282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2885 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2885  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 175 aa  351  2.9999999999999997e-96  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000755007  normal  0.649673 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6512  NUDIX hydrolase  51.75 
 
 		 167 aa  130  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.877846  normal  0.0950137 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1805  NUDIX hydrolase  40.54 
 
 		 253 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1103  NUDIX hydrolase  39.47 
 
 		 169 aa  110  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2415  NUDIX hydrolase  41.72 
 
 		 169 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000842745  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1537  hypothetical protein  45.52 
 
 		 162 aa  106  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.156028  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8547  NUDIX hydrolase  42.36 
 
 		 156 aa  103  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00677981  hitchhiker  0.000239658 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3492  NUDIX hydrolase  42 
 
 		 157 aa  101  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0064  putative ATP/GTP-binding protein  42.34 
 
 		 157 aa  99.4  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5733  NUDIX hydrolase  43.9 
 
 		 218 aa  93.2  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24710  ADP-ribose pyrophosphatase  42.4 
 
 		 255 aa  91.3  6e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0815  NUDIX hydrolase  43.44 
 
 		 230 aa  90.1  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0620  NUDIX hydrolase  39.86 
 
 		 282 aa  85.1  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.253457 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6876  putative ATP/GTP-binding protein  44.19 
 
 		 175 aa  73.6  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29780  ADP-ribose pyrophosphatase  38.46 
 
 		 163 aa  73.2  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0189  NUDIX hydrolase  48.81 
 
 		 161 aa  71.2  0.000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  30.87 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  30.87 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  33.08 
 
 		 155 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5595  NUDIX hydrolase  33.08 
 
 		 155 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2282  NUDIX hydrolase  33.73 
 
 		 163 aa  57  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.725543  normal  0.213019 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1141  NUDIX hydrolase  42.19 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4650  NUDIX hydrolase  30.88 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  32.56 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  32.31 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  32.31 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  32.31 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0463  NUDIX hydrolase  39.08 
 
 		 135 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0464  MutT/nudix family protein  37.93 
 
 		 135 aa  53.1  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2108  NUDIX hydrolase  55.77 
 
 		 157 aa  52.8  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000452555  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4504  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 134 aa  52.4  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0549022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0536  NUDIX hydrolase  32.41 
 
 		 140 aa  52.4  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0645  NUDIX hydrolase  43.66 
 
 		 153 aa  51.6  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0664584 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0508  NUDIX hydrolase  36.08 
 
 		 157 aa  52  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0799439  hitchhiker  0.00145151 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0467  NUDIX hydrolase  37.93 
 
 		 135 aa  51.6  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3562  NUDIX hydrolase  37.93 
 
 		 135 aa  51.6  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3147  NUDIX hydrolase  41.56 
 
 		 144 aa  51.2  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.232456  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  46 
 
 		 160 aa  50.8  0.000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0439  NUDIX hydrolase  39.51 
 
 		 145 aa  50.4  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4163  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 133 aa  50.4  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2349  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0691  mutT/nudix family protein  30.56 
 
 		 140 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5494  NUDIX hydrolase  39.24 
 
 		 172 aa  50.1  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202592 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0258  MutT/Nudix family protein  36.84 
 
 		 137 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3039  Protein of unknown function DUF2029  43.24 
 
 		 570 aa  49.7  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4226  NUDIX hydrolase  38.38 
 
 		 162 aa  49.7  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5566  NUDIX hydrolase  27.66 
 
 		 153 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.600891  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51490  hypothetical protein  40 
 
 		 212 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000141034  hitchhiker  0.000162281 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2447  NUDIX hydrolase  35.23 
 
 		 129 aa  49.7  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000652481  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1593  NUDIX hydrolase  40.98 
 
 		 166 aa  50.1  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3170  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 179 aa  50.1  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0589  mutT/nudix family protein  38.16 
 
 		 140 aa  49.3  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0533  MutT/NUDIX family protein  38.16 
 
