More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2175 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2175  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 133 aa  270  4.0000000000000004e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.523963 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2458  NUDIX hydrolase  73.68 
 
 		 138 aa  200  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0504  NUDIX hydrolase  45.19 
 
 		 101 aa  92  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.163605  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5041  NUDIX hydrolase  37.29 
 
 		 148 aa  73.9  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.216707 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0830  NUDIX hydrolase  38.17 
 
 		 291 aa  67  0.00000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0592  hypothetical protein  35.88 
 
 		 316 aa  65.5  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4458  NUDIX hydrolase  39.62 
 
 		 131 aa  64.3  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0575  MutT/nudix family protein  37.35 
 
 		 149 aa  63.2  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5556  NUDIX hydrolase  41.44 
 
 		 130 aa  63.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.239043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3209  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.663648  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04356  hypothetical protein  37.86 
 
 		 302 aa  62  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0614  NUDIX hydrolase  35.4 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0852421  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4976  NUDIX hydrolase  34.65 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2908  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  28.57 
 
 		 128 aa  58.2  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0055236  normal  0.908985 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3508  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  28.57 
 
 		 128 aa  58.2  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116101  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1931  NUDIX hydrolase  34.29 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000285208  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3377  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  28.57 
 
 		 128 aa  58.2  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0382964  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  39.39 
 
 		 318 aa  57.8  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  34.82 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0101  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  31.54 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000708829  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0620  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40 
 
 		 132 aa  57  0.00000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0107  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  32.06 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000992989  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00100  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase, marked preference for dGTP  32.06 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.126012  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3501  mutator MutT protein  32.06 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0105  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  32.06 
 
 		 129 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000458525  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00099  hypothetical protein  32.06 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.146865  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3558  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  32.06 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.016637  hitchhiker  0.00136766 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1007  hypothetical protein  34.48 
 
 		 325 aa  55.5  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1757  NUDIX hydrolase  37.93 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207601  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0292  mutator mutT protein  35.71 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3039  Protein of unknown function DUF2029  36.04 
 
 		 570 aa  55.5  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2084  hypothetical protein  31.01 
 
 		 319 aa  56.2  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.498942 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3006  NUDIX hydrolase  38.95 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  34.26 
 
 		 473 aa  55.5  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0093  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  32.06 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000316081  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2605  mutator MutT protein  31.48 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.402694  hitchhiker  0.00000000101323 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4229  NUDIX hydrolase  35.78 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0351267  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0104  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  31.3 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000574829  normal  0.261189 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1416  NUDIX hydrolase  34.26 
 
 		 163 aa  53.9  0.0000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0659  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.54 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1487  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 147 aa  53.5  0.0000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000137627 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0533  NUDIX hydrolase  31 
 
 		 140 aa  53.5  0.0000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0228598  normal  0.521082 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2984  NUDIX hydrolase  33 
 
 		 136 aa  53.5  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000021571  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  37.89 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0181  NUDIX hydrolase  33.01 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.463444  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  37.89 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0762  NUDIX hydrolase  36.26 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0388  mutator MutT protein  36.84 
 
 		 138 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2650  hypothetical protein  35.35 
 
 		 315 aa  53.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3582  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.76 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000334964  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3838  NUDIX hydrolase  34.19 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0218718  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  37.27 
 
 		 134 aa  52.8  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11185  mutator protein mutT  33.04 
 
 		 141 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0122522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3076  NUDIX hydrolase  34.74 
 
 		 149 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2457  putative mutT-like protein  33.96 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0799  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.544133  normal  0.428384 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0356  mutator MutT protein  37.23 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0223709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0325  NUDIX hydrolase  33.96 
 
 		 129 aa  52  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.849393  normal  0.626146 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2711  NUDIX hydrolase  35 
 
 		 149 aa  52  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0080  NUDIX hydrolase  45.76 
 
 		 195 aa  52.4  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0312  mutator MutT protein  37.23 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.672809  normal  0.370797 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4548  NUDIX hydrolase  35.78 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.223367  normal  0.325156 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  36.67 
 
 		 132 aa  52.4  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2967  NUDIX hydrolase  33.64 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668202  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3770  NUDIX hydrolase  34.19 
 
 		 200 aa  51.6  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.288059 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0498  putative mutator protein(7,8-dihydro-8- oxoguanine-triphosphatase), MutT  35.85 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8400  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  34.65 
 
 		 139 aa  51.6  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.24066 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3115  NUDIX hydrolase  33.64 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.630714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1863  NUDIX hydrolase  35.4 
 
 		 132 aa  52  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.477977  normal  0.665179 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  37.04 
 
 		 142 aa  51.6  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0154  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  31.78 
 
 		 131 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000120622  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  37.04 
 
 		 137 aa  51.6  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0428  NUDIX hydrolase  52.08 
 
 		 138 aa  51.6  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.834318  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0027  hypothetical protein  39.02 
 
 		 312 aa  51.2  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.132128 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2914  mutator mutT protein  32.41 
 
 		 136 aa  51.6  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  35.16 
 
 		 132 aa  51.6  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2380  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 169 aa  51.2  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2957  MutT/nudix family protein  27.59 
 
 		 159 aa  51.6  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2640  MutT/nudix family protein  27.59 
 
 		 159 aa  51.6  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0434568  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0405  hypothetical protein  37.74 
 
 		 320 aa  51.6  0.000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1184  NUDIX hydrolase  29.01 
 
 		 147 aa  51.6  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000616693  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0465  hypothetical protein  38.78 
 
 		 320 aa  51.2  0.000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0356  mutator MutT protein  31.19 
 
 		 136 aa  50.8  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2586  NUDIX hydrolase  35.09 
 
 		 138 aa  51.2  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2463  NUDIX hydrolase  34.51 
 
 		 148 aa  51.2  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.101073  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4321  NUDIX hydrolase  33.03 
 
 		 291 aa  50.8  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2654  NUDIX hydrolase  27.19 
 
 		 139 aa  50.8  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0149  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  31.01 
 
 		 131 aa  50.8  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.97066  hitchhiker  0.00538151 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4056  mutator MutT protein  31.73 
 
 		 131 aa  50.8  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.640988  normal  0.0322443 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2661  NUDIX hydrolase  34.91 
 
 		 147 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0755  NUDIX hydrolase  30.63 
 
 		 267 aa  50.8  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0414471  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1829  NUDIX hydrolase  31.53 
 
 		 150 aa  50.8  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000906254  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  34.62 
 
 		 144 aa  50.8  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8468  NUDIX hydrolase  36.28 
 
 		 130 aa  50.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0503  putative mutator mutt protein (7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase)  31.78 
 
 		 137 aa  50.8  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.213775 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1331  dinucleoside polyphosphate hydrolase  45.76 
 
 		 174 aa  50.4  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0212  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  32.17 
 
 		 368 aa  50.8  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.880726  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2154  NUDIX hydrolase  36.11 
 
 		 206 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.114898  hitchhiker  0.00867781 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0149  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  31.01 
 
 		 131 aa  50.4  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0349436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0153  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  31.01 
 
 		 131 aa  50.4  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.471922  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>