More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0176 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0992  threonyl-tRNA synthetase  50.46 
 
 		 653 aa  672    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3742  threonyl-tRNA synthetase  52.47 
 
 		 646 aa  716    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.190527  hitchhiker  0.00137888 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0559  threonyl-tRNA synthetase  52.09 
 
 		 644 aa  694    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00454252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1221  threonyl-tRNA synthetase  51.78 
 
 		 647 aa  693    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.001104  hitchhiker  0.00620187 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0156  threonyl-tRNA synthetase  82.04 
 
 		 657 aa  1157    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0172  threonyl-tRNA synthetase  74.66 
 
 		 659 aa  1059    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0123  threonyl-tRNA synthetase  79.15 
 
 		 677 aa  1115    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0729429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0024  threonyl-tRNA synthetase  50.54 
 
 		 648 aa  665    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1715  threonyl-tRNA synthetase  83.69 
 
 		 657 aa  1165    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0167  threonyl-tRNA synthetase  75.8 
 
 		 657 aa  1071    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0623  threonyl-tRNA synthetase  56.84 
 
 		 662 aa  797    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0992  threonyl-tRNA synthetase  49.85 
 
 		 647 aa  653    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1507  threonyl-tRNA synthetase  51.2 
 
 		 649 aa  652    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.266157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1906  threonyl-tRNA synthetase  54.18 
 
 		 641 aa  724    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2219  threonyl-tRNA synthetase  53.18 
 
 		 647 aa  724    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0771332 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1643  threonyl-tRNA synthetase  53.41 
 
 		 645 aa  731    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.193799  normal  0.0776011 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00815  threonyl-tRNA synthetase  51.86 
 
 		 648 aa  687    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.270847  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0176  threonyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 657 aa  1356    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2501  threonyl-tRNA synthetase  80.82 
 
 		 675 aa  1137    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2661  threonyl-tRNA synthetase  48.68 
 
 		 644 aa  632  1e-180  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000386283  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1612  threonyl-tRNA synthetase  47.77 
 
 		 635 aa  619  1e-176  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000178172  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0797  threonyl-tRNA synthetase  49.36 
 
 		 652 aa  617  1e-175  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2628  threonyl-tRNA synthetase  49.92 
 
 		 645 aa  615  1e-175  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000255721  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2401  threonyl-tRNA synthetase  48.92 
 
 		 634 aa  615  1e-175  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.162517  normal  0.284009 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2230  threonyl-tRNA synthetase  50.81 
 
 		 636 aa  616  1e-175  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00712554 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0185  threonyl-tRNA synthetase  49.23 
 
 		 639 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000179764  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0912  threonyl-tRNA synthetase  47.6 
 
 		 638 aa  615  9.999999999999999e-175  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1990  threonyl-tRNA synthetase  50.65 
 
 		 636 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0457996  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1759  threonyl-tRNA synthetase  47.75 
 
 		 633 aa  610  1e-173  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000991077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2175  threonyl-tRNA synthetase  45.29 
 
 		 648 aa  607  9.999999999999999e-173  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1228  threonyl-tRNA synthetase  48 
 
 		 635 aa  605  9.999999999999999e-173  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000338672  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1384  threonyl-tRNA synthetase  47.47 
 
 		 635 aa  603  1.0000000000000001e-171  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000717334  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1411  threonyl-tRNA synthetase  49.03 
 
 		 645 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000074774  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2606  threonyl-tRNA synthetase  49.66 
 
 		 604 aa  603  1.0000000000000001e-171  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0580419 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1300  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  45.15 
 
 		 639 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3262  threonyl-tRNA synthetase  46.12 
 
 		 643 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00002753  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1246  threonyl-tRNA synthetase  46.6 
 
 		 645 aa  600  1e-170  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.1161  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4472  threonyl-tRNA synthetase  46.44 
 
 		 645 aa  600  1e-170  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.419718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4307  threonyl-tRNA synthetase  46.44 
 
 		 645 aa  600  1e-170  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00228432  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4318  threonyl-tRNA synthetase  46.44 
 
 		 645 aa  600  1e-170  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0311311  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1774  threonyl-tRNA synthetase  45.5 
 
 		 645 aa  598  1e-170  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4820  threonyl-tRNA synthetase  46.44 
 
 		 645 aa  600  1e-170  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00851939  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1383  threonyl-tRNA synthetase  50.52 
 
 		 608 aa  599  1e-170  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.520119 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0108  threonyl-tRNA synthetase  47.65 
 
 		 643 aa  599  1e-170  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1457  threonyl-tRNA synthetase  49.83 
 
 		 608 aa  601  1e-170  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4407  threonyl-tRNA synthetase  46.44 
 
 		 645 aa  598  1e-170  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00383919  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1740  threonyl-tRNA synthetase  45.5 
 
 		 645 aa  598  1e-170  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0523763  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4691  threonyl-tRNA synthetase  46.44 
 
 		 645 aa  600  1e-170  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.88699e-59 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1515  threonyl-tRNA synthetase  49.76 
 
 		 636 aa  595  1e-169  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00436769  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4707  threonyl-tRNA synthetase  46.28 
 
