More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_2823 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01688  threonyl-tRNA synthetase  48.51 
 
 
642 aa  641    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0363313  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1923  threonyl-tRNA synthetase  48.51 
 
 
642 aa  641    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000181503  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1976  threonyl-tRNA synthetase  46.28 
 
 
640 aa  639    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.30647  normal  0.0664699 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4616  threonyl-tRNA synthetase  49.75 
 
 
643 aa  635    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00213357 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1515  threonyl-tRNA synthetase  52.15 
 
 
636 aa  693    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00436769  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2437  threonyl-tRNA synthetase  48.51 
 
 
642 aa  641    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00126815  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0963  threonyl-tRNA synthetase  49.75 
 
 
635 aa  655    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0747512  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2400  threonyl-tRNA synthetase  49.92 
 
 
639 aa  636    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.459202  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0693  threonyl-tRNA synthetase  51.11 
 
 
638 aa  701    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.287981  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0978  threonyl-tRNA synthetase  49.5 
 
 
633 aa  637    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1577  threonyl-tRNA synthetase  49.16 
 
 
635 aa  639    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.704052  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2419  threonyl-tRNA synthetase  46.97 
 
 
640 aa  640    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2243  threonyl-tRNA synthetase  48.11 
 
 
644 aa  635    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00594301  hitchhiker  0.00373508 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1428  threonyl-tRNA synthetase  48.51 
 
 
642 aa  640    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00369354  hitchhiker  0.00283181 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1760  threonyl-tRNA synthetase  46.06 
 
 
642 aa  635    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000746645  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0427  threonyl-tRNA synthetase  48.43 
 
 
640 aa  647    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0436469  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0189  threonyl-tRNA synthetase  52.39 
 
 
640 aa  667    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114049  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1558  threonyl-tRNA synthetase  50.08 
 
 
635 aa  652    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2378  threonyl-tRNA synthetase  48.26 
 
 
640 aa  649    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.423573  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2222  threonyl-tRNA synthetase  47.77 
 
 
639 aa  648    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0202  threonyl-tRNA synthetase  49.75 
 
 
635 aa  655    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00540019  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2161  threonyl-tRNA synthetase  47.45 
 
 
639 aa  645    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.820955  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1990  threonyl-tRNA synthetase  52.59 
 
 
636 aa  695    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0457996  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2145  threonyl-tRNA synthetase  47.64 
 
 
639 aa  653    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1228  threonyl-tRNA synthetase  55.24 
 
 
635 aa  741    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000338672  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1096  threonyl-tRNA synthetase  49.75 
 
 
635 aa  655    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.869704  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2770  threonyl-tRNA synthetase  50.92 
 
 
637 aa  650    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2643  threonyl-tRNA synthetase  51.08 
 
 
637 aa  652    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2162  threonyl-tRNA synthetase  47.77 
 
 
640 aa  645    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.749908  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1977  threonyl-tRNA synthetase  48.65 
 
 
635 aa  635    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2677  threonyl-tRNA synthetase / Ser-tRNA(Thr) hydrolase  49.33 
 
 
638 aa  644    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.123605 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1010  threonyl-tRNA synthetase  48.6 
 
 
640 aa  638    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1275  threonyl-tRNA synthetase  49.42 
 
 
635 aa  645    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.966183  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1937  threonyl-tRNA synthetase  48.51 
 
 
642 aa  641    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000227542  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1007  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  49.33 
 
 
637 aa  640    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.245371  normal  0.0129716 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0829  threonyl-tRNA synthetase  48.76 
 
 
640 aa  647    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.127421  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2489  threonyl-tRNA synthetase  46.97 
 
 
639 aa  646    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.952507  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1890  threonyl-tRNA synthetase  49.75 
 
 
635 aa  655    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190857  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1140  threonyl-tRNA synthetase  51 
 
 
644 aa  655    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000099925  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1472  threonyl-tRNA synthetase  48.51 
 
 
642 aa  641    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000205456  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2756  threonyl-tRNA synthetase  50.42 
 
 
635 aa  652    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.323332  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1418  threonyl-tRNA synthetase  52.81 
 
 
638 aa  674    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000102997  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4615  threonyl-tRNA synthetase  49.58 
 
 
635 aa  650    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00961863  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1824  threonyl-tRNA synthetase  51.76 
 
 
636 aa  674    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000392835  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2219  threonyl-tRNA synthetase  46.79 
 
 
635 aa  638    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00166056  normal  0.0562711 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1539  threonyl-tRNA synthetase  49.75 
 
 
635 aa  655    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0707  threonyl-tRNA synthetase  51.83 
 
 
644 aa  697    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00542671  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1411  threonyl-tRNA synthetase  53.63 
 
 
645 aa  696    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000074774  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2639  threonyl-tRNA synthetase  52.05 
 
 
644 aa  691    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.3159  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1667  threonyl-tRNA synthetase  48.09 
 
