176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_21220 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_21220  uridine kinase  100 
 
 		 354 aa  689    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0450  uridine kinase-like protein  54.26 
 
 		 198 aa  202  9.999999999999999e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.220272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05090  hypothetical protein  49.49 
 
 		 212 aa  189  5.999999999999999e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0374  Uridine kinase-like protein  55.9 
 
 		 221 aa  189  8e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3297  ATP-binding protein  50.78 
 
 		 231 aa  175  9.999999999999999e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.187999  decreased coverage  0.000867237 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3531  uridine kinase  49.49 
 
 		 203 aa  167  4e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.268098  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08140  uridine kinase  46.28 
 
 		 223 aa  141  1.9999999999999998e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.982733  normal  0.431984 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5273  Uridine kinase-like protein  50.85 
 
 		 212 aa  140  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10560  uridine kinase  40.11 
 
 		 206 aa  114  3e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.177054  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3019  NUDIX hydrolase  44.2 
 
 		 139 aa  93.2  6e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0809676 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3918  NUDIX hydrolase  44.6 
 
 		 136 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.49136  normal  0.198135 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12360  ADP-ribose pyrophosphatase  46.67 
 
 		 136 aa  87.4  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1495  NUDIX hydrolase  43.38 
 
 		 149 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0340127 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02110  NUDIX family protein  42.25 
 
 		 399 aa  85.1  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0925  NUDIX hydrolase  40.94 
 
 		 159 aa  83.2  0.000000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4181  mutT/nudix family protein  43.26 
 
 		 136 aa  82.8  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.487882  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0214  NUDIX hydrolase  51.65 
 
 		 134 aa  80.5  0.00000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1092  NUDIX hydrolase  43.86 
 
 		 137 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0227714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0808  NUDIX hydrolase  43.08 
 
 		 136 aa  79.7  0.00000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.291918  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3934  NUDIX hydrolase  41.61 
 
 		 139 aa  79.3  0.00000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19205  hypothetical protein  40.88 
 
 		 152 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1370  NUDIX hydrolase  41.74 
 
 		 141 aa  77  0.0000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2859  NUDIX hydrolase  42.45 
 
 		 398 aa  75.5  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.010676 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1657  hypothetical protein  40 
 
 		 152 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.745316  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4350  NUDIX hydrolase  41.53 
 
 		 137 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.199934  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1062  NUDIX hydrolase  41.53 
 
 		 137 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1103  NUDIX hydrolase  41.53 
 
 		 137 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.440474 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3757  NUDIX hydrolase  44.7 
 
 		 154 aa  73.2  0.000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1773  NUDIX hydrolase  40.18 
 
 		 149 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.292364  normal  0.252484 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1163  NUDIX hydrolase  40.18 
 
 		 139 aa  72.4  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.997199 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4549  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 		 144 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0460835  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22000  NTP pyrophosphohydrolase  38.93 
 
 		 156 aa  70.5  0.00000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3058  NUDIX hydrolase  44.34 
 
 		 134 aa  68.6  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1718  NUDIX hydrolase  37.93 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3179  NUDIX hydrolase  40.91 
 
 		 129 aa  62  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.292191 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1522  NUDIX hydrolase  36.89 
 
 		 160 aa  59.3  0.00000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000261274 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0229  putative MutT family protein  40.18 
 
 		 141 aa  58.2  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2398  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 		 177 aa  57  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.10425  normal  0.260078 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10701  uridine kinase  27.33 
 
 		 202 aa  55.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0555332 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0031  phosphoribulokinase/uridine kinase  29.51 
 
 		 555 aa  54.7  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2047  uridine kinase  29.61 
 
 		 212 aa  55.1  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.20095  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0350  NUDIX hydrolase  29.01 
 
 		 132 aa  55.1  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3203  NUDIX hydrolase  44.09 
 
 		 182 aa  53.9  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1781  uridine kinase  25.88 
 
 		 209 aa  52.4  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1522  NUDIX hydrolase  42.7 
 
 		 163 aa  52.4  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.467089  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2463  uridine kinase  28.21 
 
 		 213 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.92076  normal  0.601786 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1819  uridine kinase  27.15 
 
 		 232 aa  51.2  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2356  uridine kinase  28.21 
 
 		 213 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0747859  normal  0.616244 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2349  uridine kinase  28.21 
 
