164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1493 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1493  uridine kinase  100 
 
 		 196 aa  390  1e-108  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.54247 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1007  phosphoribulokinase/uridine kinase family protein  50.26 
 
 		 219 aa  144  1e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.931754  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1361  AAA ATPase  31.7 
 
 		 547 aa  77.8  0.00000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.762498  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl306  uridine kinase  27.98 
 
 		 208 aa  74.7  0.0000000000009  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000466982  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0422  uridine kinase  28.85 
 
 		 207 aa  73.2  0.000000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.174111  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0339  uridine kinase  30 
 
 		 207 aa  73.6  0.000000000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0178  phosphoribulokinase/uridine kinase  28.57 
 
 		 555 aa  73.6  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.871097  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0176  phosphoribulokinase/uridine kinase  28.57 
 
 		 555 aa  73.6  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0833476  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3519  phosphoribulokinase/uridine kinase  30.65 
 
 		 553 aa  72  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1330  uridine kinase  29.28 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.60785 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0134  phosphoribulokinase/uridine kinase  29.35 
 
 		 558 aa  68.9  0.00000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3162  phosphoribulokinase/uridine kinase  28.38 
 
 		 552 aa  68.6  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3054  uridine kinase  28.96 
 
 		 201 aa  67  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.654412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0041  phosphoribulokinase/uridine kinase  30.5 
 
 		 554 aa  67  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.448598  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1435  AAA ATPase  27.6 
 
 		 552 aa  65.5  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1385  uridine kinase  31.75 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0531  AAA ATPase  26 
 
 		 554 aa  63.5  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.777332  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2289  phosphoribulokinase/uridine kinase family protein  27.14 
 
 		 550 aa  63.2  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0142692  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0031  phosphoribulokinase/uridine kinase  27.5 
 
 		 555 aa  62.8  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2386  uridine kinase  26.47 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000694748  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1290  phosphoribulokinase/uridine kinase  25.93 
 
 		 547 aa  62.4  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.297478  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1347  phosphoribulokinase / uridine kinase family protein  26.11 
 
 		 551 aa  61.6  0.000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1554  putative threonyl-tRNA synthetase/uridine kinase  25.12 
 
 		 551 aa  61.2  0.000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.614355  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0537  uridine kinase  29.55 
 
 		 242 aa  60.5  0.00000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0563702  hitchhiker  0.00000000000000916272 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1820  uridine kinase  28.04 
 
 		 232 aa  60.1  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1819  uridine kinase  28.04 
 
 		 232 aa  60.5  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1763  phosphoribulokinase/uridine kinase  28.08 
 
 		 559 aa  60.1  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.295373  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1435  phosphoribulokinase/uridine kinase  25.24 
 
 		 553 aa  60.1  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10770  uridine kinase  26.43 
 
 		 549 aa  59.3  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1974  uridine kinase  29.73 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.308367  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1668  uridine kinase  26.63 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1702  uridine kinase  26.63 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.69825  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0044  uridine kinase  29.85 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1745  phosphoribulokinase family protein  28.95 
 
 		 529 aa  56.6  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3563  uridine kinase  27.87 
 
 		 213 aa  57  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.933791  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1101  uridine kinase  27.68 
 
 		 557 aa  57  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2482  uridine kinase  25.13 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0935  uridine kinase  27.13 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1079  uridine kinase  27.13 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.210616  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1175  uridine kinase  26.04 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0202  uridine kinase  29.03 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2364  uridine kinase  26.34 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1033  uridine kinase  28.16 
 
 		 210 aa  53.9  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.12732  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00730  uridine kinase  28.19 
 
 		 207 aa  53.9  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0558456  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2238  phosphoribulokinase/uridine kinase  27.4 
 
 		 567 aa  54.3  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.958517  normal  0.150287 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3054  phosphoribulokinase/uridine kinase  27.32 
 
 		 462 aa  53.9  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_47740  predicted protein  30 
 
 		 434 aa  53.5  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0678521  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1781  uridine kinase  24.87 
 
 		 209 aa  53.1  0.000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0533  uridine kinase  26.84 
 
