More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2238 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2238  phosphoribulokinase/uridine kinase  100 
 
 		 567 aa  1150    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.958517  normal  0.150287 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0332  phosphoribulokinase/uridine kinase  43.07 
 
 		 557 aa  461  9.999999999999999e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1101  uridine kinase  45.83 
 
 		 557 aa  452  1.0000000000000001e-126  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1435  AAA ATPase  41.97 
 
 		 552 aa  449  1e-125  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0134  phosphoribulokinase/uridine kinase  44.53 
 
 		 558 aa  435  1e-120  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10770  uridine kinase  42.11 
 
 		 549 aa  432  1e-120  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3519  phosphoribulokinase/uridine kinase  41.81 
 
 		 553 aa  430  1e-119  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1763  phosphoribulokinase/uridine kinase  41.85 
 
 		 559 aa  426  1e-118  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.295373  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1290  phosphoribulokinase/uridine kinase  43.8 
 
 		 547 aa  423  1e-117  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.297478  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0531  AAA ATPase  41.12 
 
 		 554 aa  422  1e-117  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.777332  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0041  phosphoribulokinase/uridine kinase  42.08 
 
 		 554 aa  420  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.448598  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0176  phosphoribulokinase/uridine kinase  45.35 
 
 		 555 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0833476  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0178  phosphoribulokinase/uridine kinase  45.35 
 
 		 555 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.871097  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1745  phosphoribulokinase family protein  42.34 
 
 		 529 aa  409  1e-113  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1435  phosphoribulokinase/uridine kinase  41.13 
 
 		 553 aa  410  1e-113  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3162  phosphoribulokinase/uridine kinase  41.76 
 
 		 552 aa  410  1e-113  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2289  phosphoribulokinase/uridine kinase family protein  39.89 
 
 		 550 aa  403  1e-111  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0142692  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1361  AAA ATPase  40.23 
 
 		 547 aa  397  1e-109  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.762498  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1347  phosphoribulokinase / uridine kinase family protein  39.85 
 
 		 551 aa  397  1e-109  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1554  putative threonyl-tRNA synthetase/uridine kinase  39.3 
 
 		 551 aa  394  1e-108  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.614355  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0031  phosphoribulokinase/uridine kinase  41.02 
 
 		 555 aa  391  1e-107  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3054  phosphoribulokinase/uridine kinase  39.79 
 
 		 462 aa  333  6e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3852  cyclic nucleotide-binding protein  39.78 
 
 		 713 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.108661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3863  cyclic nucleotide-binding protein  38.28 
 
 		 715 aa  289  8e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0623706  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3723  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  38.72 
 
 		 714 aa  286  5e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3780  cyclic nucleotide-binding protein  38.53 
 
 		 715 aa  285  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12201  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1669  threonyl-tRNA synthetase  35.96 
 
 		 637 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000137846  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0623  threonyl-tRNA synthetase  31.53 
 
 		 662 aa  105  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0189  threonyl-tRNA synthetase  32.85 
 
 		 640 aa  104  4e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114049  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0187  threonyl-tRNA synthetase  32.85 
 
 		 640 aa  103  8e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00194489  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1612  threonyl-tRNA synthetase  31.37 
 
 		 635 aa  103  9e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000178172  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3262  threonyl-tRNA synthetase  31.37 
 
 		 643 aa  102  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00002753  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4707  threonyl-tRNA synthetase  30.73 
 
 		 645 aa  101  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000334194  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4472  threonyl-tRNA synthetase  30.73 
 
 		 645 aa  101  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.419718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4307  threonyl-tRNA synthetase  30.73 
 
 		 645 aa  101  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00228432  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4318  threonyl-tRNA synthetase  30.73 
 
 		 645 aa  101  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0311311  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4685  threonyl-tRNA synthetase  30.73 
 
 		 645 aa  101  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00204863  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0552  threonyl-tRNA synthetase  30.73 
 
 		 645 aa  101  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000171694  unclonable  1.90469e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4820  threonyl-tRNA synthetase  30.73 
 
 		 645 aa  101  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00851939  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4691  threonyl-tRNA synthetase  30.73 
 
 		 645 aa  101  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.88699e-59 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4407  threonyl-tRNA synthetase  30.73 
 
 		 645 aa  101  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00383919  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4701  threonyl-tRNA synthetase  30.73 
 
 		 645 aa  101  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000566692  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0608  threonyl-tRNA synthetase  29.76 
 
 		 634 aa  98.2  4e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.769524  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0725  threonyl-tRNA synthetase  27.32 
 
 		 638 aa  98.2  4e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2145  threonyl-tRNA synthetase  31.07 
 
 		 639 aa  97.1  7e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0424  threonyl-tRNA synthetase  32.04 
 
 		 644 aa  97.1  7e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000699319  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2222  threonyl-tRNA synthetase  31.07 
 
 		 639 aa  97.1  8e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2388  threonyl-tRNA synthetase  31.07 
 
 		 639 aa  97.1  8e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2161  threonyl-tRNA synthetase  31.07 
 
 		 639 aa  96.7  9e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.820955  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2405  threonyl-tRNA synthetase  31.07 
 
