More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5417 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_5417  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 
419 aa  861    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0881735  normal  0.0681678 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3345  cyclic nucleotide-binding protein  47.72 
 
 
417 aa  416  9.999999999999999e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.254717  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3831  cyclic nucleotide-binding protein  39.65 
 
 
435 aa  305  9.000000000000001e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0387698 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0733  serine/threonine phosphatase  43.41 
 
 
264 aa  186  8e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.310547  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0770  protein serine/threonine phosphatase  42.69 
 
 
280 aa  184  3e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0770  protein serine/threonine phosphatase  42.69 
 
 
280 aa  184  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5893  protein serine/threonine phosphatase  39.02 
 
 
386 aa  173  5e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.161748  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0777  protein phosphatase 2C-like protein  45.06 
 
 
292 aa  172  7.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.341218  normal  0.437484 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5885  protein serine/threonine phosphatase  40.46 
 
 
259 aa  171  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3817  protein phosphatase 2C-like protein  41.29 
 
 
256 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00358114 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0927  protein serine/threonine phosphatase  36.92 
 
 
273 aa  163  4.0000000000000004e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00103547  hitchhiker  1.35771e-17 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6773  protein serine/threonine phosphatase  40.23 
 
 
254 aa  162  8.000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3111  protein serine/threonine phosphatase  36.76 
 
 
319 aa  159  1e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0426507 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4547  protein phosphatase 2C domain-containing protein  40.15 
 
 
470 aa  157  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0099  protein serine/threonine phosphatase  39.77 
 
 
449 aa  157  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2307  protein serine/threonine phosphatase  35.77 
 
 
238 aa  157  4e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1750  protein phosphatase 2C domain-containing protein  35.37 
 
 
247 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165871  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1589  protein phosphatase 2C domain-containing protein  37.7 
 
 
237 aa  153  5e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1588  protein serine/threonine phosphatase  38.61 
 
 
267 aa  153  5.9999999999999996e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5906  protein serine/threonine phosphatase  37.35 
 
 
257 aa  152  8e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615058  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3691  serine/threonine phosphatase  38.08 
 
 
256 aa  152  8.999999999999999e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221121  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0952  protein phosphatase 2C-like protein  38.49 
 
 
276 aa  152  1e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0472  protein serine/threonine phosphatase  37.1 
 
 
320 aa  151  2e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1226  serine/threonine phosphatase  34.4 
 
 
236 aa  151  2e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0573  protein serine/threonine phosphatases  36 
 
 
245 aa  151  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3832  protein serine/threonine phosphatase  37.05 
 
 
256 aa  150  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.982959 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3832  protein serine/threonine phosphatase  37.69 
 
 
256 aa  150  5e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.140812  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3749  protein serine/threonine phosphatase  37.69 
 
 
256 aa  150  5e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00230331  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2083  Serine/threonine protein phosphatase  36.65 
 
 
258 aa  150  6e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1312  protein serine/threonine phosphatase  38.46 
 
 
236 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3187  protein serine/threonine phosphatase  35.27 
 
 
415 aa  149  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000686686  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1956  protein serine/threonine phosphatase  34.77 
 
 
252 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1044  protein serine/threonine phosphatase  33.6 
 
 
245 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0437  protein phosphatase 2C-like  34.78 
 
 
296 aa  146  6e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.018902 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3950  protein phosphatase 2C domain-containing protein  36.36 
 
 
261 aa  146  6e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0256176 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1343  protein serine/threonine phosphatase  37.45 
 
 
394 aa  146  8.000000000000001e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00740563 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3622  protein serine/threonine phosphatase  38.34 
 
 
271 aa  145  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00717219  decreased coverage  0.000139718 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1066  protein serine/threonine phosphatase  33.71 
 
 
249 aa  145  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3435  protein serine/threonine phosphatases  34.73 
 
 
281 aa  144  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000124368 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0753  protein serine/threonine phosphatase  36.72 
 
 
574 aa  145  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.17783 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6845  cyclic nucleotide-binding protein  31.85 
 
 
396 aa  144  3e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.503804 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1534  protein serine/threonine phosphatase  33.99 
 
 
241 aa  144  3e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0909  protein serine/threonine phosphatases  38.74 
 
 
236 aa  144  4e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0310722  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5189  protein serine/threonine phosphatase  36.89 
 
 
266 aa  143  5e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0318  serine/threonine phosphatase, putative  35.83 
 
 
245 aa  142  8e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0014  protein serine/threonine phosphatase  39.02 
 
 
416 aa  142  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0477  protein serine/threonine phosphatases  35.18 
 
 
256 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2879  protein serine/threonine phosphatase  34.94 
 
 
262 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0260244 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00890  putative phosphoprotein phosphatase  36.4 
 
 
242 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0335578  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1170  protein phosphatase 2C-like protein  33.2 
 
