101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000271 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000271  NUDIX hydrolase domain-containing protein  100 
 
 		 152 aa  319  9.999999999999999e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05631  hypothetical protein  78.81 
 
 		 150 aa  259  1e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1472  NUDIX hydrolase  61.59 
 
 		 150 aa  185  1e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181973  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0969  NUDIX hydrolase  42.96 
 
 		 158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.767014  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4630  NUDIX hydrolase  39.72 
 
 		 158 aa  110  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.595719 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0455  NUDIX hydrolase  32.81 
 
 		 171 aa  85.5  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0412  NUDIX hydrolase  35.4 
 
 		 174 aa  70.9  0.000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0161756  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2333  NUDIX hydrolase  29.69 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1821  lipoate-protein ligase B  32.17 
 
 		 365 aa  53.9  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1417  NUDIX hydrolase  29.27 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 		 139 aa  53.5  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2039  lipoate-protein ligase B  34.75 
 
 		 365 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.237895  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2109  lipoate-protein ligase B  34.75 
 
 		 365 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0939106  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1689  NUDIX hydrolase  31.53 
 
 		 140 aa  51.2  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  33.64 
 
 		 146 aa  50.8  0.000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26900  ADP-ribose pyrophosphatase  27.54 
 
 		 160 aa  50.8  0.000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  30.23 
 
 		 140 aa  50.4  0.000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0166  NUDIX hydrolase  28.41 
 
 		 172 aa  50.4  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3070  NUDIX hydrolase  31.9 
 
 		 141 aa  48.5  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.973852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1007  NUDIX hydrolase  32.77 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.175488  hitchhiker  0.000423095 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0507  dATP pyrophosphohydrolase  27.82 
 
 		 150 aa  48.1  0.00004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0852  Polynucleotide adenylyltransferase region  24.43 
 
 		 577 aa  48.1  0.00004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0444  dATP pyrophosphohydrolase  33.59 
 
 		 146 aa  48.1  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.847222 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2758  NUDIX hydrolase  31.36 
 
 		 142 aa  47.8  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0878  NUDIX hydrolase  31.03 
 
 		 140 aa  47.4  0.00006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2202  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  30.71 
 
 		 583 aa  47.8  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1639  NUDIX hydrolase  26.15 
 
 		 136 aa  46.2  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000053664  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1999  lipoate-protein ligase B  29.75 
 
 		 383 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4065  NUDIX hydrolase  28.71 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1412  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  32.14 
 
 		 138 aa  45.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2202  NUDIX hydrolase  29.51 
 
 		 143 aa  45.4  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1382  NUDIX hydrolase  30.51 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2758  putative mut-like protein  31.07 
 
 		 163 aa  45.1  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1687  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  30.36 
 
 		 140 aa  44.7  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1993  NUDIX hydrolase  28.06 
 
 		 142 aa  45.1  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2159  dATP pyrophosphohydrolase  29.1 
 
 		 154 aa  44.7  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2310  NUDIX hydrolase  30 
 
 		 138 aa  45.1  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.288899 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2488  dATP pyrophosphohydrolase  29.92 
 
 		 145 aa  44.3  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000650379  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2453  dATP pyrophosphohydrolase  29.92 
 
 		 145 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.401359  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1402  NUDIX hydrolase  27.97 
 
 		 148 aa  44.7  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 		 156 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3707  NUDIX hydrolase  28.24 
 
 		 150 aa  44.3  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.000000974348 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3131  NUDIX hydrolase  29.92 
 
 		 145 aa  43.9  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.278733  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0673  NUDIX hydrolase  28.26 
 
 		 141 aa  43.9  0.0008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.51908 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0784  NUDIX hydrolase  31.88 
 
 		 155 aa  43.9  0.0008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0885  NUDIX hydrolase  29.92 
 
 		 145 aa  43.9  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1874  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  32.14 
 