 		 639 aa  96.7  9e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2102  threonyl-tRNA synthetase  29.9 
 
 		 635 aa  95.5  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.692107  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2419  threonyl-tRNA synthetase  30.58 
 
 		 640 aa  94.4  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1888  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  33.17 
 
 		 635 aa  94.4  5e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0150098 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2193  threonyl-tRNA synthetase  29.41 
 
 		 639 aa  94.4  6e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2489  threonyl-tRNA synthetase  30.58 
 
 		 639 aa  94  7e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.952507  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2393  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  32.2 
 
 		 644 aa  93.6  9e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.975747 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0693  threonyl-tRNA synthetase  33.17 
 
 		 638 aa  92.4  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.287981  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2243  threonyl-tRNA synthetase  34.15 
 
 		 644 aa  92.4  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00594301  hitchhiker  0.00373508 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2614  threonyl-tRNA synthetase  34.15 
 
 		 644 aa  92.4  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4615  threonyl-tRNA synthetase  31.86 
 
 		 635 aa  92.8  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00961863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2354  threonyl-tRNA synthetase  30.58 
 
 		 640 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2854  threonyl-tRNA synthetase  31.07 
 
 		 635 aa  91.7  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0336987 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2628  threonyl-tRNA synthetase  31.55 
 
 		 645 aa  92  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000255721  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1327  threonyl-tRNA synthetase  25.85 
 
 		 636 aa  91.7  3e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0393085  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2401  threonyl-tRNA synthetase  30.88 
 
 		 634 aa  92  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.162517  normal  0.284009 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2661  threonyl-tRNA synthetase  30.92 
 
 		 644 aa  91.7  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000386283  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2756  threonyl-tRNA synthetase  31.86 
 
 		 635 aa  91.3  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.323332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1399  threonyl-tRNA synthetase  31.37 
 
 		 635 aa  91.3  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00532167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1371  threonyl-tRNA synthetase  31.86 
 
 		 635 aa  91.3  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1359  threonyl-tRNA synthetase  31.37 
 
 		 635 aa  91.3  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2973  threonyl-tRNA synthetase  30.58 
 
 		 640 aa  91.3  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.617243 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0202  threonyl-tRNA synthetase  31.37 
 
 		 635 aa  90.9  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00540019  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1539  threonyl-tRNA synthetase  31.37 
 
 		 635 aa  90.9  5e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1096  threonyl-tRNA synthetase  31.37 
 
 		 635 aa  90.9  5e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.869704  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1890  threonyl-tRNA synthetase  31.37 
 
 		 635 aa  90.9  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190857  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0993  threonyl-tRNA synthetase  31.37 
 
 		 635 aa  91.3  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.31786  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1712  threonyl-tRNA synthetase  31.37 
 
 		 635 aa  90.9  5e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.713127  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1735  threonyl-tRNA synthetase  31.37 
 
 		 635 aa  90.9  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261137  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1452  threonyl-tRNA synthetase  31.37 
 
 		 635 aa  91.3  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0192845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1475  threonyl-tRNA synthetase  31.37 
 
 		 635 aa  91.3  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0274744  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0963  threonyl-tRNA synthetase  31.37 
 
 		 635 aa  90.9  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0747512  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2219  threonyl-tRNA synthetase  27.07 
 
 		 647 aa  90.9  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0771332 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2230  threonyl-tRNA synthetase  30.88 
 
 		 636 aa  90.5  7e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00712554 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1759  threonyl-tRNA synthetase  30.88 
 
 		 633 aa  90.1  9e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000991077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1336  threonyl-tRNA synthetase  29.41 
 
 		 669 aa  90.1  9e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2595  threonyl-tRNA synthetase  31.37 
 
 		 635 aa  90.1  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3194  threonyl-tRNA synthetase  29.76 
 
 		 637 aa  89  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1990  threonyl-tRNA synthetase  29.9 
 
 		 636 aa  89.4  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0457996  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0797  threonyl-tRNA synthetase  30.88 
 
 		 652 aa  88.6  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0185  threonyl-tRNA synthetase  28.43 
 
 		 639 aa  87.8  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000179764  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1275  threonyl-tRNA synthetase  30.39 
 
 		 635 aa  88.2  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.966183  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1779  threonyl-tRNA synthetase  30.88 
 
 		 635 aa  88.2  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420901  normal  0.799245 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1160  threonyl-tRNA synthetase  30.88 
 
 		 635 aa  88.2  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.139321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2175  threonyl-tRNA synthetase  30.92 
 
 		 648 aa  87.8  5e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01383  threonyl-tRNA synthetase  28.99 
 
 		 649 aa  87.8  5e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1558  threonyl-tRNA synthetase  31.37 
 
 		 635 aa  87.4  7e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2196  threonyl-tRNA synthetase  29.56 
 
 		 640 aa  87  8e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.163846  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1906  threonyl-tRNA synthetase  26.6 
 
 		 641 aa  86.7  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1767  threonyl-tRNA synthetase  27.88 
 
 		 640 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.143728  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2308  threonyl-tRNA synthetase  28.08 
 
 		 636 aa  85.5  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304156  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>