 
246 aa  140  4.999999999999999e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.325557  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1366  protein serine/threonine phosphatase  34.77 
 
 
280 aa  139  6e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2487  protein serine/threonine phosphatase  35 
 
 
241 aa  140  6e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00028988  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0146  putative phosphoprotein phosphatase  36.8 
 
 
242 aa  139  7e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09950  phosphoric monoester hydrolase  33.6 
 
 
236 aa  139  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1393  phosphoprotein phosphatase  34.66 
 
 
245 aa  139  1e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0996  protein phosphatase 2C-like protein  33.71 
 
 
305 aa  138  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1682  protein serine/threonine phosphatase  33.72 
 
 
313 aa  138  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4004  protein serine/threonine phosphatase  34 
 
 
256 aa  138  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.467216  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0229  protein serine/threonine phosphatases  38.52 
 
 
348 aa  137  3.0000000000000003e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2423  protein phosphatase 2C-like  34.92 
 
 
259 aa  137  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2392  protein serine/threonine phosphatase  35.06 
 
 
597 aa  137  5e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.685774  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1710  protein phosphatase 2C family protein  31.98 
 
 
239 aa  137  5e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1992  protein phosphatase 2C family protein  31.58 
 
 
239 aa  136  6.0000000000000005e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0625  protein serine/threonine phosphatase  33.6 
 
 
241 aa  136  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000018  serine/threonine protein phosphatase  33.33 
 
 
264 aa  136  8e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2314  protein phosphatase 2C domain-containing protein  36.25 
 
 
243 aa  135  9e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.109306  hitchhiker  0.0000219679 
 
 
-
 
NC_002620  TC0530  serine/threonine protein phosphatase, putative  31.33 
 
 
249 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.467374  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3041  protein serine/threonine phosphatase  33.09 
 
 
395 aa  135  9.999999999999999e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0849  protein serine/threonine phosphatase  36.86 
 
 
247 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.102968 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42890  serine/threonine phosphoprotein phosphatase Stp1  36.29 
 
 
242 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.566256 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4678  protein serine/threonine phosphatases  35.55 
 
 
261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0912  protein serine/threonine phosphatase  34.57 
 
 
276 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.615558 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0763  Serine/threonine protein phosphatase  33.33 
 
 
250 aa  135  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000015661 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1711  protein phosphatase 2C domain-containing protein  34.94 
 
 
238 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3602  serine/threonine phosphoprotein phosphatase Stp1  36.29 
 
 
242 aa  134  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3962  protein phosphatase 2C, family protein  35.08 
 
 
250 aa  134  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4212  protein serine/threonine phosphatase  33.33 
 
 
548 aa  134  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.685502  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3847  protein serine/threonine phosphatase  38.4 
 
 
239 aa  134  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000749886  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03320  serine/threonine protein phosphatase  34.25 
 
 
452 aa  134  3e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0159722  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4042  protein serine/threonine phosphatase  33.21 
 
 
389 aa  134  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02467  protein phosphatase  34.94 
 
 
234 aa  134  3.9999999999999996e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3731  protein serine/threonine phosphatase  33.59 
 
 
318 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00715108 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27050  serine/threonine protein phosphatase  34.4 
 
 
425 aa  133  5e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0156  protein serine/threonine phosphatase  35.97 
 
 
259 aa  133  5e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000223411  normal  0.0165822 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1935  protein serine/threonine phosphatase  36.26 
 
 
321 aa  133  6e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.709495  hitchhiker  0.0000466361 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0068  serine/threonine specific protein phosphatase (putative)  35.83 
 
 
269 aa  133  6e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5417  serine/threonine phosphoprotein phosphatase  34.43 
 
 
242 aa  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1333  protein serine/threonine phosphatase  33.88 
 
 
270 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.535084  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3905  protein phosphatase 2C, family protein  34.27 
 
 
250 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2515  protein phosphatase 2C-like protein  33.47 
 
 
250 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00146848  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3622  protein phosphatase 2C  33.87 
 
 
250 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0160  protein serine/threonine phosphatase  35.97 
 
 
259 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1281  protein phosphatase 2C, family protein  34.68 
 
 
250 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0174873 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1071  protein serine/threonine phosphatase  34.14 
 
 
538 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.821303  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3911  protein phosphatase 2C, family protein  34.27 
 
 
250 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00759047  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3686  protein serine/threonine phosphatase  34.27 
 
 
250 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3604  protein phosphatase 2C  33.87 
 
 
250 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4001  protein phosphatase 2C, family protein  33.87 
 
 
250 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4330  protein serine/threonine phosphatases  34.77 
 
 
280 aa  130  5.0000000000000004e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.283162  normal  0.496485 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3877  protein phosphatase 2C, family protein  33.87 
 
 
250 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.65196e-21 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>