113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1120 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1120  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 178 aa  372  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3318  NUDIX hydrolase  36.96 
 
 		 185 aa  124  8.000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000044442  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4840  mutT/nudix family protein  39.02 
 
 		 180 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4379  NUDIX hydrolase  37.28 
 
 		 181 aa  117  7e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.312753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5561  hypothetical protein  38.04 
 
 		 178 aa  117  7e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.546979  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64010  hypothetical protein  39.26 
 
 		 178 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2848  NUDIX hydrolase  36.42 
 
 		 184 aa  115  3e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000562976  normal  0.434056 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0725  NUDIX hydrolase  38.55 
 
 		 178 aa  114  5e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4600  NUDIX hydrolase  35.93 
 
 		 178 aa  111  5e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0447936 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0565  NUDIX hydrolase  35.33 
 
 		 177 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0604  NUDIX hydrolase  35.33 
 
 		 177 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0625  NUDIX hydrolase  36.02 
 
 		 185 aa  108  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0610  NUDIX hydrolase  35.58 
 
 		 178 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0690731 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2561  NUDIX hydrolase  37.8 
 
 		 201 aa  108  5e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000630284  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1481  NUDIX hydrolase  36.21 
 
 		 216 aa  107  6e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000381919  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2782  NUDIX hydrolase  36.21 
 
 		 216 aa  107  8.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000698062  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1436  NUDIX family hydrolase  39.63 
 
 		 182 aa  107  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000974563  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0345  NUDIX family hydrolase  39.63 
 
 		 182 aa  107  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000116771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1545  NUDIX hydrolase  39.63 
 
 		 182 aa  107  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233987  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07000  NUDIX hydrolase  35.93 
 
 		 177 aa  105  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1383  NUDIX hydrolase  36.57 
 
 		 203 aa  105  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000123288  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2533  nudix hydrolase 3  36.59 
 
 		 184 aa  99.4  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000206294  normal  0.801308 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2587  nudix hydrolase 3  36.59 
 
 		 184 aa  99.4  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000345832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2487  nudix hydrolase 3  36.59 
 
 		 184 aa  99.4  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000530906  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2696  nudix hydrolase 3  36.59 
 
 		 184 aa  99.4  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000172824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2575  nudix hydrolase 3  36.59 
 
 		 184 aa  97.8  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00000332741  normal  0.705838 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02224  predicted NUDIX hydrolase  35.98 
 
 		 180 aa  95.1  5e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000212424  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1357  NUDIX hydrolase  35.98 
 
 		 180 aa  95.1  5e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  2.43085e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2449  NUDIX family hydrolase  35.98 
 
 		 180 aa  95.1  5e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.25281e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2593  NUDIX family hydrolase  35.98 
 
 		 180 aa  95.1  5e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000583084  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1353  NUDIX hydrolase  35.98 
 
 		 180 aa  95.1  5e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000289722  normal  0.985207 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2455  NUDIX family hydrolase  35.98 
 
 		 180 aa  95.1  5e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000626304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2675  hydrolase, NUDIX family protein  35.98 
 
 		 180 aa  95.1  5e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  9.90885e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3439  hydrolase, NUDIX family protein  35.98 
 
 		 180 aa  95.1  5e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000227212  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02184  hypothetical protein  35.98 
 
 		 180 aa  95.1  5e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000358279  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2826  NUDIX hydrolase  37.72 
 
 		 185 aa  94.4  7e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_7007  predicted protein  32.6 
 
 		 184 aa  85.5  4e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3117  NUDIX hydrolase  37.76 
 
 		 178 aa  77  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.129541  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1499  Mut/nudix family protein, putative isopentenyl-diphosphate isomerase  34.56 
 
 		 170 aa  76.3  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.38166e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1867  NUDIX hydrolase  29.65 
 
 		 183 aa  75.9  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1708  NUDIX hydrolase  28.92 
 
 		 170 aa  70.5  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0990  NUDIX hydrolase  34.01 
 
 		 173 aa  70.1  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000363849  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1126  dimethyladenosine transferase  31.17 
 
 		 459 aa  68.2  0.00000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0870793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1536  NUDIX hydrolase  32.89 
 
 		 331 aa  67  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.137745  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3389  NUDIX hydrolase  30.81 
 
 		 181 aa  65.9  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2237  NUDIX hydrolase  34.85 
 
 		 169 aa  63.2  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0632516  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2376  NUDIX hydrolase  25.5 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  normal  0.316272 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13638  putative isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  29.41 
 
