More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_05580 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1515  threonyl-tRNA synthetase  48.13 
 
 
636 aa  637    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00436769  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0748  threonyl-tRNA synthetase  59.41 
 
 
652 aa  799    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1246  threonyl-tRNA synthetase  50.77 
 
 
645 aa  663    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.1161  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0797  threonyl-tRNA synthetase  54.9 
 
 
652 aa  714    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4707  threonyl-tRNA synthetase  53.45 
 
 
645 aa  692    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000334194  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0711  threonyl-tRNA synthetase  49.84 
 
 
647 aa  657    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1372  threonyl-tRNA synthetase  50.78 
 
 
635 aa  648    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000383369  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4472  threonyl-tRNA synthetase  53.45 
 
 
645 aa  694    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.419718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4307  threonyl-tRNA synthetase  53.45 
 
 
645 aa  694    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00228432  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4318  threonyl-tRNA synthetase  53.45 
 
 
645 aa  694    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0311311  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2057  threonyl-tRNA synthetase  51.33 
 
 
634 aa  649    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000136416  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1373  threonyl-tRNA synthetase  69.83 
 
 
645 aa  940    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000340223  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2175  threonyl-tRNA synthetase  50.85 
 
 
648 aa  684    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05580  Threonyl-tRNA synthetase  100 
 
 
646 aa  1322    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000588041  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1612  threonyl-tRNA synthetase  48.68 
 
 
635 aa  647    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000178172  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1418  threonyl-tRNA synthetase  48.37 
 
 
638 aa  636    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000102997  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1411  threonyl-tRNA synthetase  48.97 
 
 
645 aa  643    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000074774  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2230  threonyl-tRNA synthetase  49.69 
 
 
636 aa  639    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00712554 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4820  threonyl-tRNA synthetase  53.45 
 
 
645 aa  694    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00851939  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1228  threonyl-tRNA synthetase  52.34 
 
 
635 aa  676    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000338672  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0552  threonyl-tRNA synthetase  53.76 
 
 
645 aa  695    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000171694  unclonable  1.90469e-25 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3262  threonyl-tRNA synthetase  53.77 
 
 
643 aa  696    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00002753  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4701  threonyl-tRNA synthetase  53.29 
 
 
645 aa  691    Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000566692  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1774  threonyl-tRNA synthetase  51.54 
 
 
645 aa  673    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4691  threonyl-tRNA synthetase  53.45 
 
 
645 aa  694    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.88699e-59 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1740  threonyl-tRNA synthetase  51.54 
 
 
645 aa  673    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0523763  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2661  threonyl-tRNA synthetase  54.98 
 
 
644 aa  726    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000386283  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2628  threonyl-tRNA synthetase  49.22 
 
 
645 aa  642    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000255721  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4685  threonyl-tRNA synthetase  53.45 
 
 
645 aa  692    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00204863  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1990  threonyl-tRNA synthetase  49.69 
 
 
636 aa  640    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0457996  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2631  threonyl-tRNA synthetase  63.04 
 
 
643 aa  867    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2317  threonyl-tRNA synthetase  63.2 
 
 
643 aa  869    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0613  threonyl-tRNA synthetase  49.23 
 
 
648 aa  644    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0801  threonyl-tRNA synthetase  67.95 
 
 
647 aa  917    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00121365  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4407  threonyl-tRNA synthetase  53.45 
 
 
645 aa  692    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00383919  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0912  threonyl-tRNA synthetase  47.04 
 
 
638 aa  630  1e-179  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1384  threonyl-tRNA synthetase  48.22 
 
 
635 aa  630  1e-179  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000717334  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2401  threonyl-tRNA synthetase  47.66 
 
 
634 aa  627  1e-178  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.162517  normal  0.284009 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1327  threonyl-tRNA synthetase  48.45 
 
 
636 aa  626  1e-178  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0393085  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0623  threonyl-tRNA synthetase  48.3 
 
 
662 aa  627  1e-178  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2222  threonyl-tRNA synthetase  47.12 
 
 
639 aa  622  1e-177  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2388  threonyl-tRNA synthetase  47.12 
 
 
639 aa  622  1e-177  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2308  threonyl-tRNA synthetase  47.35 
 
 
636 aa  622  1e-177  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304156  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2161  threonyl-tRNA synthetase  47.12 
 
 
639 aa  620  1e-176  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.820955  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2145  threonyl-tRNA synthetase  47.43 
 
 
639 aa  621  1e-176  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2405  threonyl-tRNA synthetase  47.12 
 
 
639 aa  620  1e-176  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0189  threonyl-tRNA synthetase  48.75 
 
 
640 aa  618  1e-176  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114049  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2489  threonyl-tRNA synthetase  47.28 
 
 
639 aa  620  1e-176  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.952507  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1824  threonyl-tRNA synthetase  49.61 
 
 
636 aa  615  1e-175  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000392835  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2419  threonyl-tRNA synthetase  46.98 
 
 
640 aa  616  1e-175  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2354  threonyl-tRNA synthetase  46.67 
 