 		 138 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400032  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1428  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  32.14 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1395  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  32.14 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0511972 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2045  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  32.14 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2727  mutT/nudix family protein  29.92 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000208593 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01836  dATP pyrophosphohydrolase  43.4 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.618356  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2741  mutT/nudix family protein  31.25 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191847  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2528  mutT/nudix family protein  31.5 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0638585  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2713  mutT/nudix family protein  31.5 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2266  mutator MutT protein  32.5 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.97404 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2433  dATP pyrophosphohydrolase  29.63 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0218705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1958  dATP pyrophosphohydrolase  43.4 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.683601  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2095  dATP pyrophosphohydrolase  43.4 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0764827  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1321  dATP pyrophosphohydrolase  43.4 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.832088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3051  NUDIX hydrolase  27.84 
 
 		 154 aa  42.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1107  dATP pyrophosphohydrolase  43.4 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3873  mutator MutT protein  46.94 
 
 		 130 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107436 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01824  hypothetical protein  43.4 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.452157  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1775  NUDIX hydrolase  43.4 
 
 		 169 aa  42  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00597986  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0387  NUDIX hydrolase  26.61 
 
 		 252 aa  42  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.231232 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1767  dATP pyrophosphohydrolase  43.4 
 
 		 169 aa  42  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.502024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2059  dATP pyrophosphohydrolase  41.18 
 
 		 146 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0369752 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2114  dATP pyrophosphohydrolase  41.18 
 
 		 150 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00720061 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2054  dATP pyrophosphohydrolase  41.18 
 
 		 150 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.830611 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1223  dATP pyrophosphohydrolase  41.18 
 
 		 150 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.315157  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1347  dATP pyrophosphohydrolase  41.51 
 
 		 150 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00224987 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2601  dATP pyrophosphohydrolase  43.4 
 
 		 169 aa  42  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.110942  normal  0.760647 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3784  NUDIX hydrolase  29.67 
 
 		 158 aa  42  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.360863 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13970  NUDIX hydrolase  35.43 
 
 		 146 aa  42  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0294014  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3543  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 160 aa  42  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.291144  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2698  A/G-specific adenine glycosylase  28.04 
 
 		 396 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.265639 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2939  NUDIX hydrolase  51.28 
 
 		 130 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2776  mutT/nudix family protein  29.13 
 
 		 146 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0589  mutT/nudix family protein  33.85 
 
 		 140 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0533  MutT/NUDIX family protein  33.85 
 
 		 140 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.133702  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0622  mutT/nudix family protein  33.85 
 
 		 140 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3219  NUDIX hydrolase  26.72 
 
 		 149 aa  41.2  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1338  NUDIX hydrolase  26.76 
 
 		 150 aa  41.2  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000650565  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2636  mutator MutT protein (7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase)  37.5 
 
 		 133 aa  41.2  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1430  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  29.31 
 
 		 135 aa  40.8  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.166534  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4208  NUDIX hydrolase  23.48 
 
 		 174 aa  40.8  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1238  hypothetical protein  25.55 
 
 		 250 aa  40.4  0.008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1983  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  29.31 
 
 		 135 aa  40.4  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000136061  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0677  mutT/nudix family protein  33.85 
 
 		 140 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000877041 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01728  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  29.31 
 
 		 135 aa  40.4  0.009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.10262  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1883  NUDIX hydrolase  29.31 
 
 		 135 aa  40.4  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.410943  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0533  MutT/NUDIX family protein  33.85 
 
 		 140 aa  40.4  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1873  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  29.31 
 
 		 135 aa  40.4  0.009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.440168  hitchhiker  0.000083786 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0996  NUDIX hydrolase  26 
 
 		 133 aa  40.4  0.009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01716  hypothetical protein  29.31 
 
 		 135 aa  40.4  0.009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.15744  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4841  NUDIX hydrolase  28.03 
 
 		 272 aa  40.4  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0292  mutator mutT protein  34.52 
 
 		 128 aa  40.4  0.01  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2570  mutT/nudix family protein  28.68 
 
 		 146 aa  40  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0593331 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0473  protein of unknown function DUF1152  30.33 
 
 		 530 aa  40  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>