More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1246 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_1774  threonyl-tRNA synthetase  89.61 
 
 		 645 aa  1221    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1246  threonyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 645 aa  1334    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.1161  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2175  threonyl-tRNA synthetase  58.48 
 
 		 648 aa  771    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2419  threonyl-tRNA synthetase  51.8 
 
 		 640 aa  669    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4707  threonyl-tRNA synthetase  70.3 
 
 		 645 aa  941    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000334194  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0711  threonyl-tRNA synthetase  65.78 
 
 		 647 aa  894    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4691  threonyl-tRNA synthetase  70.46 
 
 		 645 aa  944    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.88699e-59 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0121  threonyl-tRNA synthetase  54.96 
 
 		 596 aa  674    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2222  threonyl-tRNA synthetase  51.25 
 
 		 639 aa  666    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4472  threonyl-tRNA synthetase  70.46 
 
 		 645 aa  944    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.419718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2161  threonyl-tRNA synthetase  50.93 
 
 		 639 aa  665    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.820955  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4307  threonyl-tRNA synthetase  70.46 
 
 		 645 aa  944    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00228432  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2145  threonyl-tRNA synthetase  51.25 
 
 		 639 aa  666    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4318  threonyl-tRNA synthetase  70.46 
 
 		 645 aa  944    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0311311  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2489  threonyl-tRNA synthetase  51.25 
 
 		 639 aa  667    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.952507  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2661  threonyl-tRNA synthetase  70.42 
 
 		 644 aa  950    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000386283  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2973  threonyl-tRNA synthetase  50.39 
 
 		 640 aa  659    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.617243 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1863  threonyl-tRNA synthetase / Ser-tRNA(Thr) hydrolase  53.57 
 
 		 601 aa  640    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3262  threonyl-tRNA synthetase  70.68 
 
 		 643 aa  948    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00002753  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0797  threonyl-tRNA synthetase  71.58 
 
 		 652 aa  961    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2388  threonyl-tRNA synthetase  51.25 
 
 		 639 aa  666    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4820  threonyl-tRNA synthetase  70.46 
 
 		 645 aa  944    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00851939  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2354  threonyl-tRNA synthetase  50.86 
 
 		 640 aa  665    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2405  threonyl-tRNA synthetase  50.93 
 
 		 639 aa  665    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4701  threonyl-tRNA synthetase  70.3 
 
 		 645 aa  940    Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000566692  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1767  threonyl-tRNA synthetase  50.23 
 
 		 640 aa  652    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.143728  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0623  threonyl-tRNA synthetase  49.77 
 
 		 662 aa  666    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1740  threonyl-tRNA synthetase  89.61 
 
 		 645 aa  1221    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0523763  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05580  Threonyl-tRNA synthetase  50.77 
 
 		 646 aa  663    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000588041  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2193  threonyl-tRNA synthetase  50.47 
 
 		 639 aa  663    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4685  threonyl-tRNA synthetase  70.3 
 
 		 645 aa  941    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00204863  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4407  threonyl-tRNA synthetase  70.14 
 
 		 645 aa  939    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00383919  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2181  threonyl-tRNA synthetase  62.12 
 
 		 646 aa  826    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0460  threonyl-tRNA synthetase / Ser-tRNA(Thr) hydrolase  56.69 
 
 		 663 aa  747    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0696284  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1415  threonyl-tRNA synthetase  55.8 
 
 		 643 aa  733    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000260393 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0662  threonyl-tRNA synthetase  57.14 
 
 		 652 aa  788    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0613  threonyl-tRNA synthetase  64.74 
 
 		 648 aa  880    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0552  threonyl-tRNA synthetase  70.46 
 
 		 645 aa  942    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000171694  unclonable  1.90469e-25 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3742  threonyl-tRNA synthetase  47.36 
 
 		 646 aa  628  1e-179  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.190527  hitchhiker  0.00137888 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1300  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  49.04 
 
 		 639 aa  629  1e-179  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0801  threonyl-tRNA synthetase  49.68 
 
 		 647 aa  631  1e-179  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00121365  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1643  threonyl-tRNA synthetase  47.81 
 
 		 645 aa  631  1e-179  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.193799  normal  0.0776011 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1906  threonyl-tRNA synthetase  47.2 
 
 		 641 aa  625  1e-178  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1228  threonyl-tRNA synthetase  47.12 
 
 		 635 aa  622  1e-177  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000338672  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0559  threonyl-tRNA synthetase  47.37 
 
 		 644 aa  622  1e-177  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00454252 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0912  threonyl-tRNA synthetase  47.27 
 
 		 638 aa  621  1e-176  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0363  threonyl-tRNA synthetase  48.12 
 
 		 648 aa  620  1e-176  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0255987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2219  threonyl-tRNA synthetase  47.95 
 
 		 647 aa  618  1e-175  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0771332 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1507  threonyl-tRNA synthetase  47.69 
 
 		 649 aa  614  9.999999999999999e-175  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.266157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0108  threonyl-tRNA synthetase  47.84 
 
 		 643 aa  609  1e-173  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0185  threonyl-tRNA synthetase  47.2 
 
 		 639 aa  608  9.999999999999999e-173  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000179764  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0189  threonyl-tRNA synthetase  46.27 
 
 		 640 aa  608  9.999999999999999e-173  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114049  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0626  threonyl-tRNA synthetase  49.22 
 
