More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0134 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0134  phosphoribulokinase/uridine kinase  100 
 
 		 558 aa  1135    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1763  phosphoribulokinase/uridine kinase  66.42 
 
 		 559 aa  739    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.295373  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0176  phosphoribulokinase/uridine kinase  57.66 
 
 		 555 aa  630  1e-179  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0833476  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0178  phosphoribulokinase/uridine kinase  57.66 
 
 		 555 aa  630  1e-179  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.871097  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1435  phosphoribulokinase/uridine kinase  53.45 
 
 		 553 aa  583  1.0000000000000001e-165  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10770  uridine kinase  48.2 
 
 		 549 aa  518  1e-146  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0332  phosphoribulokinase/uridine kinase  50 
 
 		 557 aa  509  1e-143  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3519  phosphoribulokinase/uridine kinase  46.25 
 
 		 553 aa  500  1e-140  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1290  phosphoribulokinase/uridine kinase  47.02 
 
 		 547 aa  496  1e-139  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.297478  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1435  AAA ATPase  48.28 
 
 		 552 aa  498  1e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3162  phosphoribulokinase/uridine kinase  46.04 
 
 		 552 aa  485  1e-135  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0531  AAA ATPase  45.54 
 
 		 554 aa  478  1e-134  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.777332  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1101  uridine kinase  44.4 
 
 		 557 aa  467  9.999999999999999e-131  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0041  phosphoribulokinase/uridine kinase  43.42 
 
 		 554 aa  463  1e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.448598  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1347  phosphoribulokinase / uridine kinase family protein  45.14 
 
 		 551 aa  447  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1554  putative threonyl-tRNA synthetase/uridine kinase  44.6 
 
 		 551 aa  442  1e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.614355  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1361  AAA ATPase  44.12 
 
 		 547 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.762498  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2238  phosphoribulokinase/uridine kinase  44.53 
 
 		 567 aa  435  1e-121  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.958517  normal  0.150287 
 
 
-
 
NC_002950  PG1745  phosphoribulokinase family protein  41.15 
 
 		 529 aa  429  1e-119  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0031  phosphoribulokinase/uridine kinase  44.21 
 
 		 555 aa  430  1e-119  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3054  phosphoribulokinase/uridine kinase  44.21 
 
 		 462 aa  395  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2289  phosphoribulokinase/uridine kinase family protein  38.53 
 
 		 550 aa  370  1e-101  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0142692  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3852  cyclic nucleotide-binding protein  33.04 
 
 		 713 aa  301  2e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.108661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3723  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  32.69 
 
 		 714 aa  287  4e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3863  cyclic nucleotide-binding protein  32.52 
 
 		 715 aa  286  5e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0623706  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3780  cyclic nucleotide-binding protein  32.23 
 
 		 715 aa  281  3e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12201  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05580  Threonyl-tRNA synthetase  26.6 
 
 		 646 aa  80.5  0.00000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000588041  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0185  threonyl-tRNA synthetase  25.25 
 
 		 639 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000179764  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4407  threonyl-tRNA synthetase  28.5 
 
 		 645 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00383919  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1418  threonyl-tRNA synthetase  25.49 
 
 		 638 aa  79.7  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000102997  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0552  threonyl-tRNA synthetase  28.5 
 
 		 645 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000171694  unclonable  1.90469e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4707  threonyl-tRNA synthetase  28.5 
 
 		 645 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000334194  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4472  threonyl-tRNA synthetase  28.5 
 
 		 645 aa  79  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.419718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4307  threonyl-tRNA synthetase  28.5 
 
 		 645 aa  79  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00228432  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4318  threonyl-tRNA synthetase  28.5 
 
 		 645 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0311311  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4685  threonyl-tRNA synthetase  28.5 
 
 		 645 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00204863  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4820  threonyl-tRNA synthetase  28.5 
 
 		 645 aa  79  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00851939  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4691  threonyl-tRNA synthetase  28.5 
 
 		 645 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.88699e-59 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4701  threonyl-tRNA synthetase  28.5 
 
 		 645 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000566692  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2145  threonyl-tRNA synthetase  27.41 
 
 		 639 aa  78.2  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3262  threonyl-tRNA synthetase  26.77 
 
 		 643 aa  78.2  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00002753  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2823  threonyl-tRNA synthetase  26 
 
 		 643 aa  78.2  0.0000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000177582  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81319  uridine kinase  27.49 
 
 		 504 aa  77.4  0.0000000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0146953  normal  0.484619 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2419  threonyl-tRNA synthetase  27.92 
 
 		 640 aa  77.4  0.0000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2661  threonyl-tRNA synthetase  24.63 
 
 		 644 aa  77  0.0000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000386283  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2489  threonyl-tRNA synthetase  26.9 
 
 		 639 aa  77  0.0000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.952507  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1300  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  25.91 
 
 		 639 aa  77  0.0000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2973  threonyl-tRNA synthetase  27.41 
 
 		 640 aa  77  0.0000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.617243 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2222  threonyl-tRNA synthetase  27.92 
 
