More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_2175 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_1774  threonyl-tRNA synthetase  57.08 
 
 
645 aa  768    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2175  threonyl-tRNA synthetase  100 
 
 
648 aa  1334    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1246  threonyl-tRNA synthetase  58.48 
 
 
645 aa  771    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.1161  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2419  threonyl-tRNA synthetase  48.68 
 
 
640 aa  636    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4707  threonyl-tRNA synthetase  61.86 
 
 
645 aa  818    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000334194  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0711  threonyl-tRNA synthetase  58.39 
 
 
647 aa  775    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1450  threonyl-tRNA synthetase  51.02 
 
 
643 aa  676    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2222  threonyl-tRNA synthetase  48.13 
 
 
639 aa  637    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4472  threonyl-tRNA synthetase  61.86 
 
 
645 aa  819    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.419718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4307  threonyl-tRNA synthetase  61.86 
 
 
645 aa  819    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00228432  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4318  threonyl-tRNA synthetase  61.86 
 
 
645 aa  819    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0311311  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1906  threonyl-tRNA synthetase  47.26 
 
 
641 aa  637    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05580  Threonyl-tRNA synthetase  50.85 
 
 
646 aa  684    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000588041  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4685  threonyl-tRNA synthetase  61.86 
 
 
645 aa  818    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00204863  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1740  threonyl-tRNA synthetase  57.08 
 
 
645 aa  768    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0523763  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2661  threonyl-tRNA synthetase  62.83 
 
 
644 aa  847    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000386283  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4691  threonyl-tRNA synthetase  61.86 
 
 
645 aa  819    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.88699e-59 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0121  threonyl-tRNA synthetase  54.87 
 
 
596 aa  670    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0552  threonyl-tRNA synthetase  62.02 
 
 
645 aa  820    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000171694  unclonable  1.90469e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2388  threonyl-tRNA synthetase  48.13 
 
 
639 aa  637    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4820  threonyl-tRNA synthetase  61.86 
 
 
645 aa  819    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00851939  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0912  threonyl-tRNA synthetase  48.98 
 
 
638 aa  658    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4701  threonyl-tRNA synthetase  61.71 
 
 
645 aa  818    Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000566692  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2401  threonyl-tRNA synthetase  48.51 
 
 
634 aa  635    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.162517  normal  0.284009 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1612  threonyl-tRNA synthetase  49.22 
 
 
635 aa  643    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000178172  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0801  threonyl-tRNA synthetase  49.77 
 
 
647 aa  672    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00121365  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0797  threonyl-tRNA synthetase  62.73 
 
 
652 aa  838    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0623  threonyl-tRNA synthetase  52.61 
 
 
662 aa  702    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1300  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  50 
 
 
639 aa  639    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1228  threonyl-tRNA synthetase  49.45 
 
 
635 aa  638    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000338672  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3262  threonyl-tRNA synthetase  61.9 
 
 
643 aa  822    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00002753  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1089  threonyl-tRNA synthetase  50.55 
 
 
635 aa  648    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00500732  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0185  threonyl-tRNA synthetase  48.76 
 
 
639 aa  638    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000179764  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2181  threonyl-tRNA synthetase  52.19 
 
 
646 aa  713    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0460  threonyl-tRNA synthetase / Ser-tRNA(Thr) hydrolase  50 
 
 
663 aa  668    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0696284  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1415  threonyl-tRNA synthetase  52.19 
 
 
643 aa  673    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000260393 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0662  threonyl-tRNA synthetase  52.15 
 
 
652 aa  697    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0613  threonyl-tRNA synthetase  57.36 
 
 
648 aa  769    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4407  threonyl-tRNA synthetase  61.71 
 
 
645 aa  816    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00383919  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1373  threonyl-tRNA synthetase  48.76 
 
 
645 aa  654    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000340223  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2145  threonyl-tRNA synthetase  47.98 
 
 
639 aa  632  1e-180  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1140  threonyl-tRNA synthetase  48.35 
 
 
644 aa  633  1e-180  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000099925  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2219  threonyl-tRNA synthetase  46.65 
 
 
647 aa  634  1e-180  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0771332 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1221  threonyl-tRNA synthetase  47.73 
 
 
647 aa  630  1e-179  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.001104  hitchhiker  0.00620187 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2405  threonyl-tRNA synthetase  47.66 
 
 
639 aa  631  1e-179  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2161  threonyl-tRNA synthetase  47.66 
 
 
639 aa  631  1e-179  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.820955  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2614  threonyl-tRNA synthetase  47.66 
 
 
644 aa  630  1e-179  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2354  threonyl-tRNA synthetase  47.66 
 
 
640 aa  630  1e-179  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0982  threonyl-tRNA synthetase  49.23 
 
 
652 aa  631  1e-179  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0768948  normal  0.105086 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2489  threonyl-tRNA synthetase  47.66 
 
 
639 aa  630  1e-179  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.952507  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1759  threonyl-tRNA synthetase  50.08 
 
 
633 aa  631  1e-179  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000991077  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2243  threonyl-tRNA synthetase  47.66 
 
 
644 aa  630  1e-179  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00594301  hitchhiker  0.00373508 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3742  threonyl-tRNA synthetase  46.79 
 
