More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3006 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3006  NUDIX hydrolase  100 
 
 
141 aa  290  4e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2458  NUDIX hydrolase  33.87 
 
 
138 aa  57.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0504  NUDIX hydrolase  39.47 
 
 
101 aa  57.8  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.163605  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2654  NUDIX hydrolase  34.65 
 
 
139 aa  56.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2175  NUDIX hydrolase  38.95 
 
 
133 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.523963 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0501  NUDIX hydrolase  29.09 
 
 
131 aa  52.4  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0370899  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0488  NUDIX hydrolase  29.09 
 
 
131 aa  52.4  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.262793  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2639  NUDIX hydrolase  60 
 
 
148 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3464  NUDIX hydrolase  60 
 
 
148 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.815689  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0292  mutator mutT protein  38.54 
 
 
128 aa  51.2  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0189  NUDIX hydrolase  37.37 
 
 
161 aa  50.8  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0527  hypothetical protein  32.22 
 
 
326 aa  50.4  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0926831  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2968  NAD(+) diphosphatase  36.47 
 
 
303 aa  49.7  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0592  hypothetical protein  31 
 
 
316 aa  49.7  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1206  NUDIX hydrolase  36.89 
 
 
154 aa  50.1  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.483034 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2914  mutator mutT protein  33.91 
 
 
136 aa  49.7  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262626  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0463  NUDIX hydrolase  32.5 
 
 
135 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0439  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
145 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2672  NUDIX hydrolase  39.47 
 
 
158 aa  48.5  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0408434 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3536  NUDIX hydrolase  51.11 
 
 
168 aa  48.5  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0388  mutator MutT protein  34.38 
 
 
138 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1603  NUDIX hydrolase  43.14 
 
 
157 aa  48.1  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0283951  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2756  NUDIX hydrolase  40.79 
 
 
159 aa  47.8  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1530  NUDIX hydrolase  37.97 
 
 
137 aa  47.8  0.00006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.249617  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4504  NUDIX hydrolase  44.07 
 
 
134 aa  47.8  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0549022  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1907  NUDIX hydrolase  31.19 
 
 
149 aa  47.8  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.397506  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3562  NUDIX hydrolase  31.67 
 
 
135 aa  47.4  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0356  mutator MutT protein  34.38 
 
 
138 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0223709  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0027  hypothetical protein  37.04 
 
 
312 aa  47.4  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.132128 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1137  NUDIX hydrolase  30.36 
 
 
286 aa  47.4  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.217943  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4018  NUDIX hydrolase  33.08 
 
 
154 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0312  mutator MutT protein  34.38 
 
 
138 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.672809  normal  0.370797 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0467  NUDIX hydrolase  31.67 
 
 
135 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3895  NUDIX hydrolase  33.59 
 
 
151 aa  47.4  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4327  NUDIX hydrolase  35.58 
 
 
145 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.356422 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1930  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 
151 aa  47  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.104334  normal  0.229344 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1287  NUDIX hydrolase  31.71 
 
 
154 aa  47  0.00009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0960276  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0464  MutT/nudix family protein  31.93 
 
 
135 aa  47  0.00009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0178  mutT/nudix family protein  48.89 
 
 
168 aa  47  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1514  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 
307 aa  47  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.315266  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0364  mutator mutT protein  31.25 
 
 
137 aa  47  0.00009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3458  NUDIX hydrolase  34.52 
 
 
153 aa  47  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000764325 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  30.39 
 
 
141 aa  46.6  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0691  mutT/nudix family protein  29.91 
 
 
140 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4795  mutT/nudix family protein  50 
 
 
168 aa  46.2  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.223434  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4636  Nudix hydrolase  50 
 
 
168 aa  46.2  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4656  Nudix hydrolase  50 
 
 
168 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119165  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  34.38 
 
 
132 aa  46.6  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3838  NUDIX hydrolase  35.42 
 
 
144 aa  46.6  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0218718  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5158  mutT/nudix family protein  50 
 
 
168 aa  46.2  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.972651  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5035  mutT/nudix family protein  50 
 