 		 580 aa  605  9.999999999999999e-173  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1192  threonyl-tRNA synthetase  48.19 
 
 		 652 aa  607  9.999999999999999e-173  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0123  threonyl-tRNA synthetase  45.34 
 
 		 677 aa  605  1.0000000000000001e-171  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0729429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1327  threonyl-tRNA synthetase  48.58 
 
 		 636 aa  604  1.0000000000000001e-171  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0393085  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1221  threonyl-tRNA synthetase  47.16 
 
 		 647 aa  603  1.0000000000000001e-171  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.001104  hitchhiker  0.00620187 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0187  threonyl-tRNA synthetase  45.81 
 
 		 640 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00194489  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0172  threonyl-tRNA synthetase  44.31 
 
 		 659 aa  600  1e-170  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1140  threonyl-tRNA synthetase  46.48 
 
 		 644 aa  600  1e-170  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000099925  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1418  threonyl-tRNA synthetase  48.37 
 
 		 638 aa  601  1e-170  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000102997  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0176  threonyl-tRNA synthetase  46.6 
 
 		 657 aa  600  1e-170  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0992  threonyl-tRNA synthetase  49.44 
 
 		 653 aa  597  1e-169  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0725  threonyl-tRNA synthetase  47.35 
 
 		 638 aa  595  1e-169  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2401  threonyl-tRNA synthetase  46.42 
 
 		 634 aa  595  1e-169  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.162517  normal  0.284009 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1450  threonyl-tRNA synthetase  46.7 
 
 		 643 aa  595  1e-169  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0167  threonyl-tRNA synthetase  44.53 
 
 		 657 aa  597  1e-169  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1373  threonyl-tRNA synthetase  45.41 
 
 		 645 aa  593  1e-168  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000340223  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1715  threonyl-tRNA synthetase  45.03 
 
 		 657 aa  592  1e-168  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1411  threonyl-tRNA synthetase  46.11 
 
 		 645 aa  592  1e-168  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000074774  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1612  threonyl-tRNA synthetase  46.18 
 
 		 635 aa  593  1e-168  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000178172  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00815  threonyl-tRNA synthetase  47.66 
 
 		 648 aa  592  1e-168  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.270847  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2308  threonyl-tRNA synthetase  46.57 
 
 		 636 aa  595  1e-168  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304156  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0982  threonyl-tRNA synthetase  45.26 
 
 		 652 aa  588  1e-167  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0768948  normal  0.105086 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2230  threonyl-tRNA synthetase  46.26 
 
 		 636 aa  588  1e-167  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00712554 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2628  threonyl-tRNA synthetase  47.2 
 
 		 645 aa  590  1e-167  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000255721  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4736  threonyl-tRNA synthetase  45.65 
 
 		 659 aa  590  1e-167  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.556159 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2501  threonyl-tRNA synthetase  44.36 
 
 		 675 aa  590  1e-167  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1372  threonyl-tRNA synthetase  46.18 
 
 		 635 aa  587  1e-166  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000383369  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1384  threonyl-tRNA synthetase  45.23 
 
 		 635 aa  585  1e-166  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000717334  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2057  threonyl-tRNA synthetase  46.95 
 
 		 634 aa  588  1e-166  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000136416  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1669  threonyl-tRNA synthetase  46.32 
 
 		 637 aa  587  1e-166  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000137846  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1515  threonyl-tRNA synthetase  45.48 
 
 		 636 aa  584  1.0000000000000001e-165  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00436769  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1990  threonyl-tRNA synthetase  45.95 
 
 		 636 aa  584  1.0000000000000001e-165  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0457996  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2631  threonyl-tRNA synthetase  44.67 
 
 		 643 aa  584  1.0000000000000001e-165  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2317  threonyl-tRNA synthetase  44.67 
 
 		 643 aa  585  1.0000000000000001e-165  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2243  threonyl-tRNA synthetase  46.83 
 
 		 644 aa  582  1e-164  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00594301  hitchhiker  0.00373508 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2614  threonyl-tRNA synthetase  46.83 
 
 		 644 aa  582  1e-164  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0392  threonyl-tRNA synthetase  46.11 
 
 		 633 aa  582  1e-164  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0156  threonyl-tRNA synthetase  44.48 
 
 		 657 aa  577  1.0000000000000001e-163  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1759  threonyl-tRNA synthetase  44.83 
 
 		 633 aa  575  1.0000000000000001e-163  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000991077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1907  threonyl-tRNA synthetase  46.94 
 
 		 637 aa  573  1.0000000000000001e-162  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000167344 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0024  threonyl-tRNA synthetase  45.4 
 
 		 648 aa  573  1.0000000000000001e-162  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2756  threonyl-tRNA synthetase  44.37 
 
 		 635 aa  570  1e-161  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.323332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0992  threonyl-tRNA synthetase  45.38 
 
 		 647 aa  570  1e-161  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0006  threonyl-tRNA synthetase  45.79 
 
 		 633 aa  571  1e-161  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.999215  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1869  threonyl-tRNA synthetase  46.51 
 
 		 646 aa  570  1e-161  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.130621  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1089  threonyl-tRNA synthetase  44.29 
 
 		 635 aa  571  1e-161  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00500732  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02079  threonyl-tRNA synthetase  44.24 
 
 		 642 aa  567  1e-160  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1371  threonyl-tRNA synthetase  44.22 
 
 		 635 aa  566  1e-160  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>