 		 639 aa  77  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2161  threonyl-tRNA synthetase  27.92 
 
 		 639 aa  77  0.0000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.820955  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2388  threonyl-tRNA synthetase  27.92 
 
 		 639 aa  77  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2405  threonyl-tRNA synthetase  27.92 
 
 		 639 aa  77  0.0000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0043  threonyl-tRNA synthetase  24.56 
 
 		 649 aa  76.6  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1669  threonyl-tRNA synthetase  24.1 
 
 		 637 aa  76.6  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000137846  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2354  threonyl-tRNA synthetase  27.92 
 
 		 640 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0608  threonyl-tRNA synthetase  28.8 
 
 		 634 aa  76.3  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.769524  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2193  threonyl-tRNA synthetase  27.41 
 
 		 639 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2175  threonyl-tRNA synthetase  23.38 
 
 		 648 aa  75.1  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1759  threonyl-tRNA synthetase  25.13 
 
 		 633 aa  74.3  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000991077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0797  threonyl-tRNA synthetase  24.24 
 
 		 652 aa  73.6  0.000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0711  threonyl-tRNA synthetase  25.87 
 
 		 647 aa  72.8  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2057  threonyl-tRNA synthetase  30.63 
 
 		 634 aa  72.4  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000136416  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0725  threonyl-tRNA synthetase  30.61 
 
 		 638 aa  72.4  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0187  threonyl-tRNA synthetase  30.1 
 
 		 640 aa  72  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00194489  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0189  threonyl-tRNA synthetase  29.59 
 
 		 640 aa  72  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114049  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0392  threonyl-tRNA synthetase  26.87 
 
 		 633 aa  71.6  0.00000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06531  threonyl-tRNA synthetase  23.88 
 
 		 640 aa  71.2  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1327  threonyl-tRNA synthetase  27.27 
 
 		 636 aa  70.9  0.00000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0393085  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0613  threonyl-tRNA synthetase  25.13 
 
 		 648 aa  70.5  0.00000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1411  threonyl-tRNA synthetase  23.71 
 
 		 645 aa  70.1  0.00000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000074774  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1384  threonyl-tRNA synthetase  22.94 
 
 		 635 aa  69.7  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000717334  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1493  uridine kinase  29.35 
 
 		 196 aa  68.9  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.54247 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1515  threonyl-tRNA synthetase  21.13 
 
 		 636 aa  68.6  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00436769  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1767  threonyl-tRNA synthetase  24.75 
 
 		 640 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.143728  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0623  threonyl-tRNA synthetase  21.83 
 
 		 662 aa  68.2  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2230  threonyl-tRNA synthetase  21.65 
 
 		 636 aa  68.2  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00712554 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0033  threonyl-tRNA synthetase  24.88 
 
 		 641 aa  67.8  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.611945  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0984  threonyl-tRNA synthetase  23.88 
 
 		 644 aa  67.4  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.234013 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0424  threonyl-tRNA synthetase  25.9 
 
 		 644 aa  67.4  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000699319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3742  threonyl-tRNA synthetase  23.71 
 
 		 646 aa  67  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.190527  hitchhiker  0.00137888 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1990  threonyl-tRNA synthetase  21.65 
 
 		 636 aa  67  0.0000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0457996  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4546  phosphoribulokinase/uridine kinase  29.52 
 
 		 217 aa  67  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.896481 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1612  threonyl-tRNA synthetase  24.14 
 
 		 635 aa  67  0.0000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000178172  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2401  threonyl-tRNA synthetase  24.75 
 
 		 634 aa  66.2  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.162517  normal  0.284009 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0707  threonyl-tRNA synthetase  21.78 
 
 		 644 aa  65.5  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00542671  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2628  threonyl-tRNA synthetase  23.2 
 
 		 645 aa  66.2  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000255721  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2181  threonyl-tRNA synthetase  25.12 
 
 		 646 aa  65.9  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07150  uridine kinase  29.15 
 
 		 202 aa  66.2  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0011  uridine kinase  29.15 
 
 		 202 aa  65.5  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0427  threonyl-tRNA synthetase  23.78 
 
 		 640 aa  65.5  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0436469  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1281  uridine kinase  26.37 
 
 		 209 aa  65.1  0.000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2308  threonyl-tRNA synthetase  23.71 
 
 		 636 aa  64.7  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304156  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0202  uridine kinase  25.76 
 
 		 204 aa  64.7  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1330  uridine kinase  28.28 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.60785 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2003  threonyl-tRNA synthetase  22.96 
 
 		 635 aa  64.3  0.000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00562927  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0978  threonyl-tRNA synthetase  25.73 
 
 		 633 aa  63.9  0.000000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1228  threonyl-tRNA synthetase  22.03 
 
 		 635 aa  63.9  0.000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000338672  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1175  uridine kinase  28.72 
 
 		 207 aa  63.5  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2639  threonyl-tRNA synthetase  21.89 
 
 		 644 aa  63.2  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.3159  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2997  threonyl-tRNA synthetase  21.24 
 
 		 644 aa  63.2  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>