 		 207 aa  53.1  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1197  uridine kinase  27.89 
 
 		 213 aa  52.8  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2453  uridine kinase  27.17 
 
 		 213 aa  53.1  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3195  uridine kinase  27.17 
 
 		 213 aa  53.1  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0472319  hitchhiker  0.00149984 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2552  uridine kinase  27.17 
 
 		 213 aa  53.1  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0332  phosphoribulokinase/uridine kinase  41.94 
 
 		 557 aa  52.4  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2228  uridine kinase  26.74 
 
 		 215 aa  52.4  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2005  uridine kinase  26.28 
 
 		 204 aa  52.8  0.000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.679011  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2305  uridine kinase  27.03 
 
 		 213 aa  52  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2871  uridine kinase  29.38 
 
 		 213 aa  51.6  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12970  uridine kinase  24.73 
 
 		 204 aa  51.6  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000147377  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1215  uridine kinase  28.57 
 
 		 218 aa  51.2  0.000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000175656  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0015  uridine kinase  29.65 
 
 		 206 aa  50.8  0.00001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0011  uridine kinase  25.13 
 
 		 202 aa  50.4  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1281  uridine kinase  23.08 
 
 		 209 aa  50.4  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1576  uridine kinase  26.63 
 
 		 213 aa  50.8  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.435743 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0823  uridine kinase  23.86 
 
 		 219 aa  50.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81319  uridine kinase  22.28 
 
 		 504 aa  50.4  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0146953  normal  0.484619 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2463  uridine kinase  26.49 
 
 		 213 aa  49.7  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.92076  normal  0.601786 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5127  phosphoribulokinase/uridine kinase  25.13 
 
 		 205 aa  49.3  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.426663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3723  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.58 
 
 		 714 aa  49.3  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2244  uridine kinase  27.08 
 
 		 212 aa  49.3  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2249  uridine kinase  26.49 
 
 		 213 aa  49.7  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0556  uridine kinase  26.2 
 
 		 219 aa  49.7  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0365333  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02924  uridine kinase  26.74 
 
 		 213 aa  49.7  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2349  uridine kinase  26.49 
 
 		 213 aa  49.7  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2356  uridine kinase  26.49 
 
 		 213 aa  49.7  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0747859  normal  0.616244 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07150  uridine kinase  23.28 
 
 		 202 aa  49.3  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2047  uridine kinase  28.65 
 
 		 212 aa  48.9  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.20095  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002983  uridine kinase (C1)  28.34 
 
 		 213 aa  48.5  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.163408  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1422  uridine kinase  27.65 
 
 		 236 aa  48.5  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2680  uridine kinase  26.53 
 
 		 213 aa  48.1  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.381484 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02150  uridine kinase, putative  25.51 
 
 		 582 aa  48.1  0.00008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3852  cyclic nucleotide-binding protein  30.08 
 
 		 713 aa  48.1  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.108661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0453  uridine kinase  21.33 
 
 		 201 aa  48.1  0.00008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00211906  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10398  predicted protein  26.16 
 
 		 209 aa  48.1  0.00008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.296577  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3042  uridine kinase  26.09 
 
 		 213 aa  47.4  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0315  uridine kinase  25.7 
 
 		 214 aa  47.8  0.0001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3961  phosphoribulokinase/uridine kinase  27.4 
 
 		 203 aa  47.8  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.926817 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1289  uridine kinase  26.09 
 
 		 213 aa  47.4  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.731499  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1591  uridine kinase  26.49 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00393606  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3863  cyclic nucleotide-binding protein  31.62 
 
 		 715 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0623706  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3003  uridine kinase  26.49 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.384394 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0970  uridine kinase  26.2 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4429  phosphoribulokinase  28.04 
 
 		 313 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000782103  normal  0.086912 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1575  uridine kinase  26.84 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01961  hypothetical protein  26.49 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2206  uridine kinase  26.49 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2359  uridine kinase  26.49 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1575  uridine kinase  26.49 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0267753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0994  uridine kinase  26.49 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1166  uridine kinase  26.49 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>