47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0374 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0374  Uridine kinase-like protein  100 
 
 
221 aa  432  1e-120  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05090  hypothetical protein  58.29 
 
 
212 aa  246  2e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0450  uridine kinase-like protein  53.93 
 
 
198 aa  209  2e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.220272  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3297  ATP-binding protein  56.68 
 
 
231 aa  205  3e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.187999  decreased coverage  0.000867237 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21220  uridine kinase  55.9 
 
 
354 aa  201  9e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3531  uridine kinase  48.99 
 
 
203 aa  175  4e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.268098  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08140  uridine kinase  46.46 
 
 
223 aa  152  2.9999999999999998e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.982733  normal  0.431984 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5273  Uridine kinase-like protein  47.83 
 
 
212 aa  152  5e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10560  uridine kinase  40.24 
 
 
206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.177054  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0422  uridine kinase  26.54 
 
 
207 aa  58.5  0.00000007  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.174111  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0031  phosphoribulokinase/uridine kinase  30 
 
 
555 aa  56.6  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl306  uridine kinase  30.72 
 
 
208 aa  56.2  0.0000004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000466982  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81319  uridine kinase  28.29 
 
 
504 aa  52.8  0.000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0146953  normal  0.484619 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0823  uridine kinase  27.27 
 
 
219 aa  52  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0339  uridine kinase  23.31 
 
 
207 aa  50.4  0.00002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1489  uridine kinase  26.29 
 
 
212 aa  50.8  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0501777  normal  0.122094 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2463  uridine kinase  27.92 
 
 
212 aa  50.1  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000426115  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43015  predicted protein  36.94 
 
 
526 aa  50.4  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.239566  hitchhiker  0.00935325 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2054  uridine kinase  24.26 
 
 
212 aa  48.9  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1919  uridine kinase  26.9 
 
 
211 aa  48.5  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2218  uridine kinase  25.15 
 
 
212 aa  48.1  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.428302  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1215  uridine kinase  28.18 
 
 
218 aa  48.1  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000175656  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1974  uridine kinase  21.26 
 
 
216 aa  47.4  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.308367  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1435  AAA ATPase  26.79 
 
 
552 aa  47.4  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1848  uridine kinase  29.46 
 
 
220 aa  47.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1702  uridine kinase  26.12 
 
 
207 aa  47.4  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.69825  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1668  uridine kinase  26.12 
 
 
207 aa  47.4  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2651  uridine kinase  24.56 
 
 
211 aa  47.4  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.212203 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0533  uridine kinase  26.45 
 
 
207 aa  46.2  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1361  AAA ATPase  28.45 
 
 
547 aa  45.8  0.0005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.762498  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2482  uridine kinase  23.64 
 
 
211 aa  45.8  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2386  uridine kinase  27.92 
 
 
209 aa  45.4  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000694748  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1554  putative threonyl-tRNA synthetase/uridine kinase  26.5 
 
 
551 aa  45.4  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.614355  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1289  uridine kinase  24.26 
 
 
213 aa  45.4  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.731499  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1347  phosphoribulokinase / uridine kinase family protein  26.5 
 
 
551 aa  45.4  0.0007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2047  uridine kinase  25.86 
 
 
212 aa  45.4  0.0007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.20095  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1819  uridine kinase  25.15 
 
 
232 aa  44.7  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1820  uridine kinase  25.15 
 
 
232 aa  44.7  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2364  uridine kinase  26.19 
 
 
219 aa  44.7  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0644  uridine kinase  24.26 
 
 
213 aa  43.9  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000687916  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10770  uridine kinase  26.79 
 
 
549 aa  42.7  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0202  uridine kinase  27.98 
 
 
204 aa  42.7  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3054  uridine kinase  27.63 
 
 
201 aa  42.7  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.654412  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3054  phosphoribulokinase/uridine kinase  24.37 
 
 
462 aa  42  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0044  uridine kinase  29.11 
 
 
211 aa  42  0.008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1033  uridine kinase  24.1 
 
 
210 aa  42  0.008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.12732  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2289  phosphoribulokinase/uridine kinase family protein  31.58 
 
 
550 aa  41.6  0.009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0142692  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>