 		 174 aa  62  0.000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.279506  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2201  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  34.02 
 
 		 179 aa  61.6  0.000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.43573  hitchhiker  0.00000497991 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2550  hypothetical protein  28.48 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.159383  normal  0.669028 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3251  NUDIX hydrolase  29.29 
 
 		 178 aa  59.3  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000109349  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0269  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  27.27 
 
 		 175 aa  58.9  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20640  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  29.01 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4299  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  28.35 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.651923  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2736  hypothetical protein  34.78 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.155618  normal  0.467171 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2276  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  34.44 
 
 		 176 aa  56.2  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00103129 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1553  NUDIX hydrolase  27.47 
 
 		 182 aa  53.5  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2043  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  27.94 
 
 		 172 aa  52.8  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.82849  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1623  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  31.37 
 
 		 175 aa  52.4  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0396  NUDIX hydrolase  29.57 
 
 		 171 aa  52.4  0.000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000159718  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0674  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  26.03 
 
 		 177 aa  51.6  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.90735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2914  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  29.55 
 
 		 179 aa  52  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0346  NUDIX hydrolase  39.34 
 
 		 182 aa  51.2  0.000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0239643 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1991  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  36.67 
 
 		 184 aa  51.2  0.000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1185  NUDIX hydrolase  26.09 
 
 		 187 aa  50.8  0.000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1742  NUDIX hydrolase  30.3 
 
 		 166 aa  50.8  0.000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.445003  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1593  NUDIX hydrolase  25.61 
 
 		 189 aa  50.4  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5942  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  32.61 
 
 		 176 aa  50.4  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.934933  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1548  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  28.41 
 
 		 179 aa  50.8  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51389  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4731  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  26.57 
 
 		 171 aa  50.4  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.291133  decreased coverage  0.0000344266 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0313  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  29.03 
 
 		 216 aa  49.3  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.814228 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2032  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  32.26 
 
 		 171 aa  48.1  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1582  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  29.03 
 
 		 181 aa  47.8  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.196336  normal  0.154748 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1185  ADP-ribose pyrophosphatase  27.34 
 
 		 164 aa  46.2  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.792217  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5556  NUDIX hydrolase  30.08 
 
 		 130 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.239043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4928  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  30.77 
 
 		 199 aa  46.2  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.358749  normal  0.255355 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0346  NUDIX hydrolase  34.52 
 
 		 169 aa  45.4  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.408953  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24710  ADP-ribose pyrophosphatase  29.55 
 
 		 255 aa  45.4  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2758  putative mut-like protein  41.51 
 
 		 163 aa  45.1  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45381  predicted protein  27.56 
 
 		 451 aa  45.1  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.22287  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02550  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, putative  25.63 
 
 		 265 aa  44.7  0.0007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0343  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  29.21 
 
 		 198 aa  44.7  0.0007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.447974  normal  0.157249 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2029  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  30.34 
 
 		 210 aa  44.3  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0672691  hitchhiker  0.00592267 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0626  MutT/nudix family protein  35.59 
 
 		 161 aa  44.3  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000112131  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl471  nucleoside diphosphate (nudix) hydrolase  29.23 
 
 		 174 aa  43.9  0.001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00345431  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1754  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  31.46 
 
 		 191 aa  43.5  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.202271  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1382  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  31.51 
 
 		 190 aa  42.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1285  NUDIX hydrolase  51.28 
 
 		 185 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.270966  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6546  NUDIX hydrolase  51.28 
 
 		 185 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.293619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2448  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 		 137 aa  42.7  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0479485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5518  NUDIX hydrolase  38.98 
 
 		 183 aa  42.4  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.434768 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00579  Isopentenyl diphosphate isomerasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q874I0]  26.67 
 
 		 268 aa  42.4  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.590564 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2649  NUDIX hydrolase  29.55 
 
 		 209 aa  42  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0213367  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2074  mutT/nudix family protein  39.13 
 
 		 229 aa  41.6  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000276659  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4188  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  26.88 
 
 		 219 aa  42  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0575  MutT/nudix family protein  38.98 
 
 		 149 aa  41.6  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6153  NUDIX hydrolase  51.28 
 
 		 185 aa  41.6  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.292779 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1854  mutT/nudix family protein  37.68 
 
 		 153 aa  41.2  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1825  MutT/Nudix family protein  37.68 
 
 		 153 aa  41.2  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000200422  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1997  mutT/nudix family protein  37.68 
 
 		 153 aa  41.2  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000428877  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>