276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1745 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1745  phosphoribulokinase family protein  100 
 
 		 529 aa  1090    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0332  phosphoribulokinase/uridine kinase  46.32 
 
 		 557 aa  477  1e-133  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1435  AAA ATPase  45.12 
 
 		 552 aa  462  1e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10770  uridine kinase  43.27 
 
 		 549 aa  452  1.0000000000000001e-126  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0041  phosphoribulokinase/uridine kinase  44.34 
 
 		 554 aa  436  1e-121  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.448598  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3519  phosphoribulokinase/uridine kinase  41.52 
 
 		 553 aa  432  1e-119  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0134  phosphoribulokinase/uridine kinase  41.15 
 
 		 558 aa  429  1e-119  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1290  phosphoribulokinase/uridine kinase  42.5 
 
 		 547 aa  426  1e-118  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.297478  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3162  phosphoribulokinase/uridine kinase  41.96 
 
 		 552 aa  422  1e-117  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1101  uridine kinase  42.55 
 
 		 557 aa  423  1e-117  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0178  phosphoribulokinase/uridine kinase  41.79 
 
 		 555 aa  421  1e-116  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.871097  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0176  phosphoribulokinase/uridine kinase  41.79 
 
 		 555 aa  421  1e-116  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0833476  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2238  phosphoribulokinase/uridine kinase  42.34 
 
 		 567 aa  409  1e-113  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.958517  normal  0.150287 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0531  AAA ATPase  43 
 
 		 554 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.777332  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1554  putative threonyl-tRNA synthetase/uridine kinase  42.63 
 
 		 551 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.614355  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1347  phosphoribulokinase / uridine kinase family protein  42.63 
 
 		 551 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1361  AAA ATPase  42.02 
 
 		 547 aa  395  1e-109  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.762498  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1435  phosphoribulokinase/uridine kinase  38.76 
 
 		 553 aa  390  1e-107  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1763  phosphoribulokinase/uridine kinase  41.57 
 
 		 559 aa  390  1e-107  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.295373  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0031  phosphoribulokinase/uridine kinase  40.86 
 
 		 555 aa  377  1e-103  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3054  phosphoribulokinase/uridine kinase  40.74 
 
 		 462 aa  365  1e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2289  phosphoribulokinase/uridine kinase family protein  38.25 
 
 		 550 aa  356  6.999999999999999e-97  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0142692  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3852  cyclic nucleotide-binding protein  37.6 
 
 		 713 aa  300  3e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.108661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3723  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  36.07 
 
 		 714 aa  283  4.0000000000000003e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3863  cyclic nucleotide-binding protein  36.65 
 
 		 715 aa  283  7.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0623706  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3780  cyclic nucleotide-binding protein  35.52 
 
 		 715 aa  276  6e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12201  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1759  threonyl-tRNA synthetase  31.41 
 
 		 633 aa  80.5  0.00000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000991077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81319  uridine kinase  27.62 
 
 		 504 aa  75.1  0.000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0146953  normal  0.484619 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0339  uridine kinase  26.53 
 
 		 207 aa  72  0.00000000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1330  uridine kinase  29.8 
 
 		 212 aa  68.2  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.60785 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1281  uridine kinase  26.24 
 
 		 209 aa  67.8  0.0000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2175  threonyl-tRNA synthetase  26.67 
 
 		 648 aa  66.6  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0011  uridine kinase  29.65 
 
 		 202 aa  66.2  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1669  threonyl-tRNA synthetase  29.7 
 
 		 637 aa  65.9  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000137846  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1612  threonyl-tRNA synthetase  28.65 
 
 		 635 aa  65.1  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000178172  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl306  uridine kinase  28.57 
 
 		 208 aa  64.7  0.000000004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000466982  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2401  threonyl-tRNA synthetase  25.13 
 
 		 634 aa  64.7  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.162517  normal  0.284009 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2003  threonyl-tRNA synthetase  25 
 
 		 635 aa  64.3  0.000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00562927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2243  threonyl-tRNA synthetase  25.47 
 
 		 644 aa  63.9  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00594301  hitchhiker  0.00373508 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3487  threonyl-tRNA synthetase  24.28 
 
 		 643 aa  63.9  0.000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2614  threonyl-tRNA synthetase  25.47 
 
 		 644 aa  63.9  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1558  threonyl-tRNA synthetase  28.77 
 
 		 635 aa  63.5  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4615  threonyl-tRNA synthetase  28.47 
 
 		 635 aa  63.5  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00961863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05580  Threonyl-tRNA synthetase  25.3 
 
 		 646 aa  63.2  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000588041  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0185  threonyl-tRNA synthetase  25.77 
 
 		 639 aa  62.8  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000179764  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1422  uridine kinase  24.76 
 
 		 236 aa  61.6  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1452  threonyl-tRNA synthetase  28.47 
 
 		 635 aa  62  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0192845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1869  threonyl-tRNA synthetase  25.95 
 
