More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_1290 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010320  Teth514_1290  phosphoribulokinase/uridine kinase  100 
 
 		 547 aa  1111    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.297478  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0332  phosphoribulokinase/uridine kinase  54.75 
 
 		 557 aa  572  1.0000000000000001e-162  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0041  phosphoribulokinase/uridine kinase  52.46 
 
 		 554 aa  561  1.0000000000000001e-159  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.448598  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10770  uridine kinase  54.14 
 
 		 549 aa  561  1e-158  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3162  phosphoribulokinase/uridine kinase  50.73 
 
 		 552 aa  545  1e-154  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0531  AAA ATPase  51.85 
 
 		 554 aa  543  1e-153  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.777332  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0178  phosphoribulokinase/uridine kinase  52.04 
 
 		 555 aa  531  1e-149  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.871097  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0176  phosphoribulokinase/uridine kinase  52.23 
 
 		 555 aa  531  1e-149  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0833476  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1435  AAA ATPase  49.17 
 
 		 552 aa  526  1e-148  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1101  uridine kinase  48.51 
 
 		 557 aa  523  1e-147  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0134  phosphoribulokinase/uridine kinase  47.02 
 
 		 558 aa  496  1e-139  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3519  phosphoribulokinase/uridine kinase  47.09 
 
 		 553 aa  497  1e-139  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1435  phosphoribulokinase/uridine kinase  46.13 
 
 		 553 aa  478  1e-133  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1347  phosphoribulokinase / uridine kinase family protein  49.42 
 
 		 551 aa  467  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1554  putative threonyl-tRNA synthetase/uridine kinase  47.53 
 
 		 551 aa  464  1e-129  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.614355  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0031  phosphoribulokinase/uridine kinase  46.6 
 
 		 555 aa  459  9.999999999999999e-129  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1361  AAA ATPase  44.19 
 
 		 547 aa  460  9.999999999999999e-129  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.762498  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1763  phosphoribulokinase/uridine kinase  47.17 
 
 		 559 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.295373  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1745  phosphoribulokinase family protein  42.5 
 
 		 529 aa  426  1e-118  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2238  phosphoribulokinase/uridine kinase  43.8 
 
 		 567 aa  423  1e-117  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.958517  normal  0.150287 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2289  phosphoribulokinase/uridine kinase family protein  41.56 
 
 		 550 aa  410  1e-113  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0142692  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3054  phosphoribulokinase/uridine kinase  43.71 
 
 		 462 aa  393  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3852  cyclic nucleotide-binding protein  35.06 
 
 		 713 aa  307  4.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.108661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3723  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  34.12 
 
 		 714 aa  303  4.0000000000000003e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3863  cyclic nucleotide-binding protein  33.33 
 
 		 715 aa  298  2e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0623706  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3780  cyclic nucleotide-binding protein  33.15 
 
 		 715 aa  295  1e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12201  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2136  threonyl-tRNA synthetase  31.75 
 
 		 644 aa  99.4  1e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000263348  hitchhiker  0.00165189 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1089  threonyl-tRNA synthetase  32.8 
 
 		 635 aa  99.8  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00500732  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05580  Threonyl-tRNA synthetase  31.38 
 
 		 646 aa  98.6  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000588041  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1967  threonyl-tRNA synthetase  31.22 
 
 		 640 aa  97.4  6e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0134711  normal  0.0132251 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3481  threonyl-tRNA synthetase  31.75 
 
 		 640 aa  96.7  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.800828  normal  0.0249513 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2230  threonyl-tRNA synthetase  32.97 
 
 		 636 aa  96.3  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00712554 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2465  threonyl-tRNA synthetase  35.19 
 
 		 640 aa  95.9  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1990  threonyl-tRNA synthetase  32.42 
 
 		 636 aa  95.5  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0457996  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2859  threonyl-tRNA synthetase  30.27 
 
 		 639 aa  95.1  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.248456  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20420  threonyl-tRNA synthetase  33.95 
 
 		 640 aa  95.1  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2145  threonyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 639 aa  94.4  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0185  threonyl-tRNA synthetase  29.1 
 
 		 639 aa  94.4  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000179764  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1384  threonyl-tRNA synthetase  32.64 
 
 		 635 aa  94.4  5e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000717334  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2061  threonyl-tRNA synthetase  32.28 
 
 		 641 aa  94  7e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.399726  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3225  threonyl-tRNA synthetase  34.57 
 
 		 640 aa  93.6  8e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.529889 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2504  threonyl-tRNA synthetase  33.95 
 
 		 640 aa  93.6  8e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28650  threonyl-tRNA synthetase  33.95 
 
 		 640 aa  93.6  8e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000737785 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1870  threonyl-tRNA synthetase  30.27 
 
 		 635 aa  93.6  9e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.47552  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1228  threonyl-tRNA synthetase  30.37 
 
 		 635 aa  92  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000338672  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1415  threonyl-tRNA synthetase  29.1 
 
 		 660 aa  92  2e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000939714  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1418  threonyl-tRNA synthetase  31.25 
 
 		 638 aa  92.4  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000102997  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1759  threonyl-tRNA synthetase  29.53 
 
 		 633 aa  92.8  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000991077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2308  threonyl-tRNA synthetase  31.91 
 