 		 140 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.133702  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2360  putative mutator MutT protein  33.33 
 
 		 150 aa  49.3  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0622  mutT/nudix family protein  38.16 
 
 		 140 aa  49.3  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4195  NUDIX hydrolase  40.85 
 
 		 162 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.566986 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2278  NUDIX hydrolase  38.27 
 
 		 134 aa  48.9  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.369324  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0533  MutT/NUDIX family protein  38.16 
 
 		 140 aa  48.5  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3822  NUDIX hydrolase  38.27 
 
 		 145 aa  48.5  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0677  mutT/nudix family protein  38.16 
 
 		 140 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000877041 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0519  NUDIX family hydrolase  34.02 
 
 		 168 aa  48.9  0.00004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.259714  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5931  NUDIX hydrolase  28.36 
 
 		 143 aa  48.9  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1315  NUDIX hydrolase  43.86 
 
 		 156 aa  48.5  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.511776  normal  0.0806389 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3895  NUDIX hydrolase  38.27 
 
 		 151 aa  48.5  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3378  NUDIX hydrolase  38.27 
 
 		 145 aa  48.5  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3309  NUDIX hydrolase  38.75 
 
 		 153 aa  48.1  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1911  NUDIX hydrolase  43.86 
 
 		 167 aa  48.5  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.276369  normal  0.389177 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0715  NUDIX hydrolase  38.04 
 
 		 299 aa  48.1  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4018  NUDIX hydrolase  38.27 
 
 		 154 aa  47.8  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6695  NUDIX hydrolase  46.15 
 
 		 175 aa  47.8  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.412462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1281  NUDIX hydrolase  43.86 
 
 		 156 aa  47.8  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3639  NUDIX hydrolase  31.36 
 
 		 142 aa  47.8  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1097  NUDIX hydrolase  31.76 
 
 		 305 aa  47.4  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1029  NUDIX hydrolase  36.23 
 
 		 127 aa  47  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3746  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 		 142 aa  47  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0762  NUDIX hydrolase  41.43 
 
 		 148 aa  47.4  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04356  hypothetical protein  47.46 
 
 		 302 aa  47  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0922  NUDIX hydrolase  43.86 
 
 		 156 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1404  NUDIX hydrolase  43.86 
 
 		 157 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.567181  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0154  mutT/nudix family protein  33.68 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2756  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 		 159 aa  46.2  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0350  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 132 aa  47  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1382  NUDIX hydrolase  43.86 
 
 		 156 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.162154 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2940  mutT-like protein  33.04 
 
 		 155 aa  46.2  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.703961  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  43.75 
 
 		 143 aa  46.2  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0618  NUDIX hydrolase  39.19 
 
 		 166 aa  46.6  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4548  NUDIX hydrolase  46.43 
 
 		 156 aa  47  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0207  NUDIX hydrolase  33.68 
 
 		 147 aa  46.6  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107343 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2217  NUDIX hydrolase  48.94 
 
 		 158 aa  46.2  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.524488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0473  protein of unknown function DUF1152  29.5 
 
 		 530 aa  46.2  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4678  mutT/nudix family protein  30.56 
 
 		 140 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.1477999999999999e-21 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  34.94 
 
 		 141 aa  45.8  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0717  NUDIX hydrolase  41.33 
 
 		 168 aa  45.8  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  34.86 
 
 		 134 aa  45.8  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4342  NUDIX hydrolase  31.93 
 
 		 156 aa  45.8  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.87034 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6646  NUDIX hydrolase  48.15 
 
 		 155 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0659  mutT/nudix family protein  30.56 
 
 		 140 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.73799  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0299  mutator mutT protein  38.98 
 
 		 139 aa  45.4  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0361617  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4020  ADP-ribose pyrophosphatase  29.57 
 
 		 143 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1420  Mutator protein MutT  33.01 
 
 		 134 aa  45.4  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2755  mutT/nudix family protein  30.33 
 
 		 145 aa  45.4  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.801064  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>