263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0176 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0176  phosphoribulokinase/uridine kinase  100 
 
 		 555 aa  1123    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0833476  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0178  phosphoribulokinase/uridine kinase  99.82 
 
 		 555 aa  1122    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.871097  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0134  phosphoribulokinase/uridine kinase  57.66 
 
 		 558 aa  630  1e-179  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1763  phosphoribulokinase/uridine kinase  58.86 
 
 		 559 aa  618  1e-175  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.295373  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1435  phosphoribulokinase/uridine kinase  52.65 
 
 		 553 aa  581  1e-164  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0332  phosphoribulokinase/uridine kinase  53.93 
 
 		 557 aa  546  1e-154  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1290  phosphoribulokinase/uridine kinase  52.23 
 
 		 547 aa  531  1e-149  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.297478  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10770  uridine kinase  50.63 
 
 		 549 aa  508  1e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3519  phosphoribulokinase/uridine kinase  47.2 
 
 		 553 aa  499  1e-140  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1435  AAA ATPase  46.95 
 
 		 552 aa  498  1e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0531  AAA ATPase  47.87 
 
 		 554 aa  489  1e-137  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.777332  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1361  AAA ATPase  45.87 
 
 		 547 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.762498  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1101  uridine kinase  46.67 
 
 		 557 aa  463  1e-129  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0041  phosphoribulokinase/uridine kinase  47.6 
 
 		 554 aa  464  1e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.448598  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3162  phosphoribulokinase/uridine kinase  46.7 
 
 		 552 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1745  phosphoribulokinase family protein  41.79 
 
 		 529 aa  421  1e-116  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2238  phosphoribulokinase/uridine kinase  45.35 
 
 		 567 aa  417  9.999999999999999e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.958517  normal  0.150287 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0031  phosphoribulokinase/uridine kinase  44.91 
 
 		 555 aa  416  9.999999999999999e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1347  phosphoribulokinase / uridine kinase family protein  44.02 
 
 		 551 aa  413  1e-114  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1554  putative threonyl-tRNA synthetase/uridine kinase  43.84 
 
 		 551 aa  412  1e-113  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.614355  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2289  phosphoribulokinase/uridine kinase family protein  41.68 
 
 		 550 aa  378  1e-103  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0142692  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3054  phosphoribulokinase/uridine kinase  43.42 
 
 		 462 aa  362  1e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3852  cyclic nucleotide-binding protein  38.38 
 
 		 713 aa  311  2e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.108661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3863  cyclic nucleotide-binding protein  35.87 
 
 		 715 aa  300  4e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0623706  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3780  cyclic nucleotide-binding protein  36.24 
 
 		 715 aa  297  3e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12201  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3723  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  39.22 
 
 		 714 aa  295  2e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl306  uridine kinase  30.35 
 
 		 208 aa  76.3  0.000000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000466982  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1330  uridine kinase  29.44 
 
 		 212 aa  74.7  0.000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.60785 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1418  threonyl-tRNA synthetase  29.84 
 
 		 638 aa  74.3  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000102997  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81319  uridine kinase  26.32 
 
 		 504 aa  73.6  0.000000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0146953  normal  0.484619 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1385  uridine kinase  31.31 
 
 		 209 aa  73.2  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1493  uridine kinase  28.57 
 
 		 196 aa  73.6  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.54247 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4546  phosphoribulokinase/uridine kinase  30.66 
 
 		 217 aa  72  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.896481 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2364  uridine kinase  27.45 
 
 		 219 aa  71.6  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1300  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  27.46 
 
 		 639 aa  71.2  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2871  uridine kinase  29.41 
 
 		 213 aa  68.2  0.0000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0339  uridine kinase  26.44 
 
 		 207 aa  66.2  0.000000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2349  uridine kinase  29.8 
 
 		 213 aa  65.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2463  uridine kinase  29.8 
 
 		 213 aa  65.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.92076  normal  0.601786 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2356  uridine kinase  29.8 
 
 		 213 aa  65.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0747859  normal  0.616244 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1422  uridine kinase  26.34 
 
 		 236 aa  65.9  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1281  uridine kinase  26.26 
 
 		 209 aa  65.5  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2249  uridine kinase  29.8 
 
 		 213 aa  65.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0427  threonyl-tRNA synthetase  23.93 
 
 		 640 aa  65.1  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0436469  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3195  uridine kinase  30.3 
 
 		 213 aa  64.7  0.000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0472319  hitchhiker  0.00149984 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1197  uridine kinase  28.92 
 
