More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0626 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011374  UUR10_0626  threonyl-tRNA synthetase  100 
 
 
580 aa  1199    Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0797  threonyl-tRNA synthetase  49.48 
 
 
652 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1740  threonyl-tRNA synthetase  49.74 
 
 
645 aa  612  9.999999999999999e-175  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0523763  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1774  threonyl-tRNA synthetase  49.74 
 
 
645 aa  612  9.999999999999999e-175  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1246  threonyl-tRNA synthetase  49.22 
 
 
645 aa  605  9.999999999999999e-173  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.1161  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2661  threonyl-tRNA synthetase  49.56 
 
 
644 aa  607  9.999999999999999e-173  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000386283  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf704  threonyl-tRNA synthetase  50.95 
 
 
579 aa  594  1e-168  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0613  threonyl-tRNA synthetase  48.53 
 
 
648 aa  586  1e-166  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0711  threonyl-tRNA synthetase  47.64 
 
 
647 aa  579  1e-164  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3262  threonyl-tRNA synthetase  47.1 
 
 
643 aa  578  1e-164  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00002753  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4691  threonyl-tRNA synthetase  47.64 
 
 
645 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.88699e-59 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4707  threonyl-tRNA synthetase  47.64 
 
 
645 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000334194  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4472  threonyl-tRNA synthetase  47.64 
 
 
645 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.419718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4307  threonyl-tRNA synthetase  47.64 
 
 
645 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00228432  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4318  threonyl-tRNA synthetase  47.64 
 
 
645 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0311311  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4820  threonyl-tRNA synthetase  47.64 
 
 
645 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00851939  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0552  threonyl-tRNA synthetase  47.64 
 
 
645 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000171694  unclonable  1.90469e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4685  threonyl-tRNA synthetase  47.64 
 
 
645 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00204863  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4701  threonyl-tRNA synthetase  47.64 
 
 
645 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000566692  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4407  threonyl-tRNA synthetase  47.29 
 
 
645 aa  574  1.0000000000000001e-162  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00383919  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2175  threonyl-tRNA synthetase  46.09 
 
 
648 aa  565  1e-160  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0121  threonyl-tRNA synthetase  46.78 
 
 
596 aa  560  1e-158  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2181  threonyl-tRNA synthetase  45.1 
 
 
646 aa  531  1e-150  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl177  threonyl-tRNA synthetase  44.43 
 
 
644 aa  521  1e-146  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0623  threonyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 
662 aa  514  1e-144  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1415  threonyl-tRNA synthetase  43.88 
 
 
643 aa  506  9.999999999999999e-143  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000260393 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0662  threonyl-tRNA synthetase  43.38 
 
 
652 aa  505  9.999999999999999e-143  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05580  Threonyl-tRNA synthetase  43.3 
 
 
646 aa  501  1e-140  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000588041  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2354  threonyl-tRNA synthetase  42.16 
 
 
640 aa  496  1e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2419  threonyl-tRNA synthetase  42.58 
 
 
640 aa  496  1e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2161  threonyl-tRNA synthetase  42.16 
 
 
639 aa  496  1e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.820955  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2489  threonyl-tRNA synthetase  42.33 
 
 
639 aa  495  1e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.952507  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2405  threonyl-tRNA synthetase  42.16 
 
 
639 aa  496  1e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2219  threonyl-tRNA synthetase  41.33 
 
 
647 aa  496  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0771332 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2222  threonyl-tRNA synthetase  41.81 
 
 
639 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2388  threonyl-tRNA synthetase  41.81 
 
 
639 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0222  threonyl-tRNA synthetase  48.74 
 
 
639 aa  492  9.999999999999999e-139  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0460  threonyl-tRNA synthetase / Ser-tRNA(Thr) hydrolase  43.3 
 
 
663 aa  493  9.999999999999999e-139  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0696284  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0801  threonyl-tRNA synthetase  43.13 
 
 
647 aa  494  9.999999999999999e-139  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00121365  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1221  threonyl-tRNA synthetase  41.23 
 
 
647 aa  494  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.001104  hitchhiker  0.00620187 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2193  threonyl-tRNA synthetase  41.64 
 
 
639 aa  491  1e-137  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2973  threonyl-tRNA synthetase  41.99 
 
 
640 aa  491  1e-137  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.617243 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2145  threonyl-tRNA synthetase  41.81 
 
 
639 aa  491  1e-137  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0110  threonyl-tRNA synthetase  41.32 
 
 
595 aa  491  1e-137  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4736  threonyl-tRNA synthetase  40.97 
 
 
659 aa  490  1e-137  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.556159 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1643  threonyl-tRNA synthetase  39.93 
 
 
645 aa  490  1e-137  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.193799  normal  0.0776011 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0349  threonyl-tRNA synthetase  41.82 
 
 
595 aa  491  1e-137  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.129605  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0559  threonyl-tRNA synthetase  41.68 
 
 
644 aa  491  1e-137  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00454252 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0123  threonyl-tRNA synthetase  39.83 
 
 
677 aa  486  1e-136  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0729429  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1300  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  41.04 
 
 
639 aa  486  1e-136  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0681  threonyl-tRNA synthetase  41.78 
 