 		 645 aa  598  1e-169  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000334194  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1418  threonyl-tRNA synthetase  48.09 
 
 		 638 aa  597  1e-169  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000102997  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4685  threonyl-tRNA synthetase  46.28 
 
 		 645 aa  598  1e-169  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00204863  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4701  threonyl-tRNA synthetase  46.13 
 
 		 645 aa  597  1e-169  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000566692  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0552  threonyl-tRNA synthetase  46.28 
 
 		 645 aa  598  1e-169  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000171694  unclonable  1.90469e-25 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1732  threonyl-tRNA synthetase  49.58 
 
 		 630 aa  598  1e-169  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0801  threonyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 		 647 aa  593  1e-168  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00121365  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2483  threonyl-tRNA synthetase  46.62 
 
 		 637 aa  595  1e-168  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0764303  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0387  threonyl-tRNA synthetase  49.4 
 
 		 610 aa  592  1e-168  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.677095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2850  threonyl-tRNA synthetase  50.34 
 
 		 604 aa  593  1e-168  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0185982  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1450  threonyl-tRNA synthetase  46.27 
 
 		 643 aa  589  1e-167  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2243  threonyl-tRNA synthetase  46.39 
 
 		 644 aa  591  1e-167  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00594301  hitchhiker  0.00373508 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2057  threonyl-tRNA synthetase  46.31 
 
 		 634 aa  590  1e-167  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000136416  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4736  threonyl-tRNA synthetase  46.49 
 
 		 659 aa  591  1e-167  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.556159 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2614  threonyl-tRNA synthetase  46.39 
 
 		 644 aa  591  1e-167  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1869  threonyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 646 aa  586  1e-166  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.130621  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05580  Threonyl-tRNA synthetase  45.37 
 
 		 646 aa  585  1e-166  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000588041  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2787  threonyl-tRNA synthetase  49.65 
 
 		 615 aa  587  1e-166  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1140  threonyl-tRNA synthetase  45.79 
 
 		 644 aa  585  1e-166  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000099925  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1192  threonyl-tRNA synthetase  45.51 
 
 		 652 aa  585  1e-166  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4204  threonyl-tRNA synthetase  43.85 
 
 		 736 aa  588  1e-166  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1089  threonyl-tRNA synthetase  46.14 
 
 		 635 aa  585  1e-166  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00500732  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0121  threonyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 596 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1669  threonyl-tRNA synthetase  47.13 
 
 		 637 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000137846  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0982  threonyl-tRNA synthetase  45.3 
 
 		 652 aa  584  1.0000000000000001e-165  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0768948  normal  0.105086 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2145  threonyl-tRNA synthetase  45.37 
 
 		 639 aa  578  1e-164  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2222  threonyl-tRNA synthetase  45.37 
 
 		 639 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2489  threonyl-tRNA synthetase  45.52 
 
 		 639 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.952507  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2388  threonyl-tRNA synthetase  45.37 
 
 		 639 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2308  threonyl-tRNA synthetase  47.99 
 
 		 636 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304156  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2405  threonyl-tRNA synthetase  45.01 
 
 		 639 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0711  threonyl-tRNA synthetase  43.38 
 
 		 647 aa  573  1.0000000000000001e-162  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2161  threonyl-tRNA synthetase  45.01 
 
 		 639 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.820955  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0613  threonyl-tRNA synthetase  43.69 
 
 		 648 aa  573  1.0000000000000001e-162  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2841  threonyl-tRNA synthetase  48.97 
 
 		 606 aa  574  1.0000000000000001e-162  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0723  threonyl-tRNA synthetase  47.07 
 
 		 631 aa  569  1e-161  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000476694  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2354  threonyl-tRNA synthetase  46.15 
 
 		 640 aa  568  1e-161  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1664  threonyl-tRNA synthetase  44.63 
 
 		 640 aa  569  1e-161  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000605435  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0363  threonyl-tRNA synthetase  44.07 
 
 		 648 aa  572  1e-161  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0255987  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2419  threonyl-tRNA synthetase  46.41 
 
 		 640 aa  567  1e-160  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0427  threonyl-tRNA synthetase  44.34 
 
 		 640 aa  565  1e-160  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0436469  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1824  threonyl-tRNA synthetase  44.84 
 
 		 636 aa  565  1e-160  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000392835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3487  threonyl-tRNA synthetase  45.1 
 
 		 643 aa  567  1e-160  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2668  threonyl-tRNA synthetase  45.11 
 
 		 652 aa  567  1e-160  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.107403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2973  threonyl-tRNA synthetase  46.47 
 
 		 640 aa  568  1e-160  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.617243 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0731  threonyl-tRNA synthetase  49.66 
 
 		 607 aa  568  1e-160  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0760  threonyl-tRNA synthetase  49.66 
 
 		 607 aa  568  1e-160  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.281808  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0693  threonyl-tRNA synthetase  44.19 
 
 		 638 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.287981  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2193  threonyl-tRNA synthetase  44.6 
 
 		 639 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1767  threonyl-tRNA synthetase  45.3 
 
 		 640 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.143728  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0768  threonyl-tRNA synthetase  44.48 
 
 		 641 aa  564  1.0000000000000001e-159  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.67512  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>