 
646 aa  627  1e-178  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.190527  hitchhiker  0.00137888 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2973  threonyl-tRNA synthetase  47.66 
 
 
640 aa  626  1e-178  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.617243 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2057  threonyl-tRNA synthetase  48.28 
 
 
634 aa  625  1e-178  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000136416  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1192  threonyl-tRNA synthetase  49.85 
 
 
652 aa  625  1e-178  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0559  threonyl-tRNA synthetase  46.57 
 
 
644 aa  625  1e-178  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00454252 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0363  threonyl-tRNA synthetase  46.49 
 
 
648 aa  623  1e-177  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0255987  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1669  threonyl-tRNA synthetase  48.9 
 
 
637 aa  619  1e-176  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000137846  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1384  threonyl-tRNA synthetase  48.67 
 
 
635 aa  620  1e-176  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000717334  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1643  threonyl-tRNA synthetase  45.33 
 
 
645 aa  616  1e-175  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.193799  normal  0.0776011 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2631  threonyl-tRNA synthetase  48.29 
 
 
643 aa  615  1e-175  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2317  threonyl-tRNA synthetase  48.29 
 
 
643 aa  616  1e-175  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2628  threonyl-tRNA synthetase  47.42 
 
 
645 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000255721  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1411  threonyl-tRNA synthetase  46.64 
 
 
645 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000074774  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2193  threonyl-tRNA synthetase  46.42 
 
 
639 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1767  threonyl-tRNA synthetase  46.42 
 
 
640 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.143728  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1515  threonyl-tRNA synthetase  46.64 
 
 
636 aa  611  1e-173  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00436769  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0123  threonyl-tRNA synthetase  45.6 
 
 
677 aa  611  1e-173  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0729429  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0992  threonyl-tRNA synthetase  47.89 
 
 
653 aa  607  9.999999999999999e-173  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2230  threonyl-tRNA synthetase  46.95 
 
 
636 aa  608  9.999999999999999e-173  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00712554 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0172  threonyl-tRNA synthetase  44.99 
 
 
659 aa  607  9.999999999999999e-173  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0176  threonyl-tRNA synthetase  45.29 
 
 
657 aa  607  9.999999999999999e-173  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1990  threonyl-tRNA synthetase  46.79 
 
 
636 aa  606  9.999999999999999e-173  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0457996  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2501  threonyl-tRNA synthetase  44.77 
 
 
675 aa  606  9.999999999999999e-173  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0189  threonyl-tRNA synthetase  46.62 
 
 
640 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114049  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1372  threonyl-tRNA synthetase  46.49 
 
 
635 aa  605  1.0000000000000001e-171  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000383369  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0156  threonyl-tRNA synthetase  44.51 
 
 
657 aa  604  1.0000000000000001e-171  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1977  threonyl-tRNA synthetase  45.62 
 
 
635 aa  598  1e-170  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1715  threonyl-tRNA synthetase  45.05 
 
 
657 aa  601  1e-170  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1647  threonyl-tRNA synthetase  45.94 
 
 
635 aa  600  1e-170  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0710025 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0187  threonyl-tRNA synthetase  46.31 
 
 
640 aa  598  1e-170  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00194489  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2308  threonyl-tRNA synthetase  46.79 
 
 
636 aa  600  1e-170  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304156  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2677  threonyl-tRNA synthetase / Ser-tRNA(Thr) hydrolase  46.06 
 
 
638 aa  598  1e-169  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.123605 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4204  threonyl-tRNA synthetase  44.03 
 
 
736 aa  598  1e-169  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2003  threonyl-tRNA synthetase  44.98 
 
 
635 aa  598  1e-169  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00562927  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1863  threonyl-tRNA synthetase / Ser-tRNA(Thr) hydrolase  52.6 
 
 
601 aa  598  1e-169  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4736  threonyl-tRNA synthetase  45.57 
 
 
659 aa  598  1e-169  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.556159 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00815  threonyl-tRNA synthetase  45.13 
 
 
648 aa  595  1e-168  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.270847  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0167  threonyl-tRNA synthetase  43.86 
 
 
657 aa  593  1e-168  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0768  threonyl-tRNA synthetase  45.05 
 
 
641 aa  592  1e-168  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.67512  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1824  threonyl-tRNA synthetase  46.66 
 
 
636 aa  593  1e-168  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000392835  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1779  threonyl-tRNA synthetase  45.6 
 
 
635 aa  593  1e-168  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420901  normal  0.799245 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1539  threonyl-tRNA synthetase  45.53 
 
 
635 aa  588  1e-167  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1735  threonyl-tRNA synthetase  45.53 
 
 
635 aa  588  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261137  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1096  threonyl-tRNA synthetase  45.53 
 
 
635 aa  588  1e-167  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.869704  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0963  threonyl-tRNA synthetase  45.53 
 
 
635 aa  588  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0747512  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1890  threonyl-tRNA synthetase  45.53 
 
 
635 aa  588  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190857  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1667  threonyl-tRNA synthetase  42.79 
 
 
642 aa  591  1e-167  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.301446  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1712  threonyl-tRNA synthetase  45.53 
 
 
635 aa  588  1e-167  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.713127  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>