 		 636 aa  92.4  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304156  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1478  threonyl-tRNA synthetase  29.1 
 
 		 660 aa  91.3  4e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000148351  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2417  threonyl-tRNA synthetase  29.63 
 
 		 644 aa  91.3  4e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00010604  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2823  threonyl-tRNA synthetase  31.61 
 
 		 643 aa  90.5  8e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000177582  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2098  threonyl-tRNA synthetase  30.16 
 
 		 644 aa  89.7  1e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000824061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0427  threonyl-tRNA synthetase  32.72 
 
 		 640 aa  89.7  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0436469  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2628  threonyl-tRNA synthetase  30.94 
 
 		 645 aa  90.1  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000255721  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0768  threonyl-tRNA synthetase  29.47 
 
 		 641 aa  90.1  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.67512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0912  threonyl-tRNA synthetase  30.37 
 
 		 638 aa  89.4  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2222  threonyl-tRNA synthetase  31.75 
 
 		 639 aa  88.6  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2388  threonyl-tRNA synthetase  31.75 
 
 		 639 aa  88.6  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0707  threonyl-tRNA synthetase  28.86 
 
 		 644 aa  88.6  3e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00542671  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0748  threonyl-tRNA synthetase  30.26 
 
 		 652 aa  88.6  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1515  threonyl-tRNA synthetase  28.73 
 
 		 636 aa  88.2  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00436769  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0801  threonyl-tRNA synthetase  33.74 
 
 		 647 aa  88.2  4e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00121365  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1300  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  30.21 
 
 		 639 aa  88.2  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2489  threonyl-tRNA synthetase  31.22 
 
 		 639 aa  87.8  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.952507  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2419  threonyl-tRNA synthetase  31.75 
 
 		 640 aa  87.8  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2243  threonyl-tRNA synthetase  32.12 
 
 		 644 aa  87.4  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00594301  hitchhiker  0.00373508 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2614  threonyl-tRNA synthetase  32.12 
 
 		 644 aa  87.4  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2805  threonyl-tRNA synthetase  28.65 
 
 		 633 aa  87.4  6e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1411  threonyl-tRNA synthetase  30.94 
 
 		 645 aa  87.4  6e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000074774  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2161  threonyl-tRNA synthetase  31.22 
 
 		 639 aa  87  8e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.820955  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2405  threonyl-tRNA synthetase  31.22 
 
 		 639 aa  87  8e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1976  threonyl-tRNA synthetase  32.1 
 
 		 640 aa  87  8e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.30647  normal  0.0664699 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0424  threonyl-tRNA synthetase  32.92 
 
 		 644 aa  86.7  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000699319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1612  threonyl-tRNA synthetase  32.43 
 
 		 635 aa  86.7  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000178172  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1647  threonyl-tRNA synthetase  30.37 
 
 		 635 aa  85.5  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0710025 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0723  threonyl-tRNA synthetase  31.91 
 
 		 631 aa  85.5  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000476694  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1669  threonyl-tRNA synthetase  29.1 
 
 		 637 aa  85.9  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000137846  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0829  threonyl-tRNA synthetase  31.05 
 
 		 640 aa  85.5  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.127421  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0108  threonyl-tRNA synthetase  31.44 
 
 		 643 aa  85.1  0.000000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0172  threonyl-tRNA synthetase  29.35 
 
 		 659 aa  85.1  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2973  threonyl-tRNA synthetase  31.22 
 
 		 640 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.617243 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2354  threonyl-tRNA synthetase  31.22 
 
 		 640 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2175  threonyl-tRNA synthetase  27.32 
 
 		 648 aa  84.7  0.000000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1160  threonyl-tRNA synthetase  29.1 
 
 		 635 aa  84.7  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.139321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1010  threonyl-tRNA synthetase  30.53 
 
 		 640 aa  84.7  0.000000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4615  threonyl-tRNA synthetase  28.65 
 
 		 635 aa  84  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00961863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1327  threonyl-tRNA synthetase  32.81 
 
 		 636 aa  84.3  0.000000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0393085  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2668  threonyl-tRNA synthetase  32.48 
 
 		 652 aa  84  0.000000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.107403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2193  threonyl-tRNA synthetase  30.16 
 
 		 639 aa  83.6  0.000000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1320  threonyl-tRNA synthetase  29.21 
 
 		 637 aa  83.2  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.865645  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0487  threonyl-tRNA synthetase  33.96 
 
 		 638 aa  83.2  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.348528  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1025  threonyl-tRNA synthetase  31.32 
 
 		 638 aa  82.4  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.572663  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2770  threonyl-tRNA synthetase  30.16 
 
 		 637 aa  82.4  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1767  threonyl-tRNA synthetase  30.69 
 
 		 640 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.143728  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0043  threonyl-tRNA synthetase  31.63 
 
 		 649 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1399  threonyl-tRNA synthetase  28.65 
 
 		 635 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00532167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2595  threonyl-tRNA synthetase  28.04 
 
 		 635 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0993  threonyl-tRNA synthetase  28.65 
 
 		 635 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.31786  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1475  threonyl-tRNA synthetase  28.65 
 
 		 635 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0274744  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>