2666  NUDIX domain-containing protein  49.12 
 
 
158 aa  45.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.661502  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0414  mutator MutT protein  42.37 
 
 
132 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5275  mutT/nudix family protein  40.68 
 
 
152 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.425135  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2030  mutT/nudix family protein  24.19 
 
 
153 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.83484e-43 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1874  NUDIX hydrolase  25 
 
 
206 aa  45.1  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000557306  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1854  mutT/nudix family protein  24.19 
 
 
153 aa  45.1  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1825  MutT/Nudix family protein  24.19 
 
 
153 aa  45.1  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000200422  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1997  mutT/nudix family protein  24.19 
 
 
153 aa  45.1  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000428877  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1218  NUDIX hydrolase  33.64 
 
 
194 aa  44.7  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.843116 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1167  NUDIX hydrolase  29.93 
 
 
164 aa  45.1  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51490  hypothetical protein  32.73 
 
 
212 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000141034  hitchhiker  0.000162281 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2094  mutT/nudix family protein  24.19 
 
 
153 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000267721  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0863  dinucleoside polyphosphate hydrolase  35.82 
 
 
178 aa  45.1  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000145105  normal  0.0591325 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0519  MutT/nudix family protein  38.82 
 
 
146 aa  44.3  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1505  MutT/nudix family protein  36.05 
 
 
158 aa  44.7  0.0005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000663569  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4949  NUDIX hydrolase  40.68 
 
 
152 aa  44.7  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.626782  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4548  NUDIX hydrolase  36.94 
 
 
156 aa  44.7  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1837  MutT/NUDIX family hydrolase  37.62 
 
 
158 aa  44.7  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158104  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0503  ADP-ribose pyrophosphatase  31.5 
 
 
206 aa  44.7  0.0005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2108  NUDIX hydrolase  47.17 
 
 
157 aa  44.3  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000452555  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0946  ADP-ribose pyrophosphatase  26.58 
 
 
207 aa  44.7  0.0005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000804497  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>