 		 213 aa  64.7  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2453  uridine kinase  30.3 
 
 		 213 aa  64.7  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2552  uridine kinase  30.3 
 
 		 213 aa  64.7  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2305  uridine kinase  29.8 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5127  phosphoribulokinase/uridine kinase  26.53 
 
 		 205 aa  64.3  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.426663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0044  uridine kinase  30.54 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0202  uridine kinase  25.94 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3042  uridine kinase  27.78 
 
 		 213 aa  62.8  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0453  uridine kinase  27.59 
 
 		 201 aa  63.2  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00211906  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2386  uridine kinase  26.4 
 
 		 209 aa  63.2  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000694748  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01972  uridine kinase  29.8 
 
 		 213 aa  62.4  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1591  uridine kinase  29.8 
 
 		 213 aa  62.4  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00393606  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2206  uridine kinase  29.8 
 
 		 213 aa  62.4  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1289  uridine kinase  27.78 
 
 		 213 aa  62.8  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.731499  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1575  uridine kinase  29.8 
 
 		 213 aa  62.4  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0267753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0994  uridine kinase  29.8 
 
 		 213 aa  62.4  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4839  Phosphoribulokinase  31.4 
 
 		 333 aa  62.4  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000156566  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3003  uridine kinase  29.8 
 
 		 213 aa  62.4  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.384394 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4240  phosphoribulokinase  29.61 
 
 		 334 aa  62.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000329747  hitchhiker  0.0000174575 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01961  hypothetical protein  29.8 
 
 		 213 aa  62.4  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1166  uridine kinase  29.8 
 
 		 213 aa  62.4  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1576  uridine kinase  29.29 
 
 		 213 aa  62.8  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.435743 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2359  uridine kinase  29.8 
 
 		 213 aa  62.4  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0977  phosphoribulokinase  29.77 
 
 		 333 aa  61.2  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.000000000000194465  normal  0.0613033 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2617  uridine kinase  28.79 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1657  uridine kinase  28.79 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0722731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1732  uridine kinase  28.79 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000414727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1365  uridine kinase  29.53 
 
 		 204 aa  61.2  0.00000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.759935  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1762  uridine kinase  28.79 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0067733  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1175  uridine kinase  28.49 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1979  uridine kinase  28.57 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000633687  hitchhiker  0.00165825 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2823  threonyl-tRNA synthetase  23.81 
 
 		 643 aa  59.7  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000177582  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1384  threonyl-tRNA synthetase  27.55 
 
 		 635 aa  59.7  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000717334  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1740  uridine kinase  31.36 
 
 		 208 aa  60.1  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.627897  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3980  phosphoribulokinase  31.53 
 
 		 332 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000234967  decreased coverage  0.00010781 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3931  phosphoribulokinase  31.53 
 
 		 332 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0823  uridine kinase  25.85 
 
 		 219 aa  59.7  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05580  Threonyl-tRNA synthetase  24.69 
 
 		 646 aa  59.3  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000588041  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00730  uridine kinase  28.36 
 
 		 207 aa  58.9  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0558456  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1669  threonyl-tRNA synthetase  24.61 
 
 		 637 aa  59.3  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000137846  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0011  uridine kinase  29 
 
 		 202 aa  58.9  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0533  uridine kinase  28.36 
 
 		 207 aa  58.9  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2023  uridine kinase  29.76 
 
 		 208 aa  58.9  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1888  uridine kinase  28.28 
 
 		 212 aa  59.3  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000127737  normal  0.0259304 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2456  uridine kinase  28.28 
 
 		 212 aa  59.3  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000511378  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2576  uridine kinase  28.28 
 
 		 212 aa  59.3  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0976754  normal  0.0423229 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2175  threonyl-tRNA synthetase  24.39 
 
 		 648 aa  58.5  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5200  phosphoribulokinase  30.2 
 
 		 334 aa  58.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  1.4377100000000002e-24 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2463  uridine kinase  28.28 
 
 		 212 aa  58.5  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000426115  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2368  threonyl-tRNA synthetase  26.6 
 
 		 644 aa  58.2  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.642893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2680  uridine kinase  27.94 
 
 		 213 aa  58.2  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.381484 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02924  uridine kinase  26.63 
 
 		 213 aa  58.2  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0768  threonyl-tRNA synthetase  23.89 
 
 		 641 aa  57.8  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.67512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0623  threonyl-tRNA synthetase  26.06 
 
 		 662 aa  57  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1332  phosphoribulokinase/uridine kinase  28 
 
 		 321 aa  57  0.0000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>