254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3723 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011145  AnaeK_3780  cyclic nucleotide-binding protein  95.8 
 
 		 715 aa  1239    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12201  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3723  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  100 
 
 		 714 aa  1403    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3852  cyclic nucleotide-binding protein  73.57 
 
 		 713 aa  980    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.108661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3863  cyclic nucleotide-binding protein  95.94 
 
 		 715 aa  1259    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0623706  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0041  phosphoribulokinase/uridine kinase  38.06 
 
 		 554 aa  365  2e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.448598  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1435  AAA ATPase  35.12 
 
 		 552 aa  337  5.999999999999999e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1290  phosphoribulokinase/uridine kinase  34.29 
 
 		 547 aa  335  2e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.297478  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0332  phosphoribulokinase/uridine kinase  35.82 
 
 		 557 aa  334  4e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1745  phosphoribulokinase family protein  37.55 
 
 		 529 aa  330  5.0000000000000004e-89  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0176  phosphoribulokinase/uridine kinase  36.71 
 
 		 555 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0833476  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0178  phosphoribulokinase/uridine kinase  36.71 
 
 		 555 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.871097  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0134  phosphoribulokinase/uridine kinase  33.21 
 
 		 558 aa  326  7e-88  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1435  phosphoribulokinase/uridine kinase  34.26 
 
 		 553 aa  322  9.999999999999999e-87  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10770  uridine kinase  33.57 
 
 		 549 aa  320  3.9999999999999996e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2238  phosphoribulokinase/uridine kinase  38.45 
 
 		 567 aa  320  6e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.958517  normal  0.150287 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3162  phosphoribulokinase/uridine kinase  34.05 
 
 		 552 aa  320  6e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1763  phosphoribulokinase/uridine kinase  35.47 
 
 		 559 aa  318  2e-85  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.295373  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1101  uridine kinase  37.15 
 
 		 557 aa  316  7e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3519  phosphoribulokinase/uridine kinase  34.98 
 
 		 553 aa  316  9.999999999999999e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1361  AAA ATPase  38.21 
 
 		 547 aa  313  7.999999999999999e-84  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.762498  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0531  AAA ATPase  34.16 
 
 		 554 aa  310  4e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.777332  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0031  phosphoribulokinase/uridine kinase  35.36 
 
 		 555 aa  297  4e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3054  phosphoribulokinase/uridine kinase  44.17 
 
 		 462 aa  291  2e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2289  phosphoribulokinase/uridine kinase family protein  34.22 
 
 		 550 aa  290  8e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0142692  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1347  phosphoribulokinase / uridine kinase family protein  33.15 
 
 		 551 aa  283  6.000000000000001e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1554  putative threonyl-tRNA synthetase/uridine kinase  32.5 
 
 		 551 aa  283  7.000000000000001e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.614355  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5127  phosphoribulokinase/uridine kinase  27.88 
 
 		 205 aa  73.9  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.426663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05580  Threonyl-tRNA synthetase  27.11 
 
 		 646 aa  72.8  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000588041  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4546  phosphoribulokinase/uridine kinase  28.43 
 
 		 217 aa  72.8  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.896481 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1669  threonyl-tRNA synthetase  27.89 
 
 		 637 aa  70.1  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000137846  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0984  threonyl-tRNA synthetase  26.53 
 
 		 644 aa  68.2  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.234013 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2639  threonyl-tRNA synthetase  25.37 
 
 		 644 aa  65.5  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.3159  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0202  uridine kinase  27.01 
 
 		 204 aa  63.2  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0043  threonyl-tRNA synthetase  31.58 
 
 		 649 aa  63.2  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3563  uridine kinase  29.59 
 
 		 213 aa  63.2  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.933791  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2997  threonyl-tRNA synthetase  29.06 
 
 		 644 aa  62  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2175  threonyl-tRNA synthetase  29.61 
 
 		 648 aa  62  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl306  uridine kinase  24.42 
 
 		 208 aa  62  0.00000004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000466982  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2364  uridine kinase  28.42 
 
 		 219 aa  61.6  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1612  threonyl-tRNA synthetase  26.46 
 
 		 635 aa  61.6  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000178172  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81319  uridine kinase  28.22 
 
 		 504 aa  61.2  0.00000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0146953  normal  0.484619 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0427  threonyl-tRNA synthetase  24.55 
 
 		 640 aa  60.8  0.00000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0436469  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0011  uridine kinase  28.86 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0707  threonyl-tRNA synthetase  26.63 
 
 		 644 aa  60.8  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00542671  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2617  uridine kinase  30.85 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1657  uridine kinase  30.85 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0722731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1732  uridine kinase  30.85 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000414727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1762  uridine kinase  30.85 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0067733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02924  uridine kinase  28.36 
 
