96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_08140 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_08140  uridine kinase  100 
 
 		 223 aa  438  9.999999999999999e-123  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.982733  normal  0.431984 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3297  ATP-binding protein  51.1 
 
 		 231 aa  149  3e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.187999  decreased coverage  0.000867237 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05090  hypothetical protein  43.6 
 
 		 212 aa  144  9e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0450  uridine kinase-like protein  47.95 
 
 		 198 aa  144  9e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.220272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0374  Uridine kinase-like protein  46.46 
 
 		 221 aa  142  4e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21220  uridine kinase  46.28 
 
 		 354 aa  141  8e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3531  uridine kinase  43.56 
 
 		 203 aa  138  4.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.268098  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10560  uridine kinase  44.26 
 
 		 206 aa  124  1e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.177054  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5273  Uridine kinase-like protein  43.5 
 
 		 212 aa  123  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1435  AAA ATPase  32.2 
 
 		 552 aa  60.8  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0044  uridine kinase  33.13 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1385  uridine kinase  30.65 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3054  uridine kinase  32.26 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.654412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1330  uridine kinase  32.02 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.60785 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3162  phosphoribulokinase/uridine kinase  27.01 
 
 		 552 aa  55.5  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0422  uridine kinase  24.62 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.174111  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1033  uridine kinase  25.18 
 
 		 210 aa  54.7  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.12732  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0202  uridine kinase  29.35 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1979  uridine kinase  26.67 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000633687  hitchhiker  0.00165825 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10701  uridine kinase  26.28 
 
 		 202 aa  53.9  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0555332 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl306  uridine kinase  25.42 
 
 		 208 aa  54.3  0.000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000466982  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0823  uridine kinase  26.7 
 
 		 219 aa  52.8  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2386  uridine kinase  23 
 
 		 209 aa  51.6  0.000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000694748  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81319  uridine kinase  25 
 
 		 504 aa  51.2  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0146953  normal  0.484619 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0935  uridine kinase  26.77 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1079  uridine kinase  26.77 
 
 		 215 aa  50.8  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.210616  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0339  uridine kinase  23.42 
 
 		 207 aa  50.1  0.00003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1365  uridine kinase  23.2 
 
 		 204 aa  50.1  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.759935  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2364  uridine kinase  25.12 
 
 		 219 aa  50.1  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0537  uridine kinase  24.16 
 
 		 242 aa  49.7  0.00004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0563702  hitchhiker  0.00000000000000916272 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2482  uridine kinase  23.83 
 
 		 211 aa  49.3  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1820  uridine kinase  26.5 
 
 		 232 aa  49.3  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1888  uridine kinase  24.24 
 
 		 212 aa  49.3  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000127737  normal  0.0259304 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12970  uridine kinase  23.56 
 
 		 204 aa  49.3  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000147377  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1819  uridine kinase  26.5 
 
 		 232 aa  49.3  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2576  uridine kinase  24.24 
 
 		 212 aa  49.3  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0976754  normal  0.0423229 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2456  uridine kinase  24.24 
 
 		 212 aa  49.3  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000511378  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1361  AAA ATPase  32.46 
 
 		 547 aa  48.9  0.00006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.762498  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0176  phosphoribulokinase/uridine kinase  28.95 
 
 		 555 aa  48.5  0.00007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0833476  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0178  phosphoribulokinase/uridine kinase  28.95 
 
 		 555 aa  48.5  0.00007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.871097  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0531  AAA ATPase  29.2 
 
 		 554 aa  48.5  0.00009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.777332  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0031  phosphoribulokinase/uridine kinase  28.81 
 
 		 555 aa  48.1  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00730  uridine kinase  26.5 
 
 		 207 aa  48.1  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0558456  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10770  uridine kinase  31.36 
 
 		 549 aa  47.8  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1781  uridine kinase  25.88 
 
 		 209 aa  47.8  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1762  uridine kinase  24.24 
 