 
582 aa  482  1e-135  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000323411  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00815  threonyl-tRNA synthetase  42.73 
 
 
648 aa  485  1e-135  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.270847  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2850  threonyl-tRNA synthetase  40.97 
 
 
604 aa  482  1e-135  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0185982  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1767  threonyl-tRNA synthetase  41.54 
 
 
640 aa  484  1e-135  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.143728  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3742  threonyl-tRNA synthetase  40 
 
 
646 aa  479  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.190527  hitchhiker  0.00137888 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1373  threonyl-tRNA synthetase  42.19 
 
 
645 aa  480  1e-134  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000340223  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1906  threonyl-tRNA synthetase  39.4 
 
 
641 aa  479  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0172  threonyl-tRNA synthetase  39.14 
 
 
659 aa  481  1e-134  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0167  threonyl-tRNA synthetase  39.31 
 
 
657 aa  477  1e-133  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0108  threonyl-tRNA synthetase  42.04 
 
 
643 aa  476  1e-133  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2511  threonyl-tRNA synthetase  41.78 
 
 
594 aa  472  1e-132  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0678043  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0189  threonyl-tRNA synthetase  40.84 
 
 
640 aa  473  1e-132  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114049  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2787  threonyl-tRNA synthetase  40.79 
 
 
615 aa  472  1e-132  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100504  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2841  threonyl-tRNA synthetase  41.31 
 
 
606 aa  475  1e-132  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0731  threonyl-tRNA synthetase  41.65 
 
 
607 aa  475  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0187  threonyl-tRNA synthetase  40.84 
 
 
640 aa  472  1e-132  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00194489  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2631  threonyl-tRNA synthetase  42.58 
 
 
643 aa  474  1e-132  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2317  threonyl-tRNA synthetase  42.61 
 
 
643 aa  474  1e-132  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_659  threonyl-tRNA synthetase (thrS)  41.43 
 
 
582 aa  473  1e-132  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000328118  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2501  threonyl-tRNA synthetase  39.48 
 
 
675 aa  474  1e-132  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0760  threonyl-tRNA synthetase  41.65 
 
 
607 aa  475  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.281808  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0753  threonyl-tRNA synthetase  41.08 
 
 
582 aa  472  1.0000000000000001e-131  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.105849  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0992  threonyl-tRNA synthetase  41.33 
 
 
653 aa  471  1.0000000000000001e-131  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0387  threonyl-tRNA synthetase  40.34 
 
 
610 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.677095  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1383  threonyl-tRNA synthetase  41.31 
 
 
608 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.520119 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1327  threonyl-tRNA synthetase  42.63 
 
 
636 aa  467  9.999999999999999e-131  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0393085  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2606  threonyl-tRNA synthetase  40.07 
 
 
604 aa  466  9.999999999999999e-131  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0580419 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1450  threonyl-tRNA synthetase  39.3 
 
 
643 aa  466  9.999999999999999e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0156  threonyl-tRNA synthetase  38.58 
 
 
657 aa  464  1e-129  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1384  threonyl-tRNA synthetase  40.24 
 
 
635 aa  458  9.999999999999999e-129  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000717334  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0024  threonyl-tRNA synthetase  40.56 
 
 
648 aa  461  9.999999999999999e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0912  threonyl-tRNA synthetase  38.54 
 
 
638 aa  460  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2230  threonyl-tRNA synthetase  39.48 
 
 
636 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00712554 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0185  threonyl-tRNA synthetase  40.55 
 
 
639 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000179764  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1140  threonyl-tRNA synthetase  40.03 
 
 
644 aa  461  9.999999999999999e-129  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000099925  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0176  threonyl-tRNA synthetase  38.62 
 
 
657 aa  459  9.999999999999999e-129  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1715  threonyl-tRNA synthetase  37.69 
 
 
657 aa  461  9.999999999999999e-129  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2628  threonyl-tRNA synthetase  38.92 
 
 
645 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000255721  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1612  threonyl-tRNA synthetase  41.01 
 
 
635 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000178172  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1507  threonyl-tRNA synthetase  38.12 
 
 
649 aa  459  9.999999999999999e-129  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.266157  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1457  threonyl-tRNA synthetase  40.62 
 
 
608 aa  459  9.999999999999999e-129  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1669  threonyl-tRNA synthetase  40.38 
 
 
637 aa  461  9.999999999999999e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000137846  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0725  threonyl-tRNA synthetase  40.7 
 
 
638 aa  456  1e-127  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1411  threonyl-tRNA synthetase  38.09 
 
 
645 aa  457  1e-127  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000074774  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1990  threonyl-tRNA synthetase  39.13 
 
 
636 aa  458  1e-127  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0457996  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1863  threonyl-tRNA synthetase / Ser-tRNA(Thr) hydrolase  41.54 
 
 
601 aa  458  1e-127  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1869  threonyl-tRNA synthetase  39.83 
 
 
646 aa  456  1e-127  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.130621  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0992  threonyl-tRNA synthetase  40.88 
 
 
647 aa  458  1e-127  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1228  threonyl-tRNA synthetase  40.42 
 
 
635 aa  454  1.0000000000000001e-126  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000338672  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2997  threonyl-tRNA synthetase  39.4 
 
 
644 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>