More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0490 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1869  threonyl-tRNA synthetase  63.23 
 
 		 646 aa  795    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.130621  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1515  threonyl-tRNA synthetase  58.39 
 
 		 636 aa  793    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00436769  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2243  threonyl-tRNA synthetase  51.63 
 
 		 644 aa  645    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00594301  hitchhiker  0.00373508 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1384  threonyl-tRNA synthetase  52.95 
 
 		 635 aa  654    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000717334  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0490  threonyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 647 aa  1336    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00808985  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2230  threonyl-tRNA synthetase  62.76 
 
 		 636 aa  787    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00712554 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2628  threonyl-tRNA synthetase  60.68 
 
 		 645 aa  789    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000255721  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0392  threonyl-tRNA synthetase  51.15 
 
 		 633 aa  637    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2401  threonyl-tRNA synthetase  52.69 
 
 		 634 aa  679    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.162517  normal  0.284009 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0984  threonyl-tRNA synthetase  69.71 
 
 		 644 aa  965    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.234013 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1372  threonyl-tRNA synthetase  53.1 
 
 		 635 aa  639    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000383369  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2823  threonyl-tRNA synthetase  50.63 
 
 		 643 aa  669    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000177582  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1418  threonyl-tRNA synthetase  57.1 
 
 		 638 aa  740    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000102997  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0043  threonyl-tRNA synthetase  62.29 
 
 		 649 aa  872    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1411  threonyl-tRNA synthetase  58.23 
 
 		 645 aa  785    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000074774  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2639  threonyl-tRNA synthetase  67.39 
 
 		 644 aa  936    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.3159  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1450  threonyl-tRNA synthetase  51.6 
 
 		 643 aa  639    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1669  threonyl-tRNA synthetase  52.52 
 
 		 637 aa  654    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000137846  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1759  threonyl-tRNA synthetase  50.79 
 
 		 633 aa  660    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000991077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2614  threonyl-tRNA synthetase  51.63 
 
 		 644 aa  645    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1228  threonyl-tRNA synthetase  56.17 
 
 		 635 aa  689    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000338672  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0608  threonyl-tRNA synthetase  50.59 
 
 		 634 aa  638    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.769524  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0185  threonyl-tRNA synthetase  53.02 
 
 		 639 aa  679    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000179764  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0723  threonyl-tRNA synthetase  52.33 
 
 		 631 aa  655    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000476694  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2057  threonyl-tRNA synthetase  54.99 
 
 		 634 aa  665    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000136416  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2997  threonyl-tRNA synthetase  63.1 
 
 		 644 aa  844    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0707  threonyl-tRNA synthetase  73.26 
 
 		 644 aa  1006    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00542671  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0912  threonyl-tRNA synthetase  52.73 
 
 		 638 aa  651    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1612  threonyl-tRNA synthetase  52.62 
 
 		 635 aa  662    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000178172  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1089  threonyl-tRNA synthetase  53.6 
 
 		 635 aa  661    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00500732  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1990  threonyl-tRNA synthetase  60.95 
 
 		 636 aa  788    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0457996  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0424  threonyl-tRNA synthetase  61.31 
 
 		 644 aa  768    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000699319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0363  threonyl-tRNA synthetase  51.06 
 
 		 648 aa  667    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0255987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2308  threonyl-tRNA synthetase  60.1 
 
 		 636 aa  781    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304156  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1824  threonyl-tRNA synthetase  48.5 
 
 		 636 aa  626  1e-178  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000392835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2854  threonyl-tRNA synthetase  52.68 
 
 		 635 aa  626  1e-178  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0336987 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1025  threonyl-tRNA synthetase  50.41 
 
 		 638 aa  622  1e-177  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.572663  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0189  threonyl-tRNA synthetase  48.64 
 
 		 640 aa  620  1e-176  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114049  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1336  threonyl-tRNA synthetase  51.36 
 
 		 669 aa  620  1e-176  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0187  threonyl-tRNA synthetase  48.64 
 
 		 640 aa  619  1e-176  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00194489  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2665  threonyl-tRNA synthetase  51.68 
 
 		 584 aa  619  1e-176  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000220787  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4616  threonyl-tRNA synthetase  52.94 
 
 		 643 aa  613  9.999999999999999e-175  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213357 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1140  threonyl-tRNA synthetase  50.77 
 
 		 644 aa  614  9.999999999999999e-175  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000099925  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0028  threonyl-tRNA synthetase  49.74 
 
 		 603 aa  613  9.999999999999999e-175  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3194  threonyl-tRNA synthetase  50.59 
 
 		 637 aa  612  9.999999999999999e-175  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0693  threonyl-tRNA synthetase  50.17 
 
 		 638 aa  609  1e-173  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.287981  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2003  threonyl-tRNA synthetase  47.87 
 
 		 635 aa  608  1e-173  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00562927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2102  threonyl-tRNA synthetase  51.99 
 
 		 635 aa  611  1e-173  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.692107  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0835  threonyl-tRNA synthetase  50.42 
 
 		 640 aa  611  1e-173  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1667  threonyl-tRNA synthetase  47.36 
 
 		 642 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.301446  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0768  threonyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 641 aa  602  1.0000000000000001e-171  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.67512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1907  threonyl-tRNA synthetase  49.08 
 