 
168 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3822  NUDIX hydrolase  32.54 
 
 
145 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2278  NUDIX hydrolase  30.84 
 
 
134 aa  46.6  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.369324  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1935  NUDIX hydrolase  55.56 
 
 
142 aa  46.6  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3039  Protein of unknown function DUF2029  35.11 
 
 
570 aa  46.2  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5063  mutT/nudix family protein  47.73 
 
 
168 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2047  NUDIX hydrolase  41.51 
 
 
156 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0613  NUDIX hydrolase  42.22 
 
 
171 aa  45.4  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03249  mutator mutT protein  32.53 
 
 
127 aa  45.8  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3508  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  33.33 
 
 
128 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116101  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1479  NUDIX hydrolase  32.63 
 
 
135 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142432  hitchhiker  0.00620383 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0677  mutT/nudix family protein  30.1 
 
 
140 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000877041 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1303  NUDIX hydrolase  36.71 
 
 
140 aa  46.2  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26900  ADP-ribose pyrophosphatase  29.75 
 
 
160 aa  45.4  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5064  mutT/nudix family protein  46.67 
 
 
168 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5069  mutT/nudix family protein  47.73 
 
 
168 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5152  NUDIX hydrolase  50 
 
 
144 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000414992 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3377  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  33.33 
 
 
128 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0382964  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2908  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  33.33 
 
 
128 aa  45.8  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0055236  normal  0.908985 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0700  NUDIX hydrolase  55.26 
 
 
132 aa  45.8  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0602  NUDIX hydrolase  51.35 
 
 
228 aa  45.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1335  NUDIX hydrolase  42.22 
 
 
171 aa  45.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  34.31 
 
 
132 aa  45.4  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0589  mutT/nudix family protein  31.07 
 
 
140 aa  45.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2447  NUDIX hydrolase  29.67 
 
 
129 aa  45.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000652481  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0533  MutT/NUDIX family protein  31.07 
 
 
140 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.133702  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1272  NUDIX hydrolase  38 
 
 
183 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0387  NUDIX hydrolase  32.99 
 
 
129 aa  45.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.724674  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0622  mutT/nudix family protein  31.07 
 
 
140 aa  45.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1043  NUDIX hydrolase  48.89 
 
 
229 aa  45.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.541609  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1187  NUDIX hydrolase  50 
 
 
143 aa  45.4  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1416  NUDIX hydrolase  31.13 
 
 
163 aa  45.4  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1128  NUDIX hydrolase  39.22 
 
 
141 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0349929  normal  0.45534 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0482  NUDIX hydrolase  31.03 
 
 
150 aa  45.4  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0614  NUDIX hydrolase  34.74 
 
 
135 aa  45.1  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0852421  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0537  NUDIX hydrolase  57.58 
 
 
190 aa  45.4  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.572946  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4056  mutator MutT protein  27.62 
 
 
131 aa  45.4  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.640988  normal  0.0322443 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4940  NUDIX hydrolase  31.43 
 
 
146 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000317059 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0519  MutT/nudix family protein  61.29 
 
 
146 aa  44.7  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0812  NUDIX hydrolase  63.33 
 
 
166 aa  44.7  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.64339  normal  0.9117 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0500  NUDIX hydrolase  31.52 
 
 
152 aa  45.1  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.43555 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1582  NUDIX hydrolase  29.67 
 
 
261 aa  44.7  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0428  NUDIX hydrolase  30.61 
 
 
138 aa  44.7  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.834318  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2054  NUDIX hydrolase  48 
 
 
226 aa  45.1  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.762923  normal  0.0850915 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1261  NUDIX hydrolase  35.11 
 
 
147 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5745  NUDIX hydrolase  42.03 
 
 
231 aa  44.7  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0363  mutator MutT protein  38.18 
 
 
131 aa  44.7  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  unclonable  0.00000739307 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0475  NUDIX hydrolase  31.52 
 
 
152 aa  45.1  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.573491  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0533  MutT/NUDIX family protein  29.13 
 
 
140 aa  44.3  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  35.63 
 
 
143 aa  44.3  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>