 		 213 aa  59.7  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2228  uridine kinase  30.35 
 
 		 215 aa  59.7  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2218  uridine kinase  31.34 
 
 		 212 aa  59.7  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.428302  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1515  threonyl-tRNA synthetase  26.06 
 
 		 636 aa  58.5  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00436769  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2244  uridine kinase  30.85 
 
 		 212 aa  58.5  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07150  uridine kinase  26.37 
 
 		 202 aa  58.2  0.0000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2401  threonyl-tRNA synthetase  24.69 
 
 		 634 aa  58.5  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.162517  normal  0.284009 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2393  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  28.04 
 
 		 644 aa  58.2  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.975747 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1330  uridine kinase  28 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.60785 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3194  threonyl-tRNA synthetase  28.34 
 
 		 637 aa  58.2  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0424  threonyl-tRNA synthetase  26.51 
 
 		 644 aa  57.8  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000699319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0044  uridine kinase  26.87 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2463  uridine kinase  30.35 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000426115  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2576  uridine kinase  30.35 
 
 		 212 aa  56.6  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0976754  normal  0.0423229 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2456  uridine kinase  30.35 
 
 		 212 aa  56.6  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000511378  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2054  uridine kinase  29.35 
 
 		 212 aa  57  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1888  uridine kinase  30.35 
 
 		 212 aa  56.6  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000127737  normal  0.0259304 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36540  uridine kinase  28.85 
 
 		 199 aa  57  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.36252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0392  threonyl-tRNA synthetase  21.64 
 
 		 633 aa  55.8  0.000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1385  uridine kinase  29 
 
 		 209 aa  55.8  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1974  uridine kinase  26.96 
 
 		 216 aa  55.8  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.308367  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0490  threonyl-tRNA synthetase  28.85 
 
 		 647 aa  55.5  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00808985  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1411  threonyl-tRNA synthetase  27.08 
 
 		 645 aa  55.5  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000074774  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1089  threonyl-tRNA synthetase  25.93 
 
 		 635 aa  55.8  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00500732  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1575  uridine kinase  31.46 
 
 		 211 aa  55.8  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1493  uridine kinase  29.35 
 
 		 196 aa  55.5  0.000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.54247 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2368  threonyl-tRNA synthetase  28.08 
 
 		 644 aa  55.1  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.642893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2308  threonyl-tRNA synthetase  26.06 
 
 		 636 aa  55.1  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304156  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2047  uridine kinase  29.35 
 
 		 212 aa  54.7  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.20095  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1869  threonyl-tRNA synthetase  27.88 
 
 		 646 aa  54.3  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.130621  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002983  uridine kinase (C1)  27.86 
 
 		 213 aa  54.3  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.163408  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5417  cyclic nucleotide-binding protein  27.34 
 
 		 419 aa  54.3  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0881735  normal  0.0681678 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10398  predicted protein  28.4 
 
 		 209 aa  53.9  0.000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.296577  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4227  uridine kinase  30.72 
 
 		 212 aa  53.5  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2005  uridine kinase  26.97 
 
 		 204 aa  53.9  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.679011  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1450  threonyl-tRNA synthetase  26.85 
 
 		 643 aa  53.5  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0623  threonyl-tRNA synthetase  27.15 
 
 		 662 aa  53.5  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0748  threonyl-tRNA synthetase  27.81 
 
 		 652 aa  53.5  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0556  uridine kinase  27.86 
 
 		 219 aa  53.5  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0365333  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0841  cyclic nucleotide-binding protein  29.5 
 
 		 160 aa  53.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3487  threonyl-tRNA synthetase  27.4 
 
 		 643 aa  52.8  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1919  uridine kinase  29.35 
 
 		 211 aa  52.8  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0768  threonyl-tRNA synthetase  26.11 
 
 		 641 aa  53.1  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.67512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0537  uridine kinase  29.01 
 
 		 242 aa  53.1  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0563702  hitchhiker  0.00000000000000916272 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1289  uridine kinase  29.82 
 
 		 213 aa  52.4  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.731499  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3886  threonyl-tRNA synthetase  27.5 
 
 		 687 aa  52.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1384  threonyl-tRNA synthetase  29.14 
 
 		 635 aa  52.4  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000717334  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3042  uridine kinase  29.82 
 
 		 213 aa  52.4  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2651  uridine kinase  32.2 
 
 		 211 aa  52.4  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.212203 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1418  threonyl-tRNA synthetase  25.88 
 
 		 638 aa  51.6  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000102997  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12970  uridine kinase  29.24 
 
 		 204 aa  51.6  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000147377  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2386  uridine kinase  25.62 
 
 		 209 aa  51.2  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000694748  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>