 		 637 aa  604  1.0000000000000001e-171  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000167344 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2770  threonyl-tRNA synthetase  48.94 
 
 		 637 aa  598  1e-170  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2643  threonyl-tRNA synthetase  48.45 
 
 		 637 aa  598  1e-170  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1647  threonyl-tRNA synthetase  51.06 
 
 		 635 aa  602  1e-170  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0710025 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1745  threonyl-tRNA synthetase  50.69 
 
 		 637 aa  600  1e-170  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239329 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0566  threonyl-tRNA synthetase  49.3 
 
 		 583 aa  600  1e-170  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1577  threonyl-tRNA synthetase  47.97 
 
 		 636 aa  600  1e-170  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.219126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0725  threonyl-tRNA synthetase  49.75 
 
 		 638 aa  598  1e-170  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1320  threonyl-tRNA synthetase  49.42 
 
 		 637 aa  600  1e-170  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.865645  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0199  threonyl-tRNA synthetase  48.88 
 
 		 602 aa  596  1e-169  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0226  threonyl-tRNA synthetase  49.32 
 
 		 614 aa  597  1e-169  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1327  threonyl-tRNA synthetase  47.8 
 
 		 636 aa  595  1e-169  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0393085  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2400  threonyl-tRNA synthetase  49.76 
 
 		 639 aa  597  1e-169  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.459202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1977  threonyl-tRNA synthetase  50.53 
 
 		 635 aa  596  1e-169  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2061  threonyl-tRNA synthetase  49.3 
 
 		 641 aa  596  1e-169  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.399726  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1448  threonyl-tRNA synthetase  49.6 
 
 		 639 aa  597  1e-169  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0238  threonyl-tRNA synthetase  48.53 
 
 		 602 aa  593  1e-168  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2136  threonyl-tRNA synthetase  46.92 
 
 		 644 aa  592  1e-168  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000263348  hitchhiker  0.00165189 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0330  threonyl-tRNA synthetase  47.84 
 
 		 606 aa  594  1e-168  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000295964  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2145  threonyl-tRNA synthetase  46.55 
 
 		 639 aa  592  1e-168  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0427  threonyl-tRNA synthetase  49.15 
 
 		 640 aa  592  1e-168  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0436469  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0216  threonyl-tRNA synthetase  48.54 
 
 		 602 aa  593  1e-168  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3623  threonyl-tRNA synthetase  49.83 
 
 		 643 aa  592  1e-168  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.263576  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2419  threonyl-tRNA synthetase  45.4 
 
 		 640 aa  590  1e-167  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2354  threonyl-tRNA synthetase  46.22 
 
 		 640 aa  590  1e-167  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2222  threonyl-tRNA synthetase  46.22 
 
 		 639 aa  591  1e-167  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2161  threonyl-tRNA synthetase  46.05 
 
 		 639 aa  589  1e-167  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.820955  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2388  threonyl-tRNA synthetase  46.22 
 
 		 639 aa  591  1e-167  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0066  threonyl-tRNA synthetase  46.09 
 
 		 602 aa  591  1e-167  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00000216362  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1888  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  52.11 
 
 		 635 aa  590  1e-167  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0150098 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2489  threonyl-tRNA synthetase  46.05 
 
 		 639 aa  589  1e-167  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.952507  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2405  threonyl-tRNA synthetase  46.05 
 
 		 639 aa  589  1e-167  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4736  threonyl-tRNA synthetase  49.31 
 
 		 659 aa  590  1e-167  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.556159 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2973  threonyl-tRNA synthetase  46.38 
 
 		 640 aa  590  1e-167  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.617243 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2193  threonyl-tRNA synthetase  45.18 
 
 		 639 aa  590  1e-167  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1819  threonyl-tRNA synthetase  46.55 
 
 		 606 aa  588  1e-167  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.196151  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0108  threonyl-tRNA synthetase  47.03 
 
 		 643 aa  585  1e-166  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2378  threonyl-tRNA synthetase  48.85 
 
 		 640 aa  587  1e-166  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.423573  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2098  threonyl-tRNA synthetase  45.25 
 
 		 644 aa  586  1e-166  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000824061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0081  threonyl-tRNA synthetase  47.65 
 
 		 605 aa  586  1e-166  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000716431  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0487  threonyl-tRNA synthetase  49.48 
 
 		 638 aa  588  1e-166  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.348528  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2162  threonyl-tRNA synthetase  48.31 
 
 		 640 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.749908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02485  threonyl-tRNA synthetase  47.78 
 
 		 638 aa  582  1.0000000000000001e-165  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0163148  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1034  threonyl-tRNA synthetase  48.33 
 
 		 611 aa  582  1.0000000000000001e-165  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2595  threonyl-tRNA synthetase  48.31 
 
 		 635 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0681  threonyl-tRNA synthetase  49.63 
 
 		 582 aa  584  1.0000000000000001e-165  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000323411  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28650  threonyl-tRNA synthetase  48.67 
 
 		 640 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000737785 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0611  threonyl-tRNA synthetase  46.55 
 
 		 609 aa  582  1.0000000000000001e-165  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.260291  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2219  threonyl-tRNA synthetase  46.92 
 
 		 635 aa  584  1.0000000000000001e-165  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00166056  normal  0.0562711 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>