111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4630 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4630  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 158 aa  323  8.000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.595719 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0969  NUDIX hydrolase  52.94 
 
 		 158 aa  168  3e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.767014  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05631  hypothetical protein  41.72 
 
 		 150 aa  128  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1472  NUDIX hydrolase  42.47 
 
 		 150 aa  114  6e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181973  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000271  NUDIX hydrolase domain-containing protein  39.72 
 
 		 152 aa  110  5e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0455  NUDIX hydrolase  34.42 
 
 		 171 aa  98.6  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0011  NUDIX hydrolase  42.15 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.695589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0412  NUDIX hydrolase  34.58 
 
 		 174 aa  62  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0161756  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1417  NUDIX hydrolase  29.23 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0166  NUDIX hydrolase  28.33 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2546  NUDIX family hydrolase  34.09 
 
 		 141 aa  50.8  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2396  NUDIX family hydrolase  34.09 
 
 		 141 aa  50.8  0.000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.64074  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2405  NUDIX family hydrolase  34.09 
 
 		 120 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3392  hydrolase, NUDIX family  34.09 
 
 		 120 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02177  predicted NUDIX hydrolase  34.09 
 
 		 141 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.256653  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1407  NUDIX hydrolase  34.09 
 
 		 141 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  30.66 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1398  NUDIX hydrolase  34.09 
 
 		 141 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.708086  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02136  hypothetical protein  34.09 
 
 		 141 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.284783  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1402  NUDIX hydrolase  27.74 
 
 		 148 aa  48.9  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3070  NUDIX hydrolase  26.87 
 
 		 141 aa  48.5  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.973852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0092  NUDIX hydrolase  30.52 
 
 		 160 aa  48.1  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0201302  normal  0.41925 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2246  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 		 168 aa  47.8  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.171331  decreased coverage  0.0000730626 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2202  NUDIX hydrolase  32.03 
 
 		 143 aa  47.4  0.00007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1382  NUDIX hydrolase  25.74 
 
 		 144 aa  47  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2523  hydrolase, nudix family  31.82 
 
 		 141 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.464819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2431  hydrolase, nudix family  31.82 
 
 		 141 aa  47.4  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0749  NUDIX family hydrolase  29.46 
 
 		 164 aa  46.6  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.159748  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0736  NUDIX domain-containing protein  29.46 
 
 		 164 aa  46.6  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0277965  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1335  NUDIX hydrolase  27.73 
 
 		 171 aa  46.6  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0996  NUDIX hydrolase  32.77 
 
 		 133 aa  47  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2480  NUDIX family hydrolase  30.68 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2535  NUDIX family hydrolase  30.68 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2639  NUDIX family hydrolase  30.68 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2758  NUDIX hydrolase  25.37 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2976  NUDIX hydrolase  29.92 
 
 		 162 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  38.16 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2829  phosphohydrolase  44.07 
 
 		 289 aa  45.1  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0306563  normal  0.214675 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0415  NTP pyrophosphohydrolase  30.95 
 
 		 289 aa  45.1  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.362153  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0714  NUDIX hydrolase  33.05 
 
 		 298 aa  45.1  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2164  NUDIX hydrolase  44.12 
 
 		 143 aa  45.1  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.019865 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1821  lipoate-protein ligase B  29.01 
 
 		 365 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3562  NUDIX hydrolase  34.07 
 
 		 135 aa  44.7  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4065  NUDIX hydrolase  29.59 
 
 		 143 aa  44.7  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4483  NUDIX hydrolase  30.14 
 
 		 153 aa  44.7  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2398  NUDIX hydrolase  43.06 
 
 		 177 aa  44.7  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.10425  normal  0.260078 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0467  NUDIX hydrolase  34.07 
 
 		 135 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3131  NUDIX hydrolase  26.23 
 
 		 145 aa  44.7  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.278733  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0905  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 		 139 aa  44.3  0.0006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.729176  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0260  NUDIX hydrolase  28.39 
 
 		 303 aa  44.7  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  30.7 
 
 		 146 aa  43.9  0.0008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2044  NUDIX hydrolase  34.57 
 
