242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_2405 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009800  EcHS_A2396  NUDIX family hydrolase  100 
 
 		 141 aa  246  6e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.64074  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2405  NUDIX family hydrolase  100 
 
 		 120 aa  246  9e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02177  predicted NUDIX hydrolase  99.17 
 
 		 141 aa  246  1e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.256653  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1407  NUDIX hydrolase  99.17 
 
 		 141 aa  246  1e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1398  NUDIX hydrolase  99.17 
 
 		 141 aa  246  1e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.708086  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02136  hypothetical protein  99.17 
 
 		 141 aa  246  1e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.284783  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3392  hydrolase, NUDIX family  99.17 
 
 		 120 aa  244  2e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2546  NUDIX family hydrolase  99.17 
 
 		 141 aa  244  4e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2639  NUDIX family hydrolase  86.67 
 
 		 141 aa  219  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2480  NUDIX family hydrolase  86.67 
 
 		 141 aa  219  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2523  hydrolase, nudix family  85.83 
 
 		 141 aa  218  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.464819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2431  hydrolase, nudix family  85.83 
 
 		 141 aa  218  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2535  NUDIX family hydrolase  85.83 
 
 		 141 aa  217  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3123  NUDIX hydrolase  73.33 
 
 		 141 aa  181  2.0000000000000003e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0687463 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13970  NUDIX hydrolase  35.24 
 
 		 146 aa  65.9  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0294014  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2930  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 149 aa  60.1  0.000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2310  NUDIX hydrolase  32.73 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.288899 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  35 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 137 aa  53.9  0.0000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4313  NUDIX hydrolase  33.7 
 
 		 153 aa  53.9  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  30.84 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1950  NUDIX hydrolase  31.36 
 
 		 255 aa  52.4  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.666959  hitchhiker  0.00341622 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  35 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1712  NUDIX hydrolase  34 
 
 		 138 aa  52  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148507  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  31.43 
 
 		 136 aa  52  0.000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  34 
 
 		 132 aa  51.2  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  34 
 
 		 132 aa  51.2  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  35 
 
 		 132 aa  51.2  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7624  NUDIX hydrolase  38.18 
 
 		 169 aa  51.2  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.299419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1319  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 143 aa  50.8  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3147  NUDIX hydrolase  29.63 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.232456  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8967  NUDIX hydrolase  33.64 
 
 		 155 aa  50.8  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035368  normal  0.614637 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4630  NUDIX hydrolase  34.09 
 
 		 158 aa  50.4  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.595719 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  32.61 
 
 		 155 aa  50.1  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  28 
 
 		 155 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4811  NUDIX hydrolase  33 
 
 		 138 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.304627  decreased coverage  0.0000674364 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0715  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 299 aa  50.1  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  28 
 
 		 155 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  28 
 
 		 155 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  32.99 
 
 		 347 aa  49.3  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  33 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  33 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1680  hypothetical protein  31.19 
 
 		 269 aa  49.7  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0029  NUDIX hydrolase  33 
 
 		 137 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  32 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01721  adenine glycosylase  32.48 
 
 		 400 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1689  NUDIX hydrolase  34.69 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  32 
 
 		 138 aa  48.5  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  32 
 
 		 137 aa  48.9  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  29.41 
 
 		 156 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0110  NUDIX hydrolase  33 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5595  NUDIX hydrolase  28.44 
 
 		 155 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  28.44 
 
 		 155 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1775  NUDIX hydrolase  31.3 
 
 		 166 aa  48.1  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108748  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2914  mutator mutT protein  32 
 
 		 136 aa  47.8  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  28.44 
 
 		 155 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7592  putative mutator protein mutT  33 
 
 		 136 aa  47.4  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0886771 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  29.52 
 
 		 139 aa  47  0.00008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0292  mutator mutT protein  32 
 
 		 128 aa  47  0.00009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4650  NUDIX hydrolase  27.36 
 
 		 163 aa  47  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6695  NUDIX hydrolase  30.48 
 
 		 175 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.412462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1287  NUDIX hydrolase  38.67 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0960276  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0387  NUDIX hydrolase  33 
 
 		 129 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.724674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0099  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  27.93 
 
 		 396 aa  46.6  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0722569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  32 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0756  NUDIX hydrolase  32.14 
 
 		 230 aa  46.6  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229185  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  33 
 
 		 144 aa  46.2  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0880  NUDIX hydrolase  27.19 
 
 		 132 aa  46.2  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.577802  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2266  mutator MutT protein  32 
 
 		 138 aa  46.2  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.97404 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  34.48 
 
 		 146 aa  46.2  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1547  NUDIX hydrolase  32.11 
 
 		 334 aa  46.2  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07700  NTP pyrophosphohydrolase  37.66 
 
 		 241 aa  45.8  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.054443  normal  0.43952 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0605  NUDIX hydrolase  31.18 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3639  NUDIX hydrolase  27.78 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2482  NUDIX hydrolase  30.85 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1350  NUDIX hydrolase  30.19 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0110  NUDIX hydrolase  28.97 
 
 		 136 aa  46.2  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  31 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0388  mutator MutT protein  32 
 
 		 138 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2716  MutT/NUDIX family protein  29.35 
 
 		 137 aa  45.1  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3658  mutator MutT protein  33 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236932  normal  0.362443 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  30.28 
 
 		 156 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1582  NUDIX hydrolase  41.27 
 
 		 261 aa  45.1  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0356  mutator MutT protein  32 
 
 		 138 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0223709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2421  NUDIX hydrolase  34.07 
 
 		 233 aa  45.4  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0467  NUDIX hydrolase  29.07 
 
 		 135 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2278  NUDIX hydrolase  27.17 
 
 		 134 aa  45.4  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.369324  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0312  mutator MutT protein  32 
 
 		 138 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.672809  normal  0.370797 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0463  NUDIX hydrolase  29.07 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3659  hypothetical protein  30.7 
 
 		 316 aa  45.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817347  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  35.63 
 
 		 140 aa  45.1  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1486  NUDIX hydrolase  31.07 
 
 		 131 aa  45.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00282357  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0464  MutT/nudix family protein  27.91 
 
 		 135 aa  45.1  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0969  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 158 aa  45.1  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.767014  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0504  NUDIX hydrolase  52.5 
 
 		 101 aa  45.1  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.163605  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0597  NUDIX hydrolase  31 
 
 		 133 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  30.28 
 
 		 156 aa  45.1  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1094  phosphohydrolase (MutT/nudix family protein)  41.54 
 
 		 260 aa  44.7  0.0005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.10735  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2289  NUDIX hydrolase  31.53 
 
 		 132 aa  44.3  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.648467  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0428  NUDIX hydrolase  34.95 
 
 		 138 aa  44.3  0.0005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.834318  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>