 
640 aa  615  1e-175  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0187  threonyl-tRNA synthetase  48.6 
 
 
640 aa  616  1e-175  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00194489  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0725  threonyl-tRNA synthetase  47.98 
 
 
638 aa  617  1e-175  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1767  threonyl-tRNA synthetase  47.36 
 
 
640 aa  616  1e-175  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.143728  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1450  threonyl-tRNA synthetase  46.49 
 
 
643 aa  612  9.999999999999999e-175  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2973  threonyl-tRNA synthetase  46.2 
 
 
640 aa  610  1e-173  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.617243 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0185  threonyl-tRNA synthetase  47.43 
 
 
639 aa  609  1e-173  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000179764  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1140  threonyl-tRNA synthetase  44.96 
 
 
644 aa  605  9.999999999999999e-173  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000099925  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1759  threonyl-tRNA synthetase  46.11 
 
 
633 aa  607  9.999999999999999e-173  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000991077  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2181  threonyl-tRNA synthetase  47.52 
 
 
646 aa  606  9.999999999999999e-173  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1669  threonyl-tRNA synthetase  47.34 
 
 
637 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000137846  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1869  threonyl-tRNA synthetase  48.5 
 
 
646 aa  602  1e-170  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.130621  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2193  threonyl-tRNA synthetase  45.41 
 
 
639 aa  600  1e-170  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1089  threonyl-tRNA synthetase  45.33 
 
 
635 aa  595  1e-169  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00500732  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0363  threonyl-tRNA synthetase  44.57 
 
 
648 aa  598  1e-169  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0255987  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0424  threonyl-tRNA synthetase  44.63 
 
 
644 aa  592  1e-168  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000699319  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0123  threonyl-tRNA synthetase  43.83 
 
 
677 aa  590  1e-167  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0729429  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4736  threonyl-tRNA synthetase  44.58 
 
 
659 aa  590  1e-167  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.556159 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0167  threonyl-tRNA synthetase  44.88 
 
 
657 aa  591  1e-167  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2614  threonyl-tRNA synthetase  45.54 
 
 
644 aa  586  1e-166  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0043  threonyl-tRNA synthetase  44.46 
 
 
649 aa  587  1e-166  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2639  threonyl-tRNA synthetase  45.95 
 
 
644 aa  588  1e-166  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.3159  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0768  threonyl-tRNA synthetase  43.96 
 
 
641 aa  586  1e-166  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.67512  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0176  threonyl-tRNA synthetase  45.37 
 
 
657 aa  585  1e-166  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2243  threonyl-tRNA synthetase  45.54 
 
 
644 aa  586  1e-166  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00594301  hitchhiker  0.00373508 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1221  threonyl-tRNA synthetase  45.31 
 
 
647 aa  582  1.0000000000000001e-165  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.001104  hitchhiker  0.00620187 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0662  threonyl-tRNA synthetase  44.94 
 
 
652 aa  583  1.0000000000000001e-165  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0172  threonyl-tRNA synthetase  43.54 
 
 
659 aa  580  1e-164  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0156  threonyl-tRNA synthetase  43.91 
 
 
657 aa  579  1e-164  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2003  threonyl-tRNA synthetase  44.69 
 
 
635 aa  581  1e-164  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00562927  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0707  threonyl-tRNA synthetase  47.74 
 
 
644 aa  578  1e-164  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00542671  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1160  threonyl-tRNA synthetase  44.01 
 
 
635 aa  580  1e-164  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.139321  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1906  threonyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 
641 aa  580  1e-164  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2854  threonyl-tRNA synthetase  43.55 
 
 
635 aa  576  1.0000000000000001e-163  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0336987 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1779  threonyl-tRNA synthetase  45.28 
 
 
635 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420901  normal  0.799245 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2219  threonyl-tRNA synthetase  45.09 
 
 
647 aa  575  1.0000000000000001e-163  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0771332 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1715  threonyl-tRNA synthetase  43.74 
 
 
657 aa  576  1.0000000000000001e-163  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0835  threonyl-tRNA synthetase  47.13 
 
 
640 aa  578  1.0000000000000001e-163  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0121  threonyl-tRNA synthetase  47.77 
 
 
596 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1399  threonyl-tRNA synthetase  45.05 
 
 
635 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00532167  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1359  threonyl-tRNA synthetase  45.21 
 
 
635 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1452  threonyl-tRNA synthetase  44.97 
 
 
635 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0192845  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1096  threonyl-tRNA synthetase  43.91 
 
 
635 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.869704  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1712  threonyl-tRNA synthetase  43.91 
 
 
635 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.713127  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2595  threonyl-tRNA synthetase  43.91 
 
 
635 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2756  threonyl-tRNA synthetase  44.77 
 
 
635 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.323332  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1371  threonyl-tRNA synthetase  44.62 
 
 
635 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1539  threonyl-tRNA synthetase  43.91 
 
 
635 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0963  threonyl-tRNA synthetase  43.91 
 
 
635 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0747512  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1475  threonyl-tRNA synthetase  44.97 
 
 
635 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0274744  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>