More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0592 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0592  hypothetical protein  100 
 
 		 316 aa  643    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2179  hypothetical protein  41.4 
 
 		 314 aa  239  5e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.299804  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0306  hypothetical protein  40.06 
 
 		 321 aa  223  4e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4397  mutT/nudix family protein  39.43 
 
 		 316 aa  219  6e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  38.1 
 
 		 314 aa  219  6e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4376  hypothetical protein  37.46 
 
 		 314 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4971  hypothetical protein  38.41 
 
 		 315 aa  217  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  37.46 
 
 		 314 aa  215  8e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4501  hypothetical protein  37.14 
 
 		 314 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.523087  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0934  hypothetical protein  37.26 
 
 		 313 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.268176 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  38.98 
 
 		 313 aa  211  1e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57190  hypothetical protein  37.78 
 
 		 315 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4091  hypothetical protein  37.54 
 
 		 316 aa  208  9e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4425  hypothetical protein  35.87 
 
 		 314 aa  206  3e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2025  mutator MutT protein  39.48 
 
 		 322 aa  204  1e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.153674  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0781  mutator MutT protein  38.49 
 
 		 317 aa  201  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0134531  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04356  hypothetical protein  35.91 
 
 		 302 aa  189  5.999999999999999e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  35.76 
 
 		 318 aa  187  1e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2230  hypothetical protein  37.1 
 
 		 310 aa  186  3e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.328266  normal  0.270342 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2441  mutator MutT protein  38.78 
 
 		 329 aa  185  8e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0027  hypothetical protein  38.61 
 
 		 312 aa  179  4e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.132128 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0858  hypothetical protein  36.45 
 
 		 317 aa  179  5.999999999999999e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1007  hypothetical protein  36.18 
 
 		 325 aa  176  5e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1678  hypothetical protein  35.06 
 
 		 306 aa  176  6e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.552334  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2084  hypothetical protein  36.59 
 
 		 319 aa  171  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.498942 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3659  hypothetical protein  36.51 
 
 		 316 aa  163  3e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817347  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2189  thiamine monophosphate synthase  34.85 
 
 		 315 aa  162  9e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.988337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0405  hypothetical protein  34.33 
 
 		 320 aa  162  9e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0465  hypothetical protein  33.67 
 
 		 320 aa  157  2e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3706  hypothetical protein  33.75 
 
 		 314 aa  155  1e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.461385 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1996  NUDIX hydrolase  32.48 
 
 		 352 aa  133  3e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.42027  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0403  mutator MutT protein  31.21 
 
 		 329 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0220424 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0227  mutator mutT protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase family protein  31.21 
 
 		 329 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0210  dGTP-pyrophosphohydrolase; thiamine phosphate synthase  36.26 
 
 		 212 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0218369  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0984  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase protein  36.31 
 
 		 198 aa  114  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.462651 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1618  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.26 
 
 		 199 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1604  NUDIX hydrolase  27.73 
 
 		 369 aa  112  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000210752  hitchhiker  0.0000224711 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03249  mutator mutT protein  45.53 
 
 		 127 aa  110  4.0000000000000004e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0583  thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE, putative  39.18 
 
 		 196 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2605  mutator MutT protein  44.26 
 
 		 128 aa  109  6e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.402694  hitchhiker  0.00000000101323 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0407  mutator MutT protein  44.88 
 
 		 129 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0363  mutator MutT protein  39.68 
 
 		 131 aa  106  6e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000739307 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3510  mutator MutT protein  43.09 
 
 		 130 aa  105  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.39786  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3611  mutator MutT protein  41.73 
 
 		 132 aa  103  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0414  mutator MutT protein  41.73 
 
 		 132 aa  103  4e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0413  mutator MutT protein  41.73 
 
 		 132 aa  102  7e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00478582 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0410  mutator mutT protein  40.94 
 
 		 130 aa  101  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2636  mutator MutT protein (7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase)  42.06 
 
 		 133 aa  101  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1686  NUDIX hydrolase  25.5 
 
 		 360 aa  101  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.873349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3873  mutator MutT protein  40.32 
 
