181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1506 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1506  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 390 aa  801    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0592  hypothetical protein  34.87 
 
 		 241 aa  132  7.999999999999999e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.323051  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0074  hypothetical protein  35.71 
 
 		 256 aa  130  3e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1796  hypothetical protein  35.59 
 
 		 252 aa  123  7e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.322424  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1833  hypothetical protein  35.47 
 
 		 252 aa  120  3e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0714167  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1073  hypothetical protein  31.25 
 
 		 240 aa  96.7  7e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27390  hypothetical protein  30.36 
 
 		 247 aa  84.7  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0368828  normal  0.805501 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1729  hypothetical protein  26.1 
 
 		 253 aa  83.6  0.000000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.754048 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2288  NUDIX hydrolase  26.67 
 
 		 456 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.514522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7376  NUDIX hydrolase  29.12 
 
 		 246 aa  77  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4094  hypothetical protein  27.16 
 
 		 245 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3523  hypothetical protein  26.56 
 
 		 231 aa  75.5  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.1598  normal  0.79365 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0646  hypothetical protein  24.05 
 
 		 249 aa  73.2  0.000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6630  NUDIX hydrolase  27.98 
 
 		 245 aa  70.5  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.707478  normal  0.113041 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1525  NUDIX hydrolase  27.9 
 
 		 441 aa  70.1  0.00000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.103483 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1804  NUDIX hydrolase  27.04 
 
 		 260 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.807933  normal  0.0812819 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1524  NUDIX hydrolase  27.02 
 
 		 260 aa  63.2  0.000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.691328  normal  0.577516 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1709  hypothetical protein  27.37 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1479  NUDIX hydrolase  29.23 
 
 		 135 aa  58.5  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142432  hitchhiker  0.00620383 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1656  NUDIX hydrolase  58 
 
 		 152 aa  57.8  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.632067  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0028  NUDIX hydrolase  30.19 
 
 		 155 aa  57.4  0.0000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  28.33 
 
 		 141 aa  55.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1467  NUDIX hydrolase  47.37 
 
 		 135 aa  53.9  0.000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1550  Protein of unknown function DUF2210  23.92 
 
 		 223 aa  53.9  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0426394  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5481  hypothetical protein  26.07 
 
 		 222 aa  53.1  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0963  NUDIX hydrolase  35.14 
 
 		 139 aa  52.8  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0596  7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase  33.66 
 
 		 166 aa  51.6  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.237906  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0551  NUDIX hydrolase  30.33 
 
 		 162 aa  51.6  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.788688  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2852  NUDIX hydrolase  39.71 
 
 		 157 aa  52.4  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000177474  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1416  NUDIX hydrolase  34.02 
 
 		 163 aa  52  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1377  NUDIX hydrolase  27.44 
 
 		 171 aa  51.6  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.054711  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1347  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 269 aa  50.8  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244652 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0623  NUDIX hydrolase  30 
 
 		 167 aa  50.8  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1070  NUDIX hydrolase  33.03 
 
 		 155 aa  50.1  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000247956  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0260  hypothetical protein  22.81 
 
 		 169 aa  50.1  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.764522  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1169  NUDIX hydrolase  33.78 
 
 		 138 aa  50.1  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0595  NUDIX hydrolase  34.15 
 
 		 156 aa  50.1  0.00007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.652543 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2429  mutT like protein  29.25 
 
 		 134 aa  49.7  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  32.31 
 
 		 143 aa  48.9  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2614  NUDIX hydrolase  25.93 
 
 		 152 aa  49.3  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.349258  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2239  dATP pyrophosphohydrolase  47.06 
 
 		 148 aa  49.7  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4263  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 		 147 aa  48.5  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.143097  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5518  NUDIX hydrolase  44.23 
 
 		 183 aa  48.9  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3533  NUDIX family pyrophosphatase  38.03 
 
 		 334 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3657  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 		 147 aa  48.1  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.279088  normal  0.460753 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3998  NUDIX hydrolase  42.37 
 
 		 154 aa  48.5  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0404394  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0181  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 138 aa  48.1  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.463444  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2121  NUDIX hydrolase  30.19 
 
 		 140 aa  47.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.575199  decreased coverage  0.00514227 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0963  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 		 180 aa  48.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000383094  normal  0.278011 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2044  NUDIX hydrolase  28.87 
 