 		 147 aa  43.9  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490099 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1999  lipoate-protein ligase B  31.67 
 
 		 383 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  40.68 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0694  NUDIX hydrolase  37 
 
 		 214 aa  43.9  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.496821  normal  0.528067 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3109  mutT/nudix family protein  36.67 
 
 		 192 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0878  NUDIX hydrolase  25.93 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0852  Polynucleotide adenylyltransferase region  27.83 
 
 		 577 aa  43.1  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2741  mutT/nudix family protein  26.02 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191847  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0464  MutT/nudix family protein  34.07 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0463  NUDIX hydrolase  34.07 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2333  NUDIX hydrolase  28.12 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0613  NUDIX hydrolase  26.05 
 
 		 171 aa  43.1  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1338  NUDIX hydrolase  25.62 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000650565  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0775  NUDIX hydrolase  32.08 
 
 		 177 aa  42.7  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2039  lipoate-protein ligase B  28.24 
 
 		 365 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.237895  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1914  NUDIX hydrolase  29.36 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.592421  normal  0.977797 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5809  NUDIX hydrolase  27.42 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.180379  decreased coverage  0.0027447 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4860  NUDIX hydrolase  30.25 
 
 		 163 aa  43.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2109  lipoate-protein ligase B  28.24 
 
 		 365 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0939106  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36090  ADP-ribose pyrophosphatase  35.14 
 
 		 229 aa  42.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.453332  normal  0.430111 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21220  uridine kinase  38.81 
 
 		 354 aa  42.7  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0727  NUDIX/MutT family protein  32.74 
 
 		 150 aa  42  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.371838  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0791  NUDIX family hydrolase  26.98 
 
 		 142 aa  42.4  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000502884  hitchhiker  6.80479e-24 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3123  NUDIX hydrolase  28.41 
 
 		 141 aa  42.4  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0687463 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3363  NUDIX hydrolase  37.1 
 
 		 219 aa  42  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5641  NUDIX hydrolase  30.37 
 
 		 146 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2839  MutT/NUDIX family phosphohydrolase  38.18 
 
 		 174 aa  42  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00481979  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0673  NUDIX hydrolase  52.38 
 
 		 158 aa  41.6  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.612507  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2448  NUDIX hydrolase  42 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0479485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2705  mutT/nudix family protein  36.36 
 
 		 147 aa  42  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2158  mutT/nudix family protein  38.18 
 
 		 174 aa  42  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37900  ADP-ribose pyrophosphatase  25 
 
 		 205 aa  41.6  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.525356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1074  NUDIX hydrolase  42.42 
 
 		 261 aa  41.2  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 156 aa  41.2  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2065  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  26.06 
 
 		 156 aa  41.6  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1757  NUDIX hydrolase  46.77 
 
 		 144 aa  41.6  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207601  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1340  NUDIX hydrolase  40.98 
 
 		 171 aa  41.6  0.005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.902443 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2570  NUDIX hydrolase  32.35 
 
 		 146 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.240186  normal  0.520915 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0885  NUDIX hydrolase  26.55 
 
 		 145 aa  41.6  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  29.37 
 
 		 139 aa  41.6  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5226  NUDIX hydrolase  24.58 
 
 		 150 aa  41.6  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0916804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2727  NUDIX hydrolase  40.98 
 
 		 322 aa  41.6  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00813927 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2121  NUDIX hydrolase  28.44 
 
 		 140 aa  41.6  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.575199  decreased coverage  0.00514227 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3110  MutT/nudix family protein  42.22 
 
 		 176 aa  41.2  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0202445  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1062  NUDIX family hydrolase  27.88 
 
 		 149 aa  41.2  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0194838  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0504  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 163 aa  41.2  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.316146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7955  hypothetical protein  33.7 
 
 		 172 aa  41.2  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2799  MutT/Nudix family protein  36.36 
 
 		 174 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3165  NUDIX hydrolase  47.54 
 
 		 225 aa  40.8  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.036982 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>