 		 130 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107436 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3948  mutator MutT protein  40.32 
 
 		 130 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0287  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE  38.34 
 
 		 196 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.519508  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1507  NUDIX hydrolase  27.07 
 
 		 360 aa  100  3e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0878  dGTP-pyrophosphohydrolase; thiamine phosphate synthase  38.34 
 
 		 196 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3444  mutator MutT protein  41.6 
 
 		 129 aa  100  4e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3925  mutator MutT protein  39.52 
 
 		 130 aa  100  4e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0319  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE  38.34 
 
 		 209 aa  100  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2440  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE  38.34 
 
 		 209 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.363141  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1664  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE  38.34 
 
 		 209 aa  100  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1467  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE  38.34 
 
 		 209 aa  100  4e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2576  thiamine monophosphate synthase  38.34 
 
 		 209 aa  99.8  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4066  mutator MutT protein  39.52 
 
 		 130 aa  99.8  5e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5573  thiamine monophosphate synthase  35.08 
 
 		 194 aa  99.4  7e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3429  mutator MutT protein  40.94 
 
 		 134 aa  99.4  8e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3789  mutator MutT protein  39.37 
 
 		 131 aa  98.2  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0419  mutator MutT protein  43.65 
 
 		 129 aa  97.4  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293063 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0153  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.48 
 
 		 131 aa  97.1  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.471922  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0620  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.84 
 
 		 132 aa  96.3  6e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2246  thiamine monophosphate synthase  35.5 
 
 		 194 aa  95.9  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0548714 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3747  thiamine monophosphate synthase  34.55 
 
 		 194 aa  95.9  8e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.907624  normal  0.127935 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0154  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.68 
 
 		 131 aa  95.9  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000120622  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00100  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase, marked preference for dGTP  38.1 
 
 		 129 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.126012  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3501  mutator MutT protein  38.1 
 
 		 129 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3558  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.1 
 
 		 129 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.016637  hitchhiker  0.00136766 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00099  hypothetical protein  38.1 
 
 		 129 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.146865  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0771  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  42.28 
 
 		 134 aa  95.1  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  0.720455 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0149  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.68 
 
 		 131 aa  95.5  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0349436  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4453  mutator mutT protein  38.13 
 
 		 144 aa  94.7  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0347377  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0107  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.1 
 
 		 132 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000992989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0105  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.1 
 
 		 129 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000458525  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0101  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.3 
 
 		 129 aa  94  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000708829  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0104  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.3 
 
 		 132 aa  93.6  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000574829  normal  0.261189 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0093  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.3 
 
 		 129 aa  92.4  8e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000316081  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1156  mutator MutT protein  38.4 
 
 		 126 aa  92.4  8e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000464506  normal  0.12144 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1420  Mutator protein MutT  37.5 
 
 		 134 aa  92.4  9e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1564  Mutator protein MutT  37.5 
 
 		 134 aa  92.4  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0364  mutator mutT protein  40.52 
 
 		 137 aa  92.4  1e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2908  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.2 
 
 		 128 aa  91.3  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0055236  normal  0.908985 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0149  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.89 
 
 		 131 aa  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.97066  hitchhiker  0.00538151 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3377  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.2 
 
 		 128 aa  91.3  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0382964  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4895  thiamine monophosphate synthase  37.28 
 
 		 194 aa  91.7  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166292 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2650  hypothetical protein  28.97 
 
 		 315 aa  91.7  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3508  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.2 
 
 		 128 aa  91.3  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116101  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0146  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.89 
 
 		 131 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17541  A/G-specific DNA glycosylase  37.88 
 
 		 399 aa  90.9  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4056  mutator MutT protein  37.72 
 
 		 131 aa  90.5  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.640988  normal  0.0322443 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00910  hypothetical protein  37.5 
 
 		 132 aa  89.7  6e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3677  thiamine monophosphate synthase  34.91 
 
 		 194 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.62971  normal  0.140239 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4514  thiamine monophosphate synthase  34.91 
 
 		 194 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3850  thiamine monophosphate synthase  34.91 
 
 		 194 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>