 		 212 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0067733  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2617  uridine kinase  24.24 
 
 		 212 aa  48.1  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1732  uridine kinase  24.24 
 
 		 212 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000414727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2463  uridine kinase  24.24 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000426115  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0533  uridine kinase  24.5 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1657  uridine kinase  24.24 
 
 		 212 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0722731  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4124  uridine kinase  23.16 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2244  uridine kinase  23.76 
 
 		 212 aa  47.4  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4460  uridine kinase  23.16 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0770159 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4276  uridine kinase  23.67 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2651  uridine kinase  25 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.212203 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3093  uridine kinase  22.6 
 
 		 212 aa  47.4  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4113  uridine kinase  23.16 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4608  uridine kinase  23.67 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1175  uridine kinase  26.22 
 
 		 207 aa  46.6  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0041  phosphoribulokinase/uridine kinase  32.2 
 
 		 554 aa  46.6  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.448598  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2289  phosphoribulokinase/uridine kinase family protein  28.68 
 
 		 550 aa  47  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0142692  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4500  uridine kinase  22.6 
 
 		 212 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.403076  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02150  uridine kinase, putative  22.22 
 
 		 582 aa  47  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1347  phosphoribulokinase / uridine kinase family protein  27.08 
 
 		 551 aa  46.2  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1554  putative threonyl-tRNA synthetase/uridine kinase  27.08 
 
 		 551 aa  46.2  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.614355  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0970  uridine kinase  27.67 
 
 		 211 aa  46.2  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2218  uridine kinase  24.24 
 
 		 212 aa  46.2  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.428302  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3961  phosphoribulokinase/uridine kinase  25.81 
 
 		 203 aa  45.8  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.926817 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0453  uridine kinase  24.18 
 
 		 201 aa  45.4  0.0006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00211906  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1745  phosphoribulokinase family protein  27.87 
 
 		 529 aa  45.4  0.0006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4513  uridine kinase  22.6 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000000295414  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1215  uridine kinase  27.03 
 
 		 218 aa  44.7  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000175656  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4227  uridine kinase  22.6 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3054  phosphoribulokinase/uridine kinase  30.77 
 
 		 462 aa  44.7  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4462  uridine kinase  22.6 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0409991  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1919  uridine kinase  24.24 
 
 		 211 aa  44.7  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1668  uridine kinase  25.47 
 
 		 207 aa  44.7  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1702  uridine kinase  25.47 
 
 		 207 aa  44.7  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.69825  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0736  uridine kinase  22.03 
 
 		 212 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.441671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0315  uridine kinase  23.46 
 
 		 214 aa  43.9  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5127  phosphoribulokinase/uridine kinase  25.17 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.426663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2054  uridine kinase  23.35 
 
 		 212 aa  44.3  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0332  phosphoribulokinase/uridine kinase  33.71 
 
 		 557 aa  43.5  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2238  phosphoribulokinase/uridine kinase  29.06 
 
 		 567 aa  43.5  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.958517  normal  0.150287 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1763  phosphoribulokinase/uridine kinase  28.95 
 
 		 559 aa  43.1  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.295373  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1167  hypothetical protein  24.06 
 
 		 238 aa  43.1  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1173  hypothetical protein  24.06 
 
 		 238 aa  42.4  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2023  uridine kinase  21.93 
 
 		 208 aa  42.7  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2916  Uridine kinase  27.21 
 
 		 213 aa  42.4  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000624404 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2047  uridine kinase  23.86 
 
 		 212 aa  42.4  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.20095  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1575  uridine kinase  24.1 
 
 		 211 aa  42.4  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0011  uridine kinase  23.23 
 
 		 202 aa  42.4  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1422  uridine kinase  25 
 
 		 236 aa  42.4  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_47740  predicted protein  23.3 
 
 		 434 aa  41.6  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0678521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0134  phosphoribulokinase/uridine kinase  27.5 
 
 		 558 aa  41.6  0.009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>