 		 147 aa  48.1  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490099 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3537  mutator mutT protein  38.03 
 
 		 149 aa  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4267  hydrolase, NUDIX family  42.37 
 
 		 154 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.555582  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0967  hydrolase, NUDIX family  42.37 
 
 		 154 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00369926  normal  0.920839 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2862  NUDIX hydrolase  34.25 
 
 		 186 aa  47.8  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.200319  hitchhiker  0.00911064 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0542  NUDIX hydrolase  38.03 
 
 		 147 aa  47.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184867  normal  0.118986 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1301  MutT/nudix family protein  43.14 
 
 		 163 aa  47.4  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.308038  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0090  NUDIX hydrolase  38.03 
 
 		 147 aa  47.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0572  NUDIX hydrolase  38.03 
 
 		 147 aa  47.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.546019  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2861  NUDIX hydrolase  34.07 
 
 		 142 aa  47.8  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.510666  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3582  NUDIX hydrolase  34.09 
 
 		 154 aa  47.4  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2380  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 		 169 aa  47.4  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1476  NUDIX hydrolase  32.79 
 
 		 155 aa  47.8  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0412  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 		 174 aa  47  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0161756  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8400  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  30.77 
 
 		 139 aa  47  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.24066 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0771  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  29.29 
 
 		 134 aa  47  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  0.720455 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1532  NUDIX hydrolase  48.98 
 
 		 154 aa  47  0.0006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0672  MutT/nudix family protein  30.23 
 
 		 147 aa  47  0.0007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.959271  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1272  NUDIX hydrolase  37.1 
 
 		 183 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1128  NUDIX hydrolase  42.55 
 
 		 141 aa  46.6  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0349929  normal  0.45534 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1041  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 154 aa  46.6  0.0007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.317547  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2824  NUDIX hydrolase  38.81 
 
 		 153 aa  46.6  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.852185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1914  NUDIX hydrolase  29.89 
 
 		 149 aa  46.6  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.592421  normal  0.977797 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0498  putative mutator protein(7,8-dihydro-8- oxoguanine-triphosphatase), MutT  38.03 
 
 		 142 aa  46.6  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0475  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 		 152 aa  46.6  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.573491  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3512  mutator mutT protein  36.62 
 
 		 149 aa  46.6  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0500  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 		 152 aa  46.6  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.43555 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4483  NUDIX hydrolase  39.06 
 
 		 153 aa  46.6  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2861  NUDIX hydrolase  43.64 
 
 		 174 aa  46.2  0.0009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.197962  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2908  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  30.11 
 
 		 128 aa  46.2  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0055236  normal  0.908985 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3508  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  30.11 
 
 		 128 aa  46.2  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116101  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1462  mutT/nudix family protein  39.68 
 
 		 183 aa  46.2  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2500  mutT/nudix family protein  42.59 
 
 		 170 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0522279  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2461  MutT/Nudix family protein  42.59 
 
 		 170 aa  45.8  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000020561  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3909  MutT/Nudix family protein  40.68 
 
 		 154 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0016299  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0877  MutT-like protein  48.98 
 
 		 144 aa  46.2  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2685  mutT/nudix family protein  42.59 
 
 		 170 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.345064  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1130  NUDIX family pyrophosphatase  36.62 
 
 		 149 aa  45.8  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.649949  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2700  mutT/nudix family protein  42.59 
 
 		 170 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000999675 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1291  NUDIX hydrolase  35.21 
 
 		 161 aa  45.8  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.327149 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1099  7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase  33.33 
 
 		 160 aa  45.8  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000230167  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  38.98 
 
 		 134 aa  45.8  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1017  NUDIX hydrolase  33.82 
 
 		 144 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.803103  normal  0.224803 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2650  hypothetical protein  30.77 
 
 		 315 aa  45.8  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1340  NUDIX hydrolase  36.23 
 
 		 171 aa  45.8  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.902443 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2751  MutT/Nudix family protein  39.13 
 
 		 194 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000576438  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3377  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  30.11 
 
 		 128 aa  46.2  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0382964  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0613  NUDIX hydrolase  36.76 
 
 		 171 aa  45.8  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1317  putative mutator mutT protein  36.62 
 
 		 149 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1565  ADP-ribose pyrophosphatase  26.72 
 
 		 158 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1477  ADP-ribose pyrophosphatase  26.72 
 
 		 158 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>