 
642 aa  643    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.301446  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2388  threonyl-tRNA synthetase  47.77 
 
 
639 aa  648    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2628  threonyl-tRNA synthetase  53.99 
 
 
645 aa  711    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000255721  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0187  threonyl-tRNA synthetase  52.39 
 
 
640 aa  666    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00194489  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1779  threonyl-tRNA synthetase  49.75 
 
 
635 aa  656    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420901  normal  0.799245 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0487  threonyl-tRNA synthetase  51.34 
 
 
638 aa  672    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.348528  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3487  threonyl-tRNA synthetase  48.42 
 
 
643 aa  637    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1759  threonyl-tRNA synthetase  50 
 
 
633 aa  686    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000991077  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2595  threonyl-tRNA synthetase  49.58 
 
 
635 aa  652    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1724  threonyl-tRNA synthetase  48.68 
 
 
642 aa  637    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0116827  normal  0.392039 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2136  threonyl-tRNA synthetase  46.02 
 
 
644 aa  644    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000263348  hitchhiker  0.00165189 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2854  threonyl-tRNA synthetase  48.6 
 
 
635 aa  649    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0336987 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1800  threonyl-tRNA synthetase  48.51 
 
 
642 aa  641    Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000021107  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2193  threonyl-tRNA synthetase  46.5 
 
 
639 aa  644    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1444  threonyl-tRNA synthetase  48.35 
 
 
642 aa  639    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0960598  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1336  threonyl-tRNA synthetase  48.92 
 
 
669 aa  651    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1577  threonyl-tRNA synthetase  51.24 
 
 
636 aa  672    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.219126  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3194  threonyl-tRNA synthetase  50.33 
 
 
637 aa  656    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2003  threonyl-tRNA synthetase  52.31 
 
 
635 aa  692    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00562927  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2102  threonyl-tRNA synthetase  49.09 
 
 
635 aa  642    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.692107  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1371  threonyl-tRNA synthetase  50.25 
 
 
635 aa  652    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1452  threonyl-tRNA synthetase  49.42 
 
 
635 aa  647    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0192845  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1399  threonyl-tRNA synthetase  50.08 
 
 
635 aa  649    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00532167  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1799  threonyl-tRNA synthetase / Ser-tRNA(Thr) hydrolase  48.67 
 
 
632 aa  652    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.302616  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1612  threonyl-tRNA synthetase  54.5 
 
 
635 aa  727    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000178172  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1461  threonyl-tRNA synthetase  48.35 
 
 
642 aa  638    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0578341  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1160  threonyl-tRNA synthetase  49.42 
 
 
635 aa  647    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.139321  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2805  threonyl-tRNA synthetase  45.53 
 
 
633 aa  639    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1712  threonyl-tRNA synthetase  49.75 
 
 
635 aa  655    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.713127  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2061  threonyl-tRNA synthetase  51.01 
 
 
641 aa  663    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.399726  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02485  threonyl-tRNA synthetase  48.47 
 
 
638 aa  635    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0163148  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0993  threonyl-tRNA synthetase  49.42 
 
 
635 aa  647    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.31786  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1735  threonyl-tRNA synthetase  49.75 
 
 
635 aa  655    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261137  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2012  threonyl-tRNA synthetase  48.35 
 
 
642 aa  639    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.759384  normal  0.921502 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2504  threonyl-tRNA synthetase  47.77 
 
 
640 aa  643    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1869  threonyl-tRNA synthetase  54.25 
 
 
646 aa  697    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.130621  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1840  threonyl-tRNA synthetase  48.51 
 
 
642 aa  640    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000302796  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2057  threonyl-tRNA synthetase  55.77 
 
 
634 aa  719    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000136416  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1384  threonyl-tRNA synthetase  52.78 
 
 
635 aa  709    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000717334  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0768  threonyl-tRNA synthetase  48.4 
 
 
641 aa  665    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.67512  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2665  threonyl-tRNA synthetase  53.35 
 
 
584 aa  647    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000220787  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1089  threonyl-tRNA synthetase  53.26 
 
 
635 aa  712    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00500732  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1961  threonyl-tRNA synthetase  48.35 
 
 
642 aa  639    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000224309  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1359  threonyl-tRNA synthetase  50.08 
 
 
635 aa  650    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28650  threonyl-tRNA synthetase  47.6 
 
 
640 aa  642    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000737785 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1745  threonyl-tRNA synthetase  51.02 
 
 
637 aa  649    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239329 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1475  threonyl-tRNA synthetase  49.42 
 
 
635 aa  647    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0274744  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0424  threonyl-tRNA synthetase  53.5 
 
 
644 aa  690    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000699319  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0363  threonyl-tRNA synthetase  49.92 
 
 
648 aa  649    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0255987  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1913  threonyl-tRNA synthetase  48.51 
 
 
642 aa  641    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.121147  normal  0.299034 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2823  threonyl-tRNA synthetase  100 
 
 
643 aa  1329    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000177582  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>