 		 213 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2246  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 168 aa  52  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.171331  decreased coverage  0.0000730626 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2249  uridine kinase  28.21 
 
 		 213 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1979  uridine kinase  27.63 
 
 		 211 aa  51.6  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000633687  hitchhiker  0.00165825 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0812  NUDIX hydrolase  36.63 
 
 		 137 aa  52  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01972  uridine kinase  28.39 
 
 		 213 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1591  uridine kinase  28.39 
 
 		 213 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00393606  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01961  hypothetical protein  28.39 
 
 		 213 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1820  uridine kinase  27.15 
 
 		 232 aa  51.2  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12970  uridine kinase  26.85 
 
 		 204 aa  50.8  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000147377  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3003  uridine kinase  28.39 
 
 		 213 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.384394 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2521  NUDIX hydrolase  34.31 
 
 		 132 aa  50.8  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.28701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0994  uridine kinase  28.39 
 
 		 213 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1166  uridine kinase  28.39 
 
 		 213 aa  51.2  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1575  uridine kinase  28.39 
 
 		 213 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0267753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2206  uridine kinase  28.39 
 
 		 213 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2359  uridine kinase  28.39 
 
 		 213 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2453  uridine kinase  27.45 
 
 		 213 aa  50.1  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2552  uridine kinase  27.45 
 
 		 213 aa  50.1  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3195  uridine kinase  27.45 
 
 		 213 aa  50.1  0.00006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0472319  hitchhiker  0.00149984 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37460  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  33.33 
 
 		 212 aa  49.7  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.50041  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2802  NUDIX hydrolase  32.09 
 
 		 159 aa  49.7  0.00008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.44267  hitchhiker  0.00236205 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0388  uridine kinase  24.5 
 
 		 204 aa  49.3  0.00009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00997727  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2651  uridine kinase  28.29 
 
 		 211 aa  49.7  0.00009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.212203 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0202  uridine kinase  29.09 
 
 		 204 aa  49.3  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2305  uridine kinase  28.21 
 
 		 213 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1575  uridine kinase  26.32 
 
 		 211 aa  49.3  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43015  predicted protein  31.3 
 
 		 526 aa  48.9  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.239566  hitchhiker  0.00935325 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0339  uridine kinase  22.73 
 
 		 207 aa  48.9  0.0001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1576  uridine kinase  25.79 
 
 		 213 aa  48.9  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.435743 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1694  NUDIX hydrolase  31.15 
 
 		 138 aa  48.9  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.253225 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl306  uridine kinase  27.52 
 
 		 208 aa  48.1  0.0002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000466982  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0422  uridine kinase  26.17 
 
 		 207 aa  48.1  0.0002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.174111  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1033  uridine kinase  24.41 
 
 		 210 aa  48.1  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.12732  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1261  NUDIX hydrolase  37.01 
 
 		 147 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1041  NUDIX hydrolase  41.86 
 
 		 154 aa  48.1  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.317547  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1848  uridine kinase  31.21 
 
 		 220 aa  48.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2456  uridine kinase  26.97 
 
 		 212 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000511378  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1888  uridine kinase  26.97 
 
 		 212 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000127737  normal  0.0259304 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2576  uridine kinase  26.97 
 
 		 212 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0976754  normal  0.0423229 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1290  phosphoribulokinase/uridine kinase  23.53 
 
 		 547 aa  48.5  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.297478  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3706  hypothetical protein  32.03 
 
 		 314 aa  47.8  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.461385 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0041  phosphoribulokinase/uridine kinase  33.33 
 
 		 554 aa  47.8  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.448598  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0488  NUDIX hydrolase  29.17 
 
 		 131 aa  47.8  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.262793  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0501  NUDIX hydrolase  29.17 
 
 		 131 aa  47.8  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0370899  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2976  NUDIX hydrolase  33.08 
 
 		 162 aa  47.8  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2054  uridine kinase  26.32 
 
 		 212 aa  47.4  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1974  uridine kinase  23.68 
 
 		 216 aa  47  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.308367  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0697  MutT related protein  36.25 
 
 		 145 aa  47  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.382229  normal  0.361701 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2463  uridine kinase  26.97 
 
 		 212 aa  47  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000426115  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2432  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 		 136 aa  47  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.20024 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2617  uridine kinase  26.32 
 
 		 212 aa  47  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>