 		 646 aa  61.6  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.130621  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0993  threonyl-tRNA synthetase  28.47 
 
 		 635 aa  62  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.31786  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1475  threonyl-tRNA synthetase  28.47 
 
 		 635 aa  62  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0274744  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2386  uridine kinase  24.88 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000694748  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0608  threonyl-tRNA synthetase  25.88 
 
 		 634 aa  60.8  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.769524  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1779  threonyl-tRNA synthetase  28.47 
 
 		 635 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420901  normal  0.799245 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2393  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  27.22 
 
 		 644 aa  60.8  0.00000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.975747 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0422  uridine kinase  30.77 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000007  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.174111  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1515  threonyl-tRNA synthetase  27.4 
 
 		 636 aa  60.1  0.00000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00436769  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0202  uridine kinase  26.32 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2061  threonyl-tRNA synthetase  25.95 
 
 		 641 aa  60.1  0.00000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.399726  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1399  threonyl-tRNA synthetase  27.01 
 
 		 635 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00532167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1411  threonyl-tRNA synthetase  24.57 
 
 		 645 aa  59.7  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000074774  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1359  threonyl-tRNA synthetase  27.01 
 
 		 635 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1384  threonyl-tRNA synthetase  27.74 
 
 		 635 aa  58.9  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000717334  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2230  threonyl-tRNA synthetase  25.17 
 
 		 636 aa  59.3  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00712554 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1668  uridine kinase  27.71 
 
 		 207 aa  58.9  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1702  uridine kinase  27.71 
 
 		 207 aa  58.9  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.69825  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0623  threonyl-tRNA synthetase  24.12 
 
 		 662 aa  58.9  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4546  phosphoribulokinase/uridine kinase  25.48 
 
 		 217 aa  58.9  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.896481 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2368  threonyl-tRNA synthetase  23.39 
 
 		 644 aa  58.5  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.642893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2364  uridine kinase  26.87 
 
 		 219 aa  58.5  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2756  threonyl-tRNA synthetase  27.01 
 
 		 635 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.323332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1371  threonyl-tRNA synthetase  27.01 
 
 		 635 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4736  threonyl-tRNA synthetase  27.45 
 
 		 659 aa  58.2  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.556159 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2595  threonyl-tRNA synthetase  27.74 
 
 		 635 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1418  threonyl-tRNA synthetase  25.61 
 
 		 638 aa  57.8  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000102997  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1990  threonyl-tRNA synthetase  26.83 
 
 		 636 aa  57.4  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0457996  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0043  threonyl-tRNA synthetase  26.15 
 
 		 649 aa  57.4  0.0000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0912  threonyl-tRNA synthetase  24.84 
 
 		 638 aa  57.4  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0392  threonyl-tRNA synthetase  21.97 
 
 		 633 aa  57  0.0000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1025  threonyl-tRNA synthetase  25.73 
 
 		 638 aa  57  0.0000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.572663  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0693  threonyl-tRNA synthetase  26.14 
 
 		 638 aa  57  0.0000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.287981  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5127  phosphoribulokinase/uridine kinase  23.41 
 
 		 205 aa  57  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.426663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1385  uridine kinase  26.26 
 
 		 209 aa  56.6  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1373  threonyl-tRNA synthetase  28.24 
 
 		 645 aa  56.6  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000340223  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1493  uridine kinase  28.95 
 
 		 196 aa  56.6  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.54247 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1577  threonyl-tRNA synthetase  24.68 
 
 		 636 aa  56.6  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.219126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1089  threonyl-tRNA synthetase  26.89 
 
 		 635 aa  56.6  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00500732  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0044  uridine kinase  26.04 
 
 		 211 aa  56.6  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2997  threonyl-tRNA synthetase  25.6 
 
 		 644 aa  55.5  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1448  threonyl-tRNA synthetase  24.03 
 
 		 639 aa  55.8  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2400  threonyl-tRNA synthetase  24.03 
 
 		 639 aa  55.8  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.459202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2154  threonyl-tRNA synthetase  24.42 
 
 		 661 aa  55.1  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1890  threonyl-tRNA synthetase  27.01 
 
 		 635 aa  55.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190857  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1712  threonyl-tRNA synthetase  27.01 
 
 		 635 aa  55.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.713127  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0963  threonyl-tRNA synthetase  27.01 
 
 		 635 aa  55.5  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0747512  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1896  threonyl-tRNA synthetase  26.61 
 
 		 650 aa  55.1  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2854  threonyl-tRNA synthetase  23.78 
 
 		 635 aa  55.1  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0336987 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1981  threonyl-tRNA synthetase  26.61 
 
 		 650 aa  55.1  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.387429  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1539  threonyl-tRNA synthetase  27.01 
 
 		 635 aa  55.5  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0566  threonyl-tRNA synthetase  28.03 
 
 		 583 aa  55.1  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0202  threonyl-tRNA synthetase  27.01 
 
 		 